Sommaire - GLOBE Network
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www.gabriel-network.org Juin 2016 | Numéro 21 MEMBERS NEWS Restons informés ! Réunion du Groupe de travail TB Le groupe de travail Tuberculose s’est réuni à Lyon les 13 et 14 janvier dernier. Les représentants des membres GABRIEL du Bangladesh, France, Haïti, et Ukraine et un expert en tuberculose étaient présents. L’objectif de cette réunion était 1) de réfléchir sur les thématiques d’intérêt identifiées lors de la réunion du réseau GABRIEL en 2014 (outils de diagnostic, épidémiologiques, biomarqueurs, essais cliniques), ayant un impact sur les patients tuberculeux ou sur les systèmes de santé et 2) de proposer des projets collaboratifs et de mettre en place un plan d’action. Parmi les sujets discutés citons 2 propositions : une première sur l’évaluation de la cartouche GeneXpert RIF/TB Ultra en cours de développement : celleci pourrait complémenter les laboratoires de microscopie (en effet la sensibilité du test serait améliorée grâce à l’utilisation de la séquence d’insertion IS6110 comme cible), et une deuxième sur l’opportunité d’évaluer des biomarqueurs de l’hôte pour détecter l’évolution de la tuberculose de l’état de latence vers le stade maladie, ou pour suivre l’efficacité du traitement. Le plan d’action mis en place a été diffusé au sein des membres du réseau impliqués dans des activités TB. Il sera discuté et revu lors d’une session dédiée lors du prochain meeting GABRIEL à Vientiane en juillet 2016. En marge de ce plan, Oksana Ocheretina propose à tous les membres qui le souhaitent, de faire un stage d’observation au laboratoire TB des centres GHESKIO à Port-au-Prince, Haïti, afin de partager l’expérience acquise par le laboratoire en termes d’organisation et de bonnes pratiques. Sommaire ■■ Réunion du Groupe de travail TB ■■ Virus du papillome humain (VPH) et cancer du col de l’utérus à Madagascar: COFAC-Col, un projet en réseau ■■ Deux prix d’excellence remportés par le CML pour ses travaux sur l’étiologie des virus respiratoires en Chine ■■ Combattre le choléra en Haïti ■■ Outil de diagnostic des fièvres entériques ■■ Approche pathogénétique pour le traitement de la tuberculose pulmonaire multi-résistante ■■ Publications des membres GABRIEL depuis Décembre 2015 Jean-Luc Berland, Laboratoire des Pathogènes Emergents, Fondation Mérieux (France) Global Approach to Biological Research, Infectious diseases and Epidemics in Low-income countries 1/9 www.gabriel-network.org Juin 2016 | Numéro 21 Virus du papillome humain (VPH) et cancer du col de l’utérus à Madagascar : COFAC-Col, un projet en réseau Le cancer du col de l’utérus est une des principales causes de décès par cancer dans le monde chez les femmes. On compte près de 266.000 décès et 528.000 nouveaux cas déclarés en 2012. Dans les pays en développement, notamment les pays d’Afrique sub-saharienne, près de 231.000 décès ont été signalés cette année. En janvier 2015, le Consortium africain de Recherche sur le Contrôle du Cancer du Col de l’utérus (COFAC-Col) a été lancé à Dakar (Sénégal) par cinq pays africains francophones (Cameroun, Gabon, Côte d’Ivoire, Madagascar et Sénégal). L’Institut national du Cancer de France, agissant comme catalyseur, soutient financièrement les activités de recherche de ce réseau, tandis que l’Institut de Cancérologie de Lorraine (France) assure le soutien technique. L’objectif principal de COFAC-Col est de fournir un modèle de travail qui permettra de mettre en œuvre des protocoles de recherche normalisés de haute qualité dans les cinq pays et de promouvoir le partage des connaissances. Les objectifs spécifiques sont 1) d’identifier la nature des génotypes de HPV associés aux lésions intraépithéliales de néoplasie de haut grade et les cancers invasifs et 2) d’estimer la prévalence de chaque génotype impliqué dans les cancers du col de l’utérus, dont HPV16 et 18. Pour chaque pays, le nombre de cas nécessaire à inclure est d’au moins 369. L’étude implique la participation de pathologistes, de cliniciens / oncologues, virologues et épidémiologistes. La fin de l’étude est prévue pour décembre 2016. En ce qui concerne Madagascar, le diagnostic pathologique des lésions cancéreuses est effectué par l’UPFR de Cytologie, d’Anatomie et de Cytologie Pathologie de l’Hôpital Ampefiloha, Antananarivo, et l’identification des génotypes du VPH est effectuée par le Centre d’Infectiologie Charles Mérieux de Madagascar, suivant des protocoles normalisés et bien définis. Enfin, cette étude devra (a) fournir des données épidémiologiques qui permettront d’évaluer le vaccin contre le VPH en cours d’utilisation dans chaque pays et (b) de promouvoir le développement d’un réseau professionnel, afin d’optimiser les ressources et les compétences et de normaliser les procédures de gestion du cancer du col de l’utérus. Mala Rakoto-Andrianarivelo, Laboratoire Rodolphe Mérieux, Centre d’Infectiologie Charles Mérieux, Université d’Antananarivo (Madagascar), Tsitohery Francine Andriamampionona, Service de Pathologie, UH Tambohobe, Franarantsoa (Madagascar), Global Approach to Biological Research, Infectious diseases and Epidemics in Low-income countries 2/9 www.gabriel-network.org Juin 2016 | Numéro 21 Nantenaina Randrianjafisamindrakotroka, UPFR of Cytology, Anatomy and Cytology Pathology, Ampefiloha Hospital, Antananarivo (Madagascar) Deux prix d’excellence remportés par le CML pour ses travaux sur l’étiologie des virus respiratoires en Chine Le Laboratoire Christophe Mérieux (CML) a remporté le 1er Grand Prix de Technologie et de Science de l’Association de la Médecine préventive de Chine, ainsi que le 2e Grand Prix de Technologie et de Science du Ministère de l’Education chinois, pour ses travaux de recherche menés en 2015 sur l’étiologie des virus respiratoires majeurs récemment découverts. Ces prix sont les premiers à être attribués dans le cadre d’enquêtes approfondies sur l’étiologie des infections virales respiratoires en Chine. A l’échelle mondiale, les infections virales respiratoires représentent une des causes majeures de mortalité et de morbidité. Cependant, le contrôle et la prévention de ces infections sont entravés par le manque de données fondamentales sur la nature, la distribution et l’épidémiologie de ces maladies. C’est donc grâce au financement de la Fondation Mérieux et de l’Etat chinois que le CML a pu mettre en place un réseau d’hôpitaux sentinelles avec des sites couvrant le territoire chinois et qui depuis 10 ans, effectue le recrutement de patients et les prélèvements d’échantillons. Le CML a réussi à caractériser la distribution spatio-temporelle des virus respiratoires communs chez les enfants et les adultes atteints d’infections respiratoires aiguës. Ce laboratoire a été le premier à annoncer l’épidémie en Chine de virus respiratoires récemment identifiés ou ré-émergents, tels que le rhinovirus C, saffold cardiovirus 1-3, bocavirus 3, coxsackievirus A21, l’entérovirus (EV) D68, EV-104 et EV117. Les caractéristiques moléculaires, épidémiologiques, phylodynamiques et séro-épidémiologiques des virus respiratoires émergents majeurs, dont le métapneumovirus humain, EV-D68, le coronavirus humain et le virus parainfluenza humain ont également été décrites. Les essais moléculaires développés par le CML pour diagnostiquer les infections multi-virales ont été largement utilisés par le réseau de surveillance en Chine et ont contribué à la réponse aux épidémies du syndrome piedsmains-bouche, la fièvre aphteuse, la grippe pandémique A H1N1, la grippe aviaire H7N9, etc. Une banque d’échantillons a été mise en place pour permettre la réalisation d’essais cliniques sur les nouveaux virus respiratoires. Le CML est l’auteur d’environ 50 articles déjà publiés sur ces thèmes de recherche. En Chine, ces prix d’excellence en science et technologie, financés par des institutions académiques et par l’Etat, sont destinés à encourager la mise en œuvre de projets de recherche de grande qualité. En 2015, seuls Global Approach to Biological Research, Infectious diseases and Epidemics in Low-income countries 3/9 www.gabriel-network.org Juin 2016 | Numéro 21 deux 1ers Grands Prix de Technologie et de Science de l’Association de la Médecine préventive ont été décernés parmi les huit postulants. Ces deux prix récompensent les efforts accomplis et le rôle de premier plan du CML dans ce domaine de la recherche en Chine. Jianwei Wang et Lili Ren, Laboratoire Christophe Mérieux, Chine Combattre le choléra en Haïti En 2010, le choléra est apparu pour la première fois en Haïti au lendemain du tremblement de terre. Aujourd’hui, six ans plus tard, avec plus de 800.000 cas et 9.000 décès, l’épidémie fait encore rage, en dépit des tentatives pour améliorer l’approvisionnement en eau et les conditions sanitaires. Différentes stratégies ont été développées pour lutter contre la maladie. L’été dernier, le centre de traitement de choléra GHESKIO, structure architecturale innovante construite par MASS Design Group, a ouvert ses portes avec la mission de compléter les infrastructures de santé publique de Haïti. Ce bâtiment a été conçu de manière à fournir une lumière naturelle et une ventilation pour une meilleure circulation de l’air, et un système de traitement des eaux usées pour éviter d’autres recontaminations. De nouveaux vaccins se sont montrés prometteurs pour la prévention de la maladie. Des études récemment menées par GHESKIO en 2012 sur un large site à Portau-Prince (70.000 habitants) ont démontré l’efficacité des vaccins dans l’éradication du choléra. Ces résultats encourageants pourraient déclencher l’utilisation future de ces vaccins dans d’autres contextes d’épidémie. En effet, le vaccin oral contre le choléra (OCV) a démontré une efficacité qui avoisine les 97,5%. Cependant, d’importantes questions de recherche demeurent, y compris celles concernant la durée de la protection, l’efficacité d’une dose par rapport à deux dans les zones non endémiques (une étude récente a montré qu’une dose était efficace) et l’impact de l’immunité de groupe. Jean William Pape, Les centres GHESKIO, Haïti Outil de diagnostic des fièvres entériques Les fièvres entériques sont des maladies infectieuses graves qui résultent de l’ingestion d’eau ou d’aliments ayant subi une contamination fécale d’origine humaine par Global Approach to Biological Research, Infectious diseases and Epidemics in Low-income countries 4/9 www.gabriel-network.org Juin 2016 | Numéro 21 les bactéries du genre Salmonella (sérovar Typhi ou moins fréquemment Paratyphi A, B ou C). En l’absence de traitement, elles sont associées à une mortalité et une morbidité importante dans le monde entier, en particulier dans les pays en développement à faibles ressources où l’hygiène est précaire. Les données d’incidence de la maladie sur les populations sont rares et pas assez fiables du fait du manque de spécificité et/ ou de sensibilité des tests de diagnostic de référence (hémoculture et sérodiagnostic de Widal Felix). Afin de pallier ce déficit, la Fondation Mérieux, en collaboration avec l’Institut Pasteur en France, le Child Health Research Foundation (CHRF) au Bangladesh et la société Fast-Track Diagnostics au Luxembourg, a développé, grâce à un financement de la Fondation Bill et Melinda Gates (BMGF), une méthode adaptée aux études de surveillance et d’épidémiologie des fièvres entériques. Ce test, qui combine une étape de préenrichissement de l’échantillon sanguin en milieu biliaire couplée à une détection moléculaire multiplexe en temps réel des pathogènes (S. Typhi et S. Paratyphi A), a été évalué au Dhaka Shishu Hospital (Bangladesh) sur des enfants souffrant de fièvres (>38.5°C) et suspectés d’être atteints de fièvre typhoïde. Les résultats indiquent que notre test présente une sensibilité supérieure à celle de l’hémoculture (93.6% VS 61.7%) sans perte de spécificité. Néanmoins, l’utilisation de 5ml de sang est un frein à l’utilisation de cette méthode en pédiatrie, spécialement avec les enfants de moins de 2 ans. Aussi, une nouvelle évaluation avec 3ml de sang a été réalisée sur une cohorte plus large (plus de 700 échantillons) de patients de tout âge recrutés à l’hôpital ou dans la communauté. Ce travail, réalisé en collaboration avec le CHRF et l’International Centre for Diarrhoeal Disease Research au Bangladesh (icddr,b), a confirmé les résultats obtenus préalablement et validé l’utilisation de 3ml d’échantillon pour notre application. Cependant, de nombreuses études tendent à montrer une forte augmentation des fièvres Paratyphoïde dans diverses parties du monde, particulièrement en Asie et en Afrique. Un nouveau financement de BMGF va ainsi nous permettre d’étendre l’évaluation de notre test à trois pays africains (Ghana, Malawi et Burkina Faso). L’ensemble des données générées nous permettra de soutenir l’utilisation de ce test de diagnostic pour fournir un outil de surveillance fiable ou vérifier l’efficacité des vaccins afin d’aider à la mise en place de mesures nécessaires au contrôle de la maladie. Stéphane Pouzol et Valentina Picot, Laboratoire des Pathogènes Emergents, Fondation Mérieux (France) Global Approach to Biological Research, Infectious diseases and Epidemics in Low-income countries 5/9 www.gabriel-network.org Juin 2016 | Numéro 21 Approche pathogénétique pour le traitement de la tuberculose pulmonaire multi-résistante L’objectif de notre recherche actuelle consiste à augmenter l’efficacité de la chimiothérapie multi-agents contre la tuberculose (TB) pulmonaire destructrice multi-résistante et d’accroître la tolérance de ce traitement chez les patients. Un total de 250 patients adultes atteints de TB pulmonaire destructrice multirésistante a été examiné avant et après cette thérapie. Nous avons mesuré les niveaux de cytokines pro- et anti-inflammatoires : la présence de TNF-αétait 38,3 fois supérieure, celle de IL-6 24,6 fois supérieure, de IL-2 2,5 fois supérieure, et de IL-10 7,1 supérieure. Nous avons évalué les composantes essentielles des troubles végétatifs, dont une activité élevée de composants sympathiques du système nerveux autonome (manifestée par une augmentation du rythme cardiaque 1,2 fois supérieure et une amplitude de mode 1,5 fois supérieure), une baisse de l’activité parasympathique (une diminution des écarts de l’ordre de 1,5 fois et une diminution du mode de l’ordre de 1,2) et, enfin, une augmentation de l’ordre de 3,7 de l’indice de tension du système nerveux autonome. Cette étude a également mis en évidence un niveau élevé de stress oxydatif et de l’intoxication endogène secondaire (augmentation 1,2 fois supérieure des protéines modifiées par oxydation spontanée (OMP)) et un statut antioxydant diminué (augmentation 1,7 fois supérieure du niveau d’OMP métallo-induites). neuro-végétatifs chez les patients atteints de TB pulmonaire destructrice multi-résistante, nous a permis d’identifier les mécanismes pathogéniques de progression de la maladie en terme de gravité, associés à des niveaux élevés de marqueurs de cytokines sériques. Nous avons également mesuré l’intensité du stress oxydatif et de la sympathicotonie, et nous avons défini le traitement pathogénique complémentaire requis pour corriger ces altérations (prescription de Glutamylcystéinyl-glycine disodique pour la réponse immunitaire, de Mebicar comme agent anxiolytique et de Propionate dihydrate comme cytoprotecteur). La réparation des altérations immunologiques, des dysfonctionnements neuro-végétatifs et des modifications de l’oxydation des protéines par le peroxyde, associés à une intoxication endogène secondaire (éliminée par le traitement pathogénique complémentaire de la TB pulmonaire destructrice multi-résistante par les médicaments mentionnés ci-dessus) conduit à une amélioration de l’efficacité du traitement de l’ordre de 23,1%. Une plus grande tolérance à la chimiothérapie préventive par agent multiple a été observée par la diminution / suppression des réactions secondaires causées par les antituberculeux administré 2,9 fois de moins. Olena Raznatovska et Olga Konakova, Zaporozhye State Medical University, Ukraine Une étude des altérations immunologiques, biochimiques et des dysfonctionnements Global Approach to Biological Research, Infectious diseases and Epidemics in Low-income countries 6/9 www.gabriel-network.org Juin 2016 | Numéro 21 Bénet T, Sylla M, Messaoudi M, Sánchez Picot V, Telles JN, Diakite AA, Komurian-Pradel F, Endtz H, Diallo S, Paranhos-Baccalà G,Vanhems P. Etiology and Factors Associated with Pneumonia in Children under 5 Years of Age in Mali: A Prospective Case-Control Study. PLoS One. 2015 Dec 22;10(12):e0145447 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26696249 Moradi A, Nymadawa P, Ozbay B, Ozkan M,Parekh D, Paul M, Poeppl W, Polack FP, Rath BA, Rodríguez AH, Siqueira MM, Skrt-Magierło J, Talarek E, Tang JW, Torres A, Törün SH, Tran D, Uyeki TM,van Zwol A, Vaudry W, Velyvyte D, Vidmar T, Zarogoulidis P; PRIDE Consortium Investigators, Nguyen-Van-Tam JS. 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