Pôle Epidémiologie et Santé Publique

Pôle Epidémiologie et Santé Publique
EVALUATION DES TESTS DIAGNOSTIQUES
du 7 au 11 mars 2016
Directeurs du Cours
Muriel VRAY
Email : [email protected]
Marleen BOELAERT
Email : [email protected]
Unité d’Epidémiologie des Maladies
Infectieuses
Institut Pasteur - Dakar
Institut de Médecine Tropicale,
Anvers
Belgique
Chefs de travaux
Laura Schaeffer
Email : [email protected]
Unité de Recherche et d'Expertise
Epidémiologie des Maladies Emergentes
Institut Pasteur - Paris
Joris MENTEN
Email : [email protected]
Institut de Médecine Tropicale,
Anvers
Belgique
Descriptif du cours
Ce cours a pour objectif de donner à des étudiants en sciences, médecine et santé publique une
formation à l’évaluation des tests diagnostiques. Seront abordés – Les différentes étapes de
validation d’un test diagnostique : de la validation au laboratoire jusqu’à l’utilisation sur le terrain
- l’élaboration du protocole avec identification et discussion des biais – les principales mesures
d’évaluation de la validité et de la reproductibilité des tests (Sensibilité, spécificité, courbes ROC,
kappa, méthodes Bland-Altman ..), – les modèles utilisés en cas de tests de référence imparfaits ou
inexistants, – les critères de qualité d’une étude diagnostique, –
les comparaisons de coût-
efficacité. Toutes ces notions théoriques seront accompagnées d’exemples pratiques avec
utilisation de logiciel.
Programme
Lundi 7 mars
8h45 - 9h00
Accueil des étudiants
M. Vray, L. Schaeffer
et le Secrétariat de la Scolarité
9h00 - 10h00
Introduction à l’évaluation des tests diagnostiques
M. Vray
10h30 - 12h00
Les différentes phases d’évaluation d’un test diagnostique
Phase 1 (proof of concept)
Phase 2 (cas-témoins)
Phase 3 (Etude prospective)
M. Vray
13h30 - 15h00
Exercices
15h00 - 17h00
Le Protocole
Les grilles STARD et QUADAS
M. Vray
9h00 - 11h00
La reproductibilité
Coefficient de Kappa et PABAK
Diagramme de Bland et Altman
Coefficient de corrélation intraclasse
M. Vray
11h00 - 12h30
Exercices
Coefficient de Kappa et PABAK
14h00 - 15h30
Exercices
Diagramme de Bland et Altman
Coefficient de corrélation intraclasse
15h30 – 17h00
Les principales mesures d’évaluation
Sensibilité, Spécificité, VPP, VPN
Courbes ROC
M. Vray et L. Schaeffer
Mardi 8 mars
M. Vray et L. Schaeffer
M. Vray
Mercredi 9 mars
9h00 - 10h00
Les principales mesures d’évaluation (suite)
Sensibilité, Spécificité, VPP, VPN
Courbes ROC
10h00 - 12h00
Exercices
Sensibilité, Spécificité, VPP, VPN
Courbes ROC
M. Vray et L. Schaeffer
14h00 - 16h00
Les biais
M. Vray et L. Schaeffer
16h00 - 17h30
Exercices
Les biais
Grille STARD
M. Vray et L. Schaeffer
M. Vray
Jeudi 10 mars
9h00 - 12h30
Le problème du gold standard
Modélisation du gold standard (analyse des classes latentes)
14h00 - 17h30
Exercices et application
M. Boelaert
et J. Menten
M. Boelaert et J. Menten
Vendredi 11 mars
9h00 - 12h30
Evaluation de coût-efficacité de
différents algorithmes diagnostiques
M. Boelaert et J. Menten
14h00 - 17h00
Examen
M. Vray, M. Boelaert,
J. Menten et L. Schaeffer
Examen écrit sur table, composé d’exercices
Durée : 2h30
Note sur 20
_________