Page INTRODUCTION

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PLAN
INTRODUCTION ......................................................................................... 1
GENERALITES SUR LES ANTIBIOTIQUES ......................................... 3
HISTORIQUE .............................................................................................. 3
I- DEFINITION. ............................................................................................ 4
II- CLASSIFICATION ................................................................................. 6
II-1- LES ANTIBIOTIQUES INHIBITEURS DE LA SYNTHESE DU
PEPTIDOGLYCANE ............................................................. 6
II-1-1- Fosfomycine ou Phosphonomycine ............................... 6
II-1-2- Cyclosérine ...................................................................... 6
II-1-3- Bacitracine....................................................................... 6
II-1-4- Vancomycine, Ristocétine, Teicoplanine ....................... 6
II-1-5- β-lactamines .................................................................... 7
II-2 - LES ANTIBIOTIQUES ACTIFS SUR LES ENVELOPPES ......
MEMBRANAIRES................................................................................. 14
II-1-1- Polymyxines .................................................................... 14
II-1-2- Gramicidines et tyrocidine .............................................. 14
II-3- LES ANTIBIOTIQUES INHIBITEURS DES SYNTHESES ......
PROTEIQUES ........................................................................................ 15
II-3-1- Les aminosides ................................................................ 15
II-3-2- Macrolides, lincosamides, Streptogramines : (MLS). .... 16
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II-3-3-Tétracyclines .................................................................... 16
II-3-4- Chloramphénicol. ............................................................ 17
II-3-5- Acide fusidique. .............................................................. 17
II-4- LES ANTIBIOTIQUES INHIBITEURS DES ACIDES ..............
NUCLEIQUES ........................................................................................ 17
II-4-1- Rifamycines ..................................................................... 17
II-4-2- Quinolones ...................................................................... 18
II-4-3- Novobiocine .................................................................... 18
II-4-4- Les 5-nitro-imidazolés .................................................... 18
II-4-5- Nitrofuranes .................................................................... 19
II-5 - LES ANTIBIOTIQUES INHIBITEURS DE LA SYNTHESE ...
PROTEIQUE DES FOLATES ............................................................... 19
II-5-1- Sulfamides ....................................................................... 19
II-5-2- Les 2-4 diaminopyrimidines ........................................... 19
II-5-3- Associations sulfamides - diaminopyrimidines .............. 20
II-5-4- Autres antifoliques .......................................................... 20
II-6- ANTIBIOTIQUES ANTITUBERCULEUX .................................. 20
III- MODE D’ACTION DES ANTIBIOTIQUES...................................... 21
III-1- LES ANTIBIOTIQUES INHIBITEURS DE LA SYNTHESE DU
PEPTIDOGLYCANE. .......................................................................... 21
III-2 - LES ANTIBIOTIQUES ACTIFS SUR LES ENVELOPPES ....
MEMBRANAIRES................................................................................. 22
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III-3- LES ANTIBIOTIQUES INHIBITEURS DE lA SYNTHESE ....
PROTEIQUE ........................................................................................... 23
III-3-1- Les Aminosides. ......................................................................... 23
III-3-2 Les tétracyclines -........................................................................ 23
III-3-3- Les macrolides, lincosamides, streptogramines ........................ 24
III-3-4- Le chloramphénicol. .................................................................. 25
III-4- LES ANTIBIOTIQUES INHIBITEURS DES ACIDES
NUCLEIQUES ........................................................................................ 25
III-4-1- Rifamycines................................................................................ 25
III-4-2- Quinolones ................................................................................. 25
III-5- LES ANTIBIOTIQUES INHIBITEURS DE LA SYNTHESE DES
FOLATES ............................................................................................... 26
III-6- AUTRES PRODUITS DOUES D’UNE ACTIVITE
ANTIBACTERIENNE PARTICULIERE .............................................. 26
III-6-1- Les Imidazolés ........................................................................... 26
III-6-2- Les antituberculeux .................................................................... 26
IV- DEFINITION DE LA RESISTANCE BACTERIENNE ................... 28
IV-1- RESISTANCE NATURELLE. ..................................................... 28
IV-2- RESISTANCE ACQUISE ............................................................ 29
IV-3- RESISTANCE CLINIQUE. .......................................................... 35
IV-4- SUPPORT GENETIQUE DE LA RESISTANCE........................ 35
IV-5- PHENOTYPE DE RESISTANCE ................................................ 36
V- MECANISMES DE LA RESISTANCE. ............................................... 37
V-1- FACTEURS ENVIRONNEMENTAUX ....................................... 37
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V-2- BY-PASS. ....................................................................................... 38
V-3 EFFLUX ACTIF. ............................................................................. 38
V-4- REDUCTION DE LA FIXATION DE L'ANTIBIOTIQUE A LA
CIBLE.............................................................................................................. 39
V-5- INFLUX ET EFFLUX DES ANTIBIOTIQUES A L’INTERIEUR DE
LA CELLULE BACTERIENNE. ................................................................... 42
V-6- PERSITANCE DES BACTERIES................................................. 42
V-7 -SOURCE DES SOUCHES RESISTANTES. ................................ 43
VI- MECANISMES DE RESISTANCE AUX DIFFERENTS
ANTIBIOTIQUES ........................................................................................ 44
VI-1- RESISTANCE AUX β-LACTAMINES . ..................................... 44
VI-1-1- Diminution de la perméabilité ......................................... 44
VI-1-2- Résistance par production par la bactérie d'enzymes .....
inactivant l'antibiotique. ............................................................... 44
VI-1-3- Absence ou modification de la proteine cible. ................ 53
VI-1-4- Tolérance bactérienne...................................................... 55
VI-2- RESISTANCE AUX AMINOSIDES ........................................... 56
VI-2-1- Résistance naturelle ........................................................... 56
VI-2-2- Résistance acquise ............................................................. 57
VI-2-3- Haut niveau de résistance aux aminosides (HNR) ............ 59
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VI-3- RESISTANCE AUX MACROLIDES, LINCOSAMIDES,
STREPTOGRAMINES .................................................................................. 60
VI-3-1- Résistance acquise ......................................................... 60
VI-4- Résistance aux quinolones ............................................................ 61
VI-5- RESISTANCE AUX TETRACYCLINES .................................. .62
VI-6- RESISTANCE AUX PHENICOLES (16). ................................... 62
VI-7- RESISTANCE VIS A VIS DES SULFAMIDES ET DU ...........
TRIMETHOPRIME ................................................................................ 63
VI-7-1- Résistance naturelle : ...................................................... 63
VI-7-2- Résistance acquise : ......................................................... 64
VI-8- Résistance à la vancomycine ........................................................ 65
VI-9- METHICILLINORESISTANCE (OU OXACILLINE ET
DERIVES) ................................................................................. 65
VII- DISSEMINATION DE LA RESISTANCE ....................................... 67
VII-1- DISSEMINATION DE LA RESISTANCE PAR MUTATION . 67
VII-2- DISSEMINATION DE LA RESISTANCE DUE A
L'UTILISATION ............................................................................................
DES GENES DE RESISTANCE ........................................................... 67
VII-2-1- Gènes plasmidiques...................................................... 67
VII-2-2- Transposons.................................................................. 68
VIII- EVOLUTION DE LA RESISTANCE EN MEDECINE ................. 69
IX- L'ASSOCIATION D'ANTIBIOTIQUES............................................. 70
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IX-1- INDICATIONS ACTUELLES DES ASSOCIATIONS............... 70
IX-1-1- Elargir le spectre antibactérien ..................................... 70
IX-1-2- Obtenir un effet synergique pour renforcer la
bactéricidie.70
IX-1-3 - Prévenir l'émergence de mutants résistants.................. 71
IX-2- COMMENT ASSOCIER LES ANTIBIOTIQUES ..................... 73
X- DEFINITION DES INTERACTIONS .................................................. 75
XI- SURVEILLANCE DU TRAITEMENT .......................................... 76
XI-1- ETUDE DE L'ACTIVITE BACTERICIDE DU SERUM............ 76
XI-2- SURVEILLANCE DES SIGNES CLINIQUES LOCAUX ET ..
GENERAUX....................................................................... 76
XI-3- LE DOSAGE DES ANTIBIOTIQUES IN-VIVO. ....................... 76
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MATERIEL ET METHODE
I- MATERIEL ............................................................................................... 77
I-1- LES SOUCHES BACTERIENNES. ............................................... 77
I-2- MATERIEL POUR L'ANTIBIOGRAMME EN MILIEU
GELOSE. ................................................................................ 77
I-3- MATERIEL POUR LA DETECTION DE LA β-LACTAMASE A
SPECTRE ETROIT ................................................................ 80
I-3-1- Méthode iodométrique ..................................................... 80
I-3-2- Méthode à la céphalosporine chromogène....................... 80
I-4- Matériel pour la détection de la b-lactamase à spectre élargi ......... 80
I-5- MATERIEL POUR LA RECHERCHE DE LA .............................
METHICILLINORESISTANCE ............................................................ 81
II- METHODES ........................................................................................... 82
II-1- ISOLEMENT ET IDENTIFICATION DES SOUCHES ............... 82
II-2- METHODES D’ETUDE DE LA SENSIBILITE AUX ................
ANTIBIOTIQUES .................................................................................. 82
II-2-1- Antibiogramme standard ................................................... 82
II-2-2- Détection de la b-lactamase à spectre étroit ..................... 84
II- 2-3- Détection de la b-lactamase à spectre élargi .................... 86
II-2-4- Détection de la méthicillinorésistance .............................. 87
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RESULTATS ET COMMENTAIRES
I- REPARTITION GLOBALE DES DIFFERENTES
ESPECES ISOLEES ..................................................................... 90
II- REPARTITION DES SOUCHES SELON LA NATURE DU PRODUIT
PATHOLOGIQUE ........................................................................... 91
II-1- REPARTITION DES ENTEROBACTERIES .......................... 91
I-2-2- Répartition des souches de Pseudomonaceae. ................... 92
I-2-3- Répartition des souches d’Haemophilus influenzae .......... 92
I-2-4- Répartition des Souches de Staphylocoques. ..................... 92
I-2-5- Répartition des souches de Streptocoques. ........................ 92
II- PROFIL ANTIBIOTIQUE DES SOUCHES BACTERIENNES
ISOLEES............................................................................................ .96
II-1- ENTEROBACTERIES. .............................................................. 96
II-1-1- Escherichia coli, , Citrobacter spp., Alkalescens dispar 97
II-1-2- Salmonella ....................................................................... 98
II-1-3- Klebsiella - Enterobacter. ............................................... 98
II-1-4- Proteus - Providencia - Morganella. .............................. 99
II-2- PSEUDOMONAS. .................................................................................. 100
II-2-1- Pseudomonas aeruginosa............................................................ 100
II-3- HAEMOPHILUS ............................................................................ 101
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II-4- STAPHYLOCOQUES. ................................................................... 102
II-4-1- Staphylococcus aureus.................................................... 102
II-4-2- Méthicillinorésistance et production de β-lactamases chez
les
staphylocoques................................................................ 103
II-5- STREPTOCOQUES. ...................................................................... 105
V- PHENOTYPES DE RESISTANCE DES ENTEROBACTERIES. .... 106
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DISCUSSION
I- LES STAPHYLOCOQUES ..................................................................... 108
I-1- LES STAPHYLOCOQUES COAGULASE NEGATIVE (SCN). .. 108
I-2- STAPHYLOCOCCUS AUREUS ...................................................... 109
II- STREPTOCOQUES ET ENTEROCOQUES ...................................... 114
II-1- LES STREPTOCOQUES DU GROUPE A ................................... 114
II-2- PNEUMOCOQUES........................................................................ 115
II-3- LES AUTRES STREPTOCOQUES. ............................................. 117
II-4- LES ENTEROCOQUES................................................................. 119
III- LES ENTEROBACTERIES ................................................................. 121
III-1- ESCHERICHIA COLI. .................................................................. 121
III-3- LES SALMONELLES. ................................................................. 125
III-2- KLEBSIELLES. ............................................................................ 129
III-2-1- Klebsiella pneumoniae .............................................. 130
VI- PSEUDOMONAS AERUGINOSA ......................................................... 127
CONCLUSION .............................................................................. ...............133
BIBLIOGRAPHIE......................................................................................137