Virus à ARN + : stratégie de réplication

Virus à ARN + : stratégie de réplication
Caractéristiques spécifiques
• polyprotéine
• protéase
• protéines non-structurales
Virus à ARN - : Organisation du génome
Rage
Rougeole
Oreillons
Virus de la stomatide vésiculaire (VSV)
Ebola
Marburg
Nucléocapside (N, NC, NP)
Enzymes structurales P,L
Nucléocapside
Matrice Enveloppe
Polymérase
glycoprotéine
3’ 5’
N
P
+
Transcription discontinue
ARNm sous-génomiques
M
G
Polymérase
L
5’
3’
Virus à ARN - : stratégie de la réplication
Membrane cellulaire
traduction
1°) dissociation de N de ARN
-
2°) transcription discontinue
ARNm
3°) traduction
modification
post-traductionelle
réplication: ARN-
4°) réplication : ARN+
Modification de la
fonction de la
réplicase
ARN-
traduction
morphogenèse
5°) traduction (massive)
morphogenèse
Virus à ARN - : stratégie de la réplication
Caractéristiques spécifiques
• enzymes structurales (polymérases)
• transcription discontinue
• protéine N
Rétrovirus : Organisation du génome
HIV
MLV
RSV
ARNm (+)
M
Protéase Intégrase
Transcriptase
C NC
inverse
Virus à ARN Enzymes structurales
Transcription : épissage alternatif
RNAm sous-génomiques
Virus à ARN +
Polyprotéine & Protéase
Gag-Pol
Vif
Vpr
Vpu, Env
Tat
Tev
Rev, Nef
Nef
Rétrovirus : stratégie de la réplication
Membrane cellulaire
1°) rétrotranscription
5’
Transcriptase
inverse
3’
3’
5’
5’
ADN (-)
7°) morphogenèse
Maturation de la
polyprotéine
Tat
Rev
Nef
Env
Gag-Pol
Gag
6°) modification
posttraductionnelle
Protéase
5°) changement
du cadre de
lecture
5’
Membrane nucléaire
ARNm
ARNm
multiépissés monoépissés
2°) intégration
Intégrase
ARN polymérase II
3°) transcription
ARNm
non-épissés
4°) épissage
alternatif
Rétrovirus : stratégie de réplication
Caractéristiques spécifiques
• enzymes structurales
• Transcriptase inverse
• Intégrase
• Protéase
• intégration dans le génome de l’hôte
• épissage alternatif (3 cadres de lecture)
• polyprotéine
• changement du cadre de lecture
Virus ARN + et protéine N
(Nucléocapside)
Virus ARN +
Virus ARN -
réplicase (P,L)
(1-3 sous-unité)
-enzymes structurales
-réplicase virale
-helicase
-protéine N
-modification de lafonction
de la réplicase par N
-ARNm
-polyprotéine
-protéase(s)
ARN génomique subi
+
+
-
+
+
+
+
taile génomique
taile sous-génomique
(ou sous-génomique)
(ou génome ségmenté)
1 ARNm = plusieurs protéines
1 ARNm = 1 protéine
+
+
1°) traduction
2°) ARN- (antigénomique)
1°) ARNm
2°) ARN+ (antigénomique)
Familles de virus à ARN humains et animaux
polari
té
ARN
génomique
taille
(kb)
ARNm
+
sb
"
Un
7.28.4
Taille de
génome
"
"
Un
"
"
Un
Un
"
Diploide
4-10
"
sb
"
"
Un
16-20
Une
protéine
"
"
"
7-8 segments
+/-sb
"
Un
10-12
Un
Un
Enzymes
dans le
virion
-
Protéine
-
picornaviridae
Entero-: poliomyélite, CardioHepato-: hépatite A, Rhino-
-
"
+
flaviviridae
-
-
+
alphaviridae
hépatite C, fièvres hémorragiques: fièvre
jaune, virus de la dengue, encéphalite de
St.Louis
rubéole , virus de Sindbis (SV),
virus de la foret de Semliki (SFV)
-
-
+
-
coronaviridae
caliciviridae
ARNt
+
retroviridae
Trans
criptase
+
+
-
+
rhabdoviridae
-
+
+
filoviridae
paramyxoviridae
Ebola, Marburg
"
+
+
orthomyxoviridae
grippe
"
"
+
+
ARNm
cellulaire
"
"
+
+
bunyaviridae
arenaviridae
Fièvre hémorragique, Hantavirus
"
+
-
-
reoviridae
rotavirus, maladie fébrile
"
infantiles
+
-
-
birnaviridae
"bursal disease of chickens"
Subgéno
mique
"
"
14
3 segments
13-21
2 segments
10-14
“circ”
db
8-12
22-27
segments
"
2 segments
7
Soulignements : hépatites; maladies
RT,PR,IN
amorce
enveloppe Nom de famille
"common cold pneumonia"
hépatite E, gastroentérite
retro- (RSV), lenti- (VIH, SIV, HTLV),
spumavirus de la stomatite vésiculaire (VSV),
rage,
rougeole, oreillons, parainfluenza
Lassa, Machupo, virus de la Chorioméningite
lymphocytaire (LCMV)
Pandémie de l'influenza 1918-1919
Un des évènements les plus mortels dans l'histoire
Pandémie d'influenza (1918-1919)
La mort noire (la peste) (1348-1350)
2e guerre mondiale (1937-1945)
Pandémie du SIDA (jusqu'à 1997)
1re guerre mondiale (1914-1918, morts militaires)
Millions de morts
20-40
20-25
16
12
9
La virus de la grippe est un virus à ARN- avec un génome segmenté
Enzymes structurales :
Polymérases PA, PB1, PB2
Protéine « N » (=NP)
(Neuraminidase)
(Hémagglutinine)
L’acide sialique est le récepteur du virus de la grippe
Tropisme viral au niveau de l’entrée
HA
Membrane cellulaire
Liaison 2’-6’ : trachée de l’homme
Liaison 2’-3’ : les oiseaux
Liaison 2’-3’ & 2’-6’ : cochon
Tropisme du virus de la grippe
Souches humaines : préférence de hémagglutinine : 2’-6’
Souches aviaires (H5) : préférence de hémagglutinine : 2’-3’