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Les bioénergies : les avancées actuelles de 3BCAR
pour une exploitation industrielle future
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Curriculum Vitae des membres de 3BCAR présents au
forum recherche industrie de l’institut Carnot 3BCAR
9 novembre 2012
Listes des membres de 3BCAR présents au Forum :
Hélène ANGELLIER
Stéphanie BAUMBERGER
Maryse BRANCOURT
François BROUST
Bernard CATHALA
Thierry CHARDOT
Paul COLONNA
Hugo De VRIES
Eric DUBREUCQ
Claire DUMAS
Benoit GABRIELLE
Olivier GALY
Alain GUIBERT
Herman HOFTE
Michael J. O’DONOHUE
Carole JOUVE
Michel MANACH
Valérie MECHIN
Isabelle MEYNIAL-SALLES
Pierre MONSAN
Grégory MOUILLE
Denis POMPON
Jean-Philippe STEYER
Jean TAYEB
Thierry CHARDOT
Nathalie TURC
Carlos VACA GARCIA
Gérard VILAREM
1
SOMMAIRE
DR HELENE ANGELLIER-COUSSY ......................................................................... 3
DR STEPHANIE BAUMBERGER .............................................................................5
DR. MARYSE BRANCOURT ...................................................................................... 7
DR. FRANÇOIS BROUST ........................................................................................... 9
DR BERNARD CATHALA ....................................................................................... 10
THIERRY CHARDOT .............................................................................................. 12
DR. PAUL COLONNA............................................................................................... 14
DR. HUGO DE VRIES ............................................................................................... 16
PR ERIC DUBREUCQ .............................................................................................. 17
DR. CLAIRE DUMAS ................................................................................................ 20
DR. BENOIT GABRIELLE ....................................................................................... 22
OLIVIER GALY.......................................................................................................... 24
DR. ALAIN GUIBERT .............................................................................................. 25
DR. HERMAN HOFTE ............................................................................................. 26
DR. CAROLE JOUVE ................................................................................................ 28
MICHEL MANACH ................................................................................................... 30
DR. VALERIE MECHIN ........................................................................................... 31
DR. PIERRE MONSAN ............................................................................................ 33
DR GREGORY MOUILLE ........................................................................................ 35
DR. MICHAEL J. O’DONOHUE .............................................................................. 37
DR. DENIS POMPON ............................................................................................... 40
DR. JEAN-PHILIPPE STEYER ............................................................................... 42
DR. JEAN TAYEB...................................................................................................... 44
NATHALIE TURC ..................................................................................................... 46
PR CARLOS VACA-GARCIA ................................................................................... 47
DR GERARD VILAREM........................................................................................... 49
2
UMR IATE – Ingénierie des Agropolymères
et Technologies Emergentes – Montpellier
Dr Hélène ANGELLIER-COUSSY
Maître de Conférences
[email protected]
04 67 70 38 61
Parcours professionnel :
Sept. 2002 - Août 2005 (3 ans)
Doctorat en Science et Génie des Matériaux, au CERMAV (Centre de Recherche sur les
Macromolécules Végétales) à Grenoble : Nanocristaux d’amidon pour applications
composites. Directeurs de thèse : Alain Dufresne et Sonia Boisseau.
Sept 2005 – Janv. 2007 (1 an et demi)
Attaché Temporaire d'Enseignement et de Recherche à l’Université Montpellier 2.
Activités de recherche au sein de l’UMR IATE (Ingénierie des Agropolymères et
Technologies Emergentes).
Depuis Fev. 2007
Maître de conférences au département Génie Biologique de l’IUT de l’Université
Montpellier 2. Activités de recherche au sein de l’UMR IATE, dans l’équipe TRANSMAT
dirigée par Nathalie Gontard.
Depuis Sept 08
Responsable pédagogique de la LP ALIPACK « Qualité, Sécurité et impact sur
l’Environnement de l’Aliment et de son Emballage ».
Domaines de compétences :
• Matériaux bio-sourcés et biodégradables (amidon, protéines végétales de type gluten de blé, kératine,
biopolyesters microbiens)
• (Nano)composites à matrice polymère : mise en œuvre, étude des relations structure/propriétés
• Activités d’enseignement en chimie alimentaire, science et génie des matériaux, matériaux
d’emballages, bioplastiques (jusqu’au niveau master)
Diplômes et formations :
2002 - Diplôme d’Ingénieur EFPG-INPG (Ecole Française de Papeterie et des Industries
Graphiques de Grenoble, devenue PAGORA), Grenoble.
2002 : Diplôme d’Etudes Approfondies en Sciences et Génie des Matériaux, Univ. Joseph
Fourier, Grenoble (DEA en double cursus).
2005 : Thèse de Doctorat en Sciences et Génie des Matériaux, Univ. Joseph Fourier,
Grenoble.
Recherches actuelles :
Outre leur coût encore élevé, l’utilisation de matériaux bio-sourcés pour des emballages
alimentaires est aujourd’hui limitée par des propriétés fonctionnelles (mécaniques et barrière)
insuffisantes. Il est évident et maintenant largement démontré que la structure d’un matériau
détermine ses propriétés. Dans ce contexte, la question scientifique au cœur de mes travaux de
recherche est de comprendre, moduler et contrôler les relations structure/propriétés
fonctionnelles dans des matériaux bio-sourcés. La réponse à cette question scientifique
implique de traiter les quatre questions suivantes en suivant une démarche de type
ingénierie réverse :
3
(1)Structuration de matrices polymères, en jouant sur le procédé ou la formulation
(plastification, ajout de (nano)charges).
(2) Caractérisation multi-échelle de la structure des matériaux.
(3) Evaluation des propriétés fonctionnelles (thermiques, mécaniques et barrière).
(4) Compréhension et modélisation des relations structure/propriétés.
Je suis ainsi impliquée dans différents projets de recherche, notamment dans le projet européen
EcoBioCap (FP7-KBBE-2010-4) -: « Ecoefficient Biodegradable Composite Advanced Packaging »
(coordination INRA – UMR IATE, 2011-2015) qui vise à développer des matériaux composites
biodégradables à partir de sous-produits des industries alimentaires (PHAs, fibres
lignocellulosiques, etc) qui pourront répondre aux spécificités des emballages alimentaires en
terme de propriétés d’usage. Mes activités portent tout particulièrement sur les différentes voies
de compatibilisation fibre/matrice dans des matériaux composites.
Autres activités :
Rapporteur régulier d’articles scientifiques pour des revues internationales de rang A (Journal
of Applied Polymer Science, Biomacromolecules, Industrial Crops and Products, Journal of
Membrane Science, Journal of Cereal Science). Expertise régulières de projets (ANRT, IRD).
Membre du groupement de recherche national BioMatPro : Les agro-ressources, pour
quels matériaux et produits du futur ? GDR créé en partenariat entre le CNRS et l’INRA.
Participation au labex thématique SERENADE (Safe Ecodesign Research and Education
applied to NAnomaterial Development) coordonné par le CEREGE à Marseille avec pour
objectif de créer un réseau national sur les nanotechnologies/nanomatériaux et des stratégies
de maîtrise de leur sécurité vis à vis du consommateur, de l'utilisateur et de l'environnement,
tout au long de leur cycle de vie.
Co-responsable de la plateforme de mise en forme (extrusion, thermoformage, casting) et de
caractérisation des matériaux (DSC, traction, DMTA) de l’UMR IATE.
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
Angellier H., Molina-Boisseau S., Dufresne A. « Mechanical properties of waxy maize starch nanocrystals reinforced
natural rubber », Macromolecules, 2005, 38(22), 9161-9170.
Angellier H., Molina-Boisseau S., Dole P., Dufresne A. « Waxy maize starch nanocrystals reinforced thermoplastic
starch », Biomacromolecules, 2006, 7(2), 531-539.
Tunc S., Angellier H., Cahyana Y., Chalier P., Gontard N., Gastaldi E. « Properties of wheat gluten/montmorillonite
nanocomposite films processed by casting », Journal of Membrane Science, 2007, 289, 159-168.
Chivrac F., Angellier-Coussy H., Guillard V., Pollet E., Avérous L. « How does water diffuse in wheat
starch/nanoclays nanocomposite materials », Carbohydrate Polymers, 2010, 82, 128-135.
Angellier-Coussy H., Gastaldi E., Gontard N., Guillard V. « Influence of processing on the water vapour transport
properties of wheat gluten based agromaterials », Industrial Crops and Products, 2011, 33, 457-461.
Chevillard A., Angellier-Coussy H., Cuq B., Cesar G., Guillard V., Gontard N., Gastaldi E. « How the biodegradability of
wheat gluten based agromaterials can be modulated by adding nanoclays », Polymer Degradation and Stability,
2011, 96(12), 2088-2097.
Chevillard A., Angellier-Coussy H., Guillard V., Gontard N., Gastaldi E. « Controlling pesticide release via structuring
agropolymer and nanoclays based materials », Journal of Hazardous Materials, 2012, 205-206, 32-39.
Montaño-Leyva B., Ghizzi D. da Silva G., Gastaldi E., Torres-Chávez P., Gontard N., Angellier-Coussy H.
« Biocomposites from wheat proteins and fibers: structure/mechanical properties relationships», Industrial
crops and Products, in press.
4
Institut Jean-Pierre Bourgin UMR 1318
AgroParisTech-INRA
Dr Stéphanie Baumberger
Maître de Conférences en Biochimie
[email protected]
Tel : 01 30 83 37 78
Parcours professionnel :
Depuis 1999 : Maître de Conférences à l’INA P-G puis AgroParisTech (Institut des
sciences et industries du vivant et de l’environnement, issu de la fusion de l’INA P-G
avec l’ENSIA et l’ENGREF). Rattachée à l’UFR Biochimie et Biologie Structurale
(AgroParisTech, Département Sciences de la Vie et Santé) et à l’UMR IJPB 1318,
AgroParisTech-INRA
Domaines de compétences :
Propriétés fonctionnelles des biomolécules ; Structure et réactivité des lignines ;
Méthodes d’analyse physico-chimiques
Diplômes et formations :
Diplôme d’Ingénieur des Industries Agricoles et Alimentaires (ENSIA, Massy) - 1993
Doctorat de Biochimie de l’Institut National Agronomique Paris-Grignon – 1999
Obtention et caractérisation de matériaux composites amidon-lignines.
Habilitation à Diriger des Recherches de l’Université Paris XII – Val de Marne – 2008
Réactivité et propriétés d’assemblage de polymères phénoliques : lignines industrielles et
lignification in vitro.
Recherches actuelles :
Utilisation de lignines et dérivés pour la fonctionnalisation de polymères et agromatériaux ; Etude de l’impact des procédés de bioraffinerie sur la structure et les
propriétés des lignines
Autres activités :
Co-animation du programme de recherche « Bioraffinerie des lignocelluloses » au sein
du département INRA « Caractérisation et Elaboration des Produits issus de
l’Agriculture »
Formation à AgroParisTech : co-responsabilité de la 3ème année BIOTECH (35
étudiants) et du parcours « Bioraffinerie, Chimie Verte »
Membre du Conseil des Enseignants et de la commission de domaine « Ingénierie des
aliments, biomolécules et énergie » AgroParisTech
Membre du comité de pilotage de la Chaire « Agro Biotechnologies Industrielles » (ABI,
AgroParisTech-Marne)
Membre de la cellule Formation du Labex Saclay Plant Science
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
5
Articles dans revues internationales et proceeding :
Lepifre, S., Froment, M., Cazaux, F., Houot, S., Lourdin, D., Coqueret, X., Lapierre, C.,
Baumberger, S. 2004. Lignin incorporation combined with electron-beam irradiation
improves the surface water resistance of starch films. Biomacromolecules, 5, 1678-1686.
Froment, M., Gors, C., Cazaux, F., Coqueret, X., Lepifre, S., Baumberger, S., Lapierre, C.
Linz, C., Lacrampe, M.-F., Krawczak, P. 2006. Reduction of starch hydrophilicity by
grafting lignin derivatives under EB irradiation: a study of model coumpounds. In :
« Starch: achievements in understanding of structure and functionality retail », Yuryev, V.
Tomasik, P. and Bertoft, E. (Eds.), pp. 167-178.
Baumberger, S., Abaecherli, A., Fasching, M., Gellerstedt, G., Gosselink, R., Hortling, B., Li, J.,
Saake, B., de Jong, E. 2007. Molar mass determination of lignins by size-exclusion
chromatography: towards standardisation of the method. Holzforschung, 61, 459-468.
Caulet, N., Jouanin, L., Lapierre, C., Baumberger, S., Mechin, V. 2010. Arabidopsis peroxidasecatalyzed copolymerization of coniferyl and sinapyl alcohols. Phytochem. 71, 1673-1683.
Louaifi, A., Guinault, A., Domenek, S., Ducruet, V., Baumberger, S. 2010. Valorisation of
industrial lignin as additive with antioxidant properties in PLA. 4th Shelf Life International
Meeting, 23-25 June 2010, Zaragoza, Spain, proceeding
Bouxin, F., Baumberger, S., Renault, J.H., Dole, P. 2011. Study of a specific lignin model: γoxidation and how it influences the hydrolysis efficiency of alcohol-aldehyde dehydrogenation
copolymers. Biores. Technol. 102 (10), 5567-5573.
Heiss-Blanquet, S., Zheng, D., Lopes Ferreira, N., Lapierre, C., Baumberger, S. 2011. Effect of
pretreatment and enzymatic hydrolysis of wheat straw on cell wall composition,
hydrophobicity and cellulase adsorption. Biores. Technol. 102 (10), 5938-5946.
Zhang, Y., Culhaoglu, T., Pollet, B., Melin, C., Denoue, D., Barriere, Y., Baumberger, S., Mechin, V.
2011. Impact of Lignin Structure and Cell Wall Reticulation on Maize Cell Wall Degradability. J.
Agric. Food Chem. 59 (18), 10129-10135.
Brevet
Bourgeois, M., Faure, C., Baumberger, S. Association de produits cationiques et anioniques
naturels comme liant pour support textile. Brevet déposé en France par l’Institut Français des
Textiles et de l’Habillement (IFTH) le 20 juillet 2009 sous le n°0955010.
Communications orales
Baumberger, S. 2010. Les lignines, des matières premières agro-industrielles pour les
matériaux
Conférence à l’Académie d’Agriculture (Séance “Lignines” du 17 Février 2010).
Baumberger, S. 2010. Enjeux de l’obtention de lignines à façon. Communication orale à la
journée “Chimie des lignines” de la Commission Biomolécules du Pôle Industrie AgroRessources, Reims, 8 Septembre 2010.
Baumberger, S. 2012. Les lignines : une source de molécules fonctionnelles pour la chimie
verte. Séminaire GDR Biomatpro, 27 Janvier 2012.
6
Dr. Maryse Brancourt
Chargée de recherche
Unité Mixte de Recherche Stress Abiotiques et
Différenciation des Végétaux Cultivés, INRA
Mail : [email protected]
Tel : 03.22.85.75.09
Un parcours professionnel consacré à la recherche puis à son animation
1999-2004 : Création et animation de la thématique « Méthodologie d’étude des interactions
génotype x milieu »
2002-2003 : Directrice d’unité, contribution à la définition de la politique scientifique
2003 : Contribution à la définition du schéma scientifique du centre de Lille « Solutions
alternatives pour une agriculture durable ».
2005-2006 : Co-animation avec Jacques Le Gouis de l’équipe « Adaptation à l’azote limitant et
interaction génotype x milieu »
2006 : Génétique de la production de biomasse à partir du miscanthus, une plante herbacée
pérenne, pour une utilisation en bioénergie.
Depuis septembre 2011, réflexion avec Hubert Boizard (directeur unité INRA Agro-impact
Laon-Mons) pour développer un programme de recherche commun sur la thématique de la
biomasse.
Des compétences en génétique et amélioration des plantes
Coordination du projet MISC-INNOV Démarrage d’un programme d’innovation variétale et de
diversification sur miscanthus (financement INRA 2011-2015).
Co-coordination du projet MISCOMVEG Création de matériel végétal d’étude chez miscanthus
et d’outils moléculaires associés (financement région Picardie 2011-2013).
Contribution au module mobilisation de la ressource dans le cadre du projet Futurol.
Coordination de la tâche R1b sur l’identification d’espèces de miscanthus pour le débouché
bioénergie (financement OSEO, 2008-2012).
Coordination du WP5 « Breeding strategies for crop improvement » du Projet BFF « Biomass
for the future » Développement conjoint de variétés de miscanthus et de sorgho pour la chimie
verte (AAP biotechnologies et bioressources, 2012-2019).
Coordination du projet MISC PIC Ecophysiologie comparée de deux espèces de miscanthus en
vue d’innovation variétale et prospection des risques liés à l’introduction de ces espèces à
l’échelle du système agricole cultivé (financement région Picardie 2012-2015).
Une formation en biologie et agronomie
1999 : Doctorat Mention Biologie et Agronomie. Ecole Nationale Supérieure Agronomique de
Rennes.
1988 : Diplôme d’Etude Approfondies. Spécialité Biologie et Agronomie. Université de Rennes.
1987 : Diplôme d’ingénieur de l’Ecole Nationale Supérieure Féminine d’Agronomie.
Obtention d’un premier prix auprès de la fondation Xavier-Bernard pour le mémoire de fin
d’études.
7
Des recherches actuelles sur la production de biomasse par le miscanthus
pour une valorisation en bioénergies
Une stratégie de recherche développée selon quatre étapes clés dans un projet plus large
regroupant les agronomes (Agro-impact) et généticiens (UMR SADV) :
• Comparer différents systèmes de culture dédiés à la production de biomasse selon une
évaluation multicritères. Il s’agit de développer la culture à l’optimum et de la valoriser au
mieux.
• Explorer les potentialités agronomiques et environnementales de différentes espèces de
miscanthus en vue de définir des idéotypes. A cette évaluation multicritère s’ajoute
l’évaluation de la composition de la biomasse pour répondre aux différents usages visés
pour la chimie verte.
• Comprendre le déterminisme génétique de la production de biomasse et des caractères
associés. Le maïs et le sorgho étant proches du miscanthus au niveau taxonomique, les
possibilités de génétique et de génomique comparatives entre les miscanthus (c’est à dire
différentes espèces de miscanthus) et ces plantes constituent des éléments essentiels pour
mener à bien les travaux de génétique.
• Produire des innovations variétales adaptées aux régions septentrionales françaises et
limitrophes dont la biomasse et sa composition auront été façonnées pour de nouveaux
usages industriels.
Autres activités :
•
•
•
•
•
Membre du conseil scientifique de l’UMR depuis sa création
Membre du conseil scientifique du département de génétique et d’amélioration des
plantes de l’INRA depuis 2011
Membre suppléant du conseil scientifique du centre INRA de Lille depuis 2011
Membre représentant l’INRA au comité de suivi des projets IBFBio (2007-2008)
Membre représentant l’INRA à l’école doctorale de l’UPJV Amiens (2007-2008)
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine :
Publications
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•
•
•
•
Zub H.W., M. Brancourt-Hulmel. 2010. Agronomic and physiological performances of different species of
Miscanthus, a major energy crop. A review. Agronomy for Sustainable Development 30:201-214
Zub H.W., S. Arnoult, M. Brancourt-Hulmel. 2011. Key traits for biomass production identified in different
Miscanthus species at two harvest dates. Biomass & Bioenegy 35:637-651
Zub H.W., C. Rambaud, L. Bethencourt, M. Brancourt-Hulmel. Late emergence and rapid growth maximize the
plant development of Miscanthus clones. Bioenergy research Published online 29 April 2012
Zub H.W., S. Arnoult, J. Younous, I. Lejeune-Hénaut, M. Brancourt-Hulmel. 2012 The frost tolerance of miscanthus
at the juvenile stage: differences between clonres influenced by leaf-stage and acclimation. European Journal of
Agronomy 36:32-40
Zub H.W., H. Monod, L. Bethencourt, M. Brancourt-Hulmel. An index of competition reduces statistical variability
and improves comparisons between genotypes of miscanthus. Bioenergy research. Published online 14 April 2012
Presentations à des congres:
•
•
•
Zub H.W., H. Monod, M. Brancourt-Hulmel. An index of competition reduces statistical variability and improves
comparisons between genotypes of miscanthus. Bioenergy research. Published online 14 April 2012 BrancourtHulmel M., H.W. Zub, S. Arnoult, A. Obeuf, B. Chabbert, J. Tayeb, G. Barbedette, S. Cadoux, H. Boizard. 2010. Crop
ability and biomass production in miscanthus: a feedstock for bioethanol? BIT’s 3rd Annual World Congress of
Industrial Biotechnology Dalian Chine July 25-27 2010 p.118 Présentation orale
Gonord F., C. Rambaud, M. Brancourt-Hulmel. 2007. Inter and intraspecific variability of miscanthus for
micropropagation and frost resistance. Congrès “A greener chemistry for industry”. Villeneuve d’Ascq 2-5 octobre
2007 Poster
Domon J.M., L. Baldwin, S. Acket, H.W. Zub, H. Sellier, S. Arnoult, I. Lejeune-Hénaut, M. Brancourt-Hulmel, J. Pelloux,
F. Gillet, C. Rayon. 2010. Cold tolerance influences cell wall structure of four miscanthus genotypes. XII Cell Wall
Meeting. Porto (Portugal) 25-30 July 2010 Poster
8
Dr. François BROUST
Chercheur
CIRAD UR Biomasse Energie
Mail : [email protected]
Tel : 04 67 61 58 43
Parcours professionnel :
Chercheur au CIRAD/UR Biomasse énergie depuis nov. 2004 (Montpellier)
Domaines de compétences :
Génie des Procédés – Pyrolyse, gazéification de la biomasse lignocellulosique
Diplômes et formations
Docteur-Ingénieur en génie des procédés (INPL/ENSIC)
Recherches actuelles :
• Optimisation de procédés de conversion thermochimiques de la biomasse
• Préconditionnement de la biomasse lignocellulosique par pyrolyse rapide
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
•
•
•
•
•
•
Ballerini D., Bournay L., Broust F., Rousset P., His S., Marty E., Montagne X., Seiler J.M. 2011. La
transformation de la biomasse lignocellulosique par voie thermochimique. In : Ballerini Daniel. Les
biocarburants : répondre aux défis énergétiques et environnementaux des transports. Paris : Ed.
Technip, p. 217-296.
Chhiti Y., Salvador S., Commandre J.M., Broust F., Couhert C. 2011. Wood bio-oil noncatalytic
gasification: Influence of temperature, dilution by an alcohol and ash content. Energy and fuels, 25 :
345-351.
Jendoubi N., Broust F., Commandre J.M., Mauviel G., Sardin M., Lèdè J. 2011. Inorganics distribution
in bio oils and char produced by biomass fast pyrolysis: The key role of aerosols. Journal of
Analytical and Applied Pyrolysis, 92 (1) : 59-67.
Broust F., Mauviel G., Quignard A., Boissonnet G., Bensakhria A., Bellot C., Bourgogne M., Martin G.,
Bridgwater A.V. 2010. Preconditioning of biomass through fast pyrolysis for different biofuels
applications: Outcomes of the project precond. In : Spitzer J. (ed.), Dallemand J.F. (ed.), Baxter D.
(ed.), Ossenbrink H. (ed.). European Biomass Conference and Exhibition. 18, 2010-05-03/2010-0507, Lyon, France.
Broust F., Girard P., Van de Steene L. 2008. Biocarburants de seconde génération (Ref RE110).
Techniques de l'ingénieur. Bioprocédés : 13 p.
Dufour A., Celzard A., Fierro V., Martin E., Broust F., Zoulalian A. 2008. Catalytic decomposition of
methane over a wood char concurrently activated by a pyrolysis gas. Applied catalysis A: General,
346 (1-2) : 164-173.
9
Biopolymères, Interactions et
Assemblages
Dr Bernard CATHALA
Directeur de recherche
[email protected]
02 40 67 50 68
Parcours professionnel : Chercheur à l’Institut National Agronomique, UMR
FARE (Reims) puis Unité BIA (Nantes)
Domaines de compétences : Biochimie et physico-chimie des biopolymères
Diplômes et Formations : Docteur en Chimie organique et Biochimie
Recherches actuelles : Nanomatériaux à base de ressources renouvelables
Autres activités : Responsable de l’équipe de recherche Assemblages
Nanostructurés de l’unité BIA à Nantes
Communications scientifiques :
o
o
o
o
Improved colloidal stability of bacterial cellulose nanocrystals (BCN)
suspension for the elaboration of spin-coated cellulose-based model surfaces
Heiko T. Winter, Carole Cerclier, Nicolas Delorme, Hervé Bizot, Bernard
Quemener, Bernard Cathala, Biomacromolecules, 11(11), 3144-3151, (2010)
Smart swelling biopolymer microparticles by a microfluidic approach:
Synthesis, in situ encapsulation and controlled release Fang A, Cathala B.
Colloids and Surfaces B, (2011)
Elaboration of Spin-coated Cellulose-Xyloglucan Multilayered Thin Films, Carole
Cerclier, Fabrice Cousin, Hervé Bizot, Céline Moreau and Bernard Cathala,
Langmuir, 26(22), 17248–1725 2010
Site-Selective Surface Modification Using Enzymatic Soft Lithography
Guyomard-Lack A, Delorme N, Moreau C, Bardeau J-F, Cathala B. Langmuir 27:
7629-7634 (2011)
New Pickering Emulsions Stabilized by Bacterial Cellulose Nanocrystals (BCN).
Kalashnikova, I.; Bizot, H.; Cathala, B.; Capron, I. Langmuir, 27, 7471–7479
(2011)
o
Coloured Semi-reflective Thin Films for Biomass-hydrolyzing Enzyme Detection.
Cerclier C., Lack-Guyomard A., Moreau C., Cousin F., Beury N., Bonnin E, Jean B.,
Cathala B. Advanced Materials 23: 3791–3795, (2011).
o
Oil-in-water Pickering stabilized by cellulosic nanocrystals: effect of charge
density and ionic strength. Irina emulsions Kalashnikova, Hervé Bizot, Bernard
Cathala, Isabelle Capron Biomacromolecules 13 (1), pp 267–275 (2012).
o
Patterning surface by site selective capture of biopolymer hydrogel beads.
Aurélie Guyomard-Lack, Céline Moreau, Nicolas Delorme, Jean-François
10
o
o
o
Bardeau, Mélanie Marquis, Aiping Fang, Bernard Cathala Colloids and Surfaces B
94, 369-373 (2012)
Microfluidic generation and selective degradation of biopolymer-based Janus
microbeads,
Mélanie
Marquis,
Denis
Renard,
Bernard
Cathala,
Biomacromolecules, 13 (4), 1197-1203, 2012
Tuning the architecture of cellulose nanocrystal–poly(allylamine hydrochloride)
multilayered thin films : influence of dipping parameters, Langmuir 28 (28),
10425–10436, 2012
Cellulose Nanocrystals assisted Dispersion of Luminescent Single Walled
Carbon Nanotube for Layer-by-Layer Assembled Hybrid Thin Films. Christophe
Olivier, Céline Moreau, Patricia Bertoncini, Hervé Bizot, Olivier Chauvet, and
Bernard Cathala, Langmuir accepté DOI: 10.1021/la302077a
Brevets :
o
o
o
Méthode de détection d’activités enzymatiques hydrolytiques sans marquage à
base de couches réflectives de biopolymères. Carole Cerclier, Bernard Cathala.
Brevet N° FR 1055529 du 7 Juillet 2010. En extension PCT
Composition sous forme d’émulsion comprenant une phase hydropobe
dispersée dans une phase aqueuse. Hervé Bizot, irina kalashnikova, Isabelle
Capron, Alain Buléon, Bernard Cathala. Brevet N° FR 10 55 836 du 19 Juillet
2010. En extension PCT
Procédé d'obtention d'émulsions à haute phase interne (HIPE) Isabelle Capron,
Hervé Bizot, Bernard Cathala Brevet FR 11 534 36 du 27 Mais 2011.
11
Institut Jean Pierre Bourgin
INRA Versailles
Thierry Chardot
Responsable d’équipe
Mail : [email protected]
Tel : 01 30 83 32 26
Parcours professionnel :
•
•
•
•
2010 Co Animateur du pôle « Reproduction Graines » de l’Institut Jean Pierre
Bourgin (5 équipes), et responsable de l’équipe « Dynamique et Structure des Corps
Lipidiques » (12 permanents), INRA Versailles,
2008-2010 Directeur de l’UMR INRA AgroParisTech « Chimie Biologique » (30
permanents) , Thiverval Grignon
2002-2010 Responsable de l’équipe « Biologie Structurale des Oléosomes » (5
permanents), Thiverval-Grignon
1990-1992 Post Doctorat à l’Université de Californie à Riverside, Etats Unis
Domaines de compétences :
•
•
•
•
Métabolisme des lipides chez les plantes oléagineuses, levures, et microorganismes
Ingénierie métabolique
Protéomique d’organites et de protéines hydrophobes
Méthodes biophysiques d’étude des protéines et enzymes
Animation, gestion de collectifs et de projets.
•
•
•
•
•
•
Création et animation d’une équipe
Direction d’un laboratoire et organisation de la fusion avec 4 autres laboratoires)
Montage de projets partenariaux public-public et public-privé.
Coordination de projets ANR (Génoplante, Chimie pour le Développement Durable)
et Synchrotron SOLEIL
Responsable de tâches de projets ANR (Bioénergie, Génoplante)
Participation a l’animation du groupe partenariat innovation LABEX Saclay Plant
Sciences
Diplômes et formations :
• 1997 : Habilitation à diriger les recherches
•
•
1990 : Thèse de Doctorat AgroParisTech
1986 : DEA enzymologie Aix Marseille II
Recherches actuelles :
J’anime une équipe qui s’intéresse aux oléosomes, organites de stockage des lipides de réserve
de plantes (A. thaliana et B napus), et de levures (S. cerevisae et Y.lipolytica). Les approches
mises en œuvre vont de l’identification des protéines et des lipides, aux études de biologie
structurale, d’interactions et de fonction. Il s’agit d’accroître les connaissances génériques sur
les protéines des oléosomes (structure, organisation, rôle). Nous cherchons aussi à répondre à
des questions plus finalisées ou d’intérêt pour la communauté scientifique avec des approches
originales de solubilisation et d’étude de protéines membranaires. Les questions finalisées
concernent la modulation de la quantité et de la nature des lipides produits et la facilitation de
l’extraction des réserves lipidiques des graines dans le contexte de la « chimie verte ».
12
Autres activités :
Participation à des comités d’expertise
Evaluation de projets de recherche, Européens, Canadiens, Roumains, Français (ANR, ADEME)
Evaluation de projets internationaux (comité de programme Biologie du Synchrotron SOLEIL)
Evaluation d’unités de recherche (AERES)
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
Etude des corps lipidiques de graines plantes oléagineuses (matures ou en développement)
1) Jolivet, P., Boulard, C., Bellamy, A., Valot, B., d'Andrea, S., Zivy, M., Nesi, N., and Chardot, T. (2011). Oil
body proteins sequentially accumulate throughout seed development in Brassica napus. J Plant Physiol
168, 2015-2020.
2) Popluechai, S., Froissard, M., Jolivet, P., Breviario, D., Gatehouse, A.M.R., O’Donnell, A. G., Chardot, T.
and Kohli, A. (2011) Understanding Jatropha curcas seed oil storage components: characterization of
seed oilbody oleosins. Plant Phys Biochem 49, 352-356
3) Jolivet, P., Boulard, C., Bellamy, A., Larre, C., Barré, M., Rogniaux, H., D'Andrea, S., Chardot, T., Nesi, N.
(2009) Protein composition of oil bodies from mature Brassica napus seeds. Proteomics 9, 3268-3284.
Extraction des lipides des graines
4) Miquel, M., Nesi, N., Paris, N., Larre, C., Quinsac, A., Savoire, R., Lanoiselle, J.-L., Jolivet, P., and Chardot,
T. (2011). A continuum of research projects to improve extraction of oil and proteins in oilseed plants.
Oléagineux Corps gras Lipides, 18, 168-172
5) Savoire, R., Quinsac, A., Chardot, T., Miquel, M., Nesi, N., Lanoisellé J-L, Vorobiev, E. (2010) Micropressing of rapeseed Brassica napus L. and Arabidopsis thaliana seeds for evaluation of the oil
extractability. Oléagineux Corps gras Lipides 17: 115-19
Identification, études structure fonction de protéines de corps lipidiques de plantes et de levures
6) Vermachova, M., Purkrtova, Z., Santrucek, J., Jolivet, P., Chardot, T., and Kodicek, M. (2011). New
protein isoforms identified within Arabidopsis thaliana seed oil bodies combining chymotrypsin/trypsin
digestion and peptide fragmentation analysis. Proteomics 11, 3430-3434.
7) Gohon, Y., Vindigni, JD., Pallier, A., Celia, H., Giuliani, A., Wien, F., Tribet, C., Chardot T., P. Briozzo,
(2011) High water solubility and folding in amphipols of integral proteins with large hydrophobic
regions: oleosin and caleosin from seed lipid bodies. BBA, 1088: 707-716
8) Froissard, M., D'Andrea, S., Boulard, C., Chardot, T. (2009) Heterologous expression of AtClo1, a plant
oil body protein, induces lipid accumulation in yeast. FEMS Yeast Res 9, 428-438
Brevet
9) Nicaud J.M. Chardot T., Beopoulos A. (2008) Nouvelles souches de levures mutantes capables
d’accumuler une grande quantité de lipides Brevet FR 08.54786
13
Dr. Paul COLONNA
Directeur
Institut Carnot 3BCAR, INRA
Mail : [email protected]
Tel : 01-42-75-93-64 ou 02-40-67-51-45
Parcours professionnel :
Chef de Département du 1er mars 2004 au 30 avril 2008
Département Caractérisation et Elaboration des Produits issus de l’ :Agriculture, comprenant
569 agents permanents de l’INRA, dont 286 scientifiques (chercheurs et ingénieurs) et 204
personnels administratifs. 28 unités de recherches localisées à Avignon, Clermont-Ferrand,
Dijon, Paris, Marseille, Montpellier, Nantes, Reims, Rennes.
2008 – 2010 : Directeur scientifique adjoint Plantes et Produits du Végétal,
Depuis mars 2010 : Délégué scientifique Développement Durable, Directeur du réseau
Bioénergies, Biomolécules et Biomatériaux du Carbone Renouvelable
2011-2012 : Professeur associé à temps plein, Chaire Développement durable au Collège de
France pour l’année académique
2012 - présent : Directeur scientifique adjoint Alimentation
Activités d’expertise :
•
•
•
•
•
•
•
Président du Comité d’évaluation du Programme Alimentation et Industries Alimentaires
(ALIA) à l’Agence Nationale de la Recherche (ANR) 2009-2011.
Membre du comité de pilotage du Programme Chimie et Procédés pour le Développement
Durable (2006-2009), puis Chimie Durable - industries – Innovation, puis Bio-Matières et
Energies depuis 2011.
Président du Comité de Pilotage Scientifique de Futurol (éthanol de deuxième génération).
Président du Comité scientifique du programme BIP Bioressources, Industries et
performances à l’ADEME
Membre du Conseil Scientifique de l’IFP Energies Nouvelles
Membre du Conseil Scientifique d'Agropolis Fondation
Président du Strategic Steering Committee de Toulouse White Biotechnologies (TWB)
Diplômes et formations :
1977 – 1984 : Doctorat d'Etat ès Sciences Physiques Paris VI, July 5, 1984. Directeur :
Professeur C. Quiveron, ESPCI, Paris
1974 – 1975 : D.E.A. de Nutrition, Université Paris VI (1975).
1972 – 1975 : Ingénieur Agronome, Institut National Agronomique Paris- Grignon (1975).
14
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
•
•
•
130 publications primaires dans des journaux (avec referees) ; h factor 39.
26 revues et chapitres d’ouvrages, 6 coordination d’ouvrages
281 communications and posters dans des congrès scientifiques.
•
Membre des comités d’édition des journaux scientifiques :
- Journal of Cereal Science, Ed. Academic Press., depuis 1988
- IAA depuis1-1-2001
- Sciences et Techniques Agro-Alimentaires (Ed.Technique et Documentation, LAVOISIER)
•
Membre élu de l’International Academy of Food Science & Technology (IAFoST)
15
UMR IATE
Dr. Hugo de Vries
Directeur UMR IATE
Mail : devriesupagro.inra.fr
Tel : 04 99.61.28.31
-
Parcours professionnel :
Director Joint Research Centre IATE; Research Director INRA 09/2010 - …
Manager Food Technology Centre, Wageningen UR 04/2006 – 08/2010
Director strategy & commercial affairs, Business Unit Food Quality, ATO BV.
10/1999 – 04/2006
Domaines de compétences :
Agro polymères (aliments et biomatériaux), technologies émergentes
(fractionnement , structuration, préservation, emballage, ..)
Diplômes et formations :
Dr. en physique, formation dans les domaines ‘agro-alimentaire, physiologie environnement, génie des procédés, innovation, …
Recherches actuelles :
Agropolymères et technologies émergentes
-
Autres activités (récent):
Contribution et animation des programmes internationales autour de
l’innovation et la recherche fondamentale
Board member of the Chair UNESCO ‘alimentation durable’ (April 2012 - ….)
Co-responsible training program technology innovation, SupAgro ISAM/IPAD
(2011 - …)
Board Member of the European Federation of Food Science and Technology;
(2011 - …)
Science board conference Biorefinery for Food, Fuel and Materials, 2013 The
Netherlands
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
Vries, HSM de, Boekel, Linnemann, (2009) Current systems and future scenarios
in food processing, in ESF/COST Forward Look on European Food Systems in a
Changing World; Eds: R. Rabbinge, A. Linnemann
Vries HSM de, Matser A. (2011, as Eds) Final Publishable Report NovelQ, Novel
processing methods for the production and distribution of high-quality and safe
foods. European Commission, Nr 015710, P. 1 – 140
Vries HSM de (2011) A border crossing debate for a viable planet; New Food,
Volume 14, Issue 6
16
UMR IATE – Ingénierie des agropolymères
et technologies émergentes – Montpellier
Pr Eric DUBREUCQ
Mail : [email protected]
Tel : +33 4 99 61 23 64
Parcours professionnel :
2010: Professeur 1ère cl. de Biotechnologie microbienne et enzymatique,
Montpellier SupAgro
2000-2010 : Professeur 2ème cl. de Biotechnologie microbienne et
enzymatique, Montpellier SupAgro
1998-1999 : Chercheur invité, Institut de recherche en biotechnologie du
CNRC, Montréal, Qc, Canada
1991-1999 : Maître-assistant en Microbiologie industrielle, ENSA
Montpellier
1990-1991 : Chargé de recherche, Institut Agronomique Méditerranéen,
Montpellier
1989-1990 : Coopérant Attaché scientifique, Ambassade de France en
Israël
Domaines de compétences :
Génie microbiologique et enzymatique, biotechnologie des lipides et
polymères hydrophobes,
chimie verte
Diplômes et formations :
1998 : Habilitation à Diriger des Recherches, « Biotechnologie des lipides »,
Université Montpellier 2
1989 : Doctorat en sciences agro-alimentaires, ENSA Montpellier
1987 : Diplôme d’ingénieur agronome, option physiologie et génétique des
microorganismes, ENSA Montpellier
1987 : Diplôme d’études approfondies en sciences des aliments, Université
Montpellier 2
Recherches actuelles :
Sélection, étude, ingénierie et mise en œuvre de microorganismes et enzymes
pour la biotechnologie des lipides et l’obtention de polymères biosourcés.
Biotechnologie du caoutchouc naturel.
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Autres activités :
-
Co-responsable de l’axe « Biotechnologie microbienne et enzymatique des
agropolymères », UMR IATE
-
Responsable de l’équipe de Génie microbiologique et enzymatique du
département des sciences pour les agro-bioprocédés de Montpellier
SupAgro
-
Responsable de la halle de biotechnologie UMR IATE – UMR SPO
,Responsable de la plateforme scientifique structurante « LipPol-Green » de
caractérisation des lipides et polymères hydrophobes
(http://www.supagro.fr/plantlippol-green/)
Responsable de l’option de dernière année d’études d’ingénieur « Chimie et
bioprocédés pour un développement durable » commune à Montpellier SupAgro
et à l’ENS Chimie de Montpellier
-
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
• Durand E., Lecomte J., Barea B., Piombo G., Dubreucq E. and Villeneuve P. (2012) Evaluation of
deep eutectic solvents as new media for Candida antarctica B catalyzed reactions. Process
Biochem., sous presse
• Saithai P., Lecomte J., Dubreucq E. and Tanrattanakul V. (2012) Bioplastic nanocomposite
prepared from acrylated epoxidized soybean oil-PMMA copolymer and nano-titanium dioxide.
Adv. Sci. Lett., sous presse
• Aouf C., Lecomte J., Villeneuve P., Dubreucq E. and Fulcrand H. (2012) Chemo-enzymatic
functionalization of gallic and vanillic acids. Synthesis of novel bio-based epoxy resins
prepolymers. Green Chem. 14, 2328-2336.
• Dubascoux S., Thepchalerm C., Dubreucq E., Wisunthorn S., Vaysse L., Kiatkamjornwong S.,
Nakason C. and Bonfils F. (2012) Comparative study of the mesostructure of natural and
synthetic polyisoprene by size exclusion chromatography-multi-angle light scattering and
asymmetrical flow field flow fractionation-multi-angle light scattering J. Chromatogr. A. 1224, 2734.
• Vernhet A., Dubascoux S., Cabane B., Fulcrand H., Dubreucq E. and Poncet-Legrand C. (2011)
Characterization of oxidized tannins: comparison of depolymerization methods, asymmetric flow
field-flow fractionation and Small Angle X-Ray Scattering. Anal. Bioanal. Chem. 401, 1563-1573.
• Saithai P., Tanrattanakul V., Chinpa W., Kaewtathip K. and Dubreucq E. (2011) Synthesis and
characterization of triglyceride-based copolymer from soybean oil. Mater. Sci. Forum. 695, 320323.
• Liengprayoon S., Sriroth K., Dubreucq E. and Vaysse L. (2011) Glycolipid composition of Hevea
brasiliensis latex. Phytochemistry. 72, 1902-1913.
• Husson E., Humeau C., Harscoat C., Framboisier X., Paris C., Dubreucq E., Marc I. and Chevalot I.
(2011) Enzymatic acylation of the polar dipeptide carnosine: reaction performances in organic
and aqueous media. Process Biochem. 46, 945-952.
• Tecelao C., Silva J., Dubreucq E., Ribeiro M. H. and Ferreira-Dias S. (2010) Production of human
milk fat substitutes enriched in omega-3 polyunsaturated fatty acids using immobilized
commercial lipases and Candida parapsilosis lipase/acyltransferase. J. Mol. Catal. B Enzym. 65,
122-127.
• Saddoud A., Sari T., Rapaport A., Lortie R., Harmand J., Dubreucq E. (2010) A mathematical study
of an enzymatic reaction in non homogeneous reactors with substrate and product inhibition:
application to cellobiose hydrolysis in a bioreactor with a dead-zone. IFAC PapersOnline, p. 209214
• Intapun J., Sainte-Beuve J., Bonfils F., Tanrattanakul V., Dubreucq E. and Vaysse L. (2010) Effect of
microorganisms during the initial coagulum maturation of hevea natural rubber. J. Appl. Polym.
Sci. 118, 1341-1348.
18
• Osorio N. M., Dubreucq E., da Fonseca M. M. R. and Ferreira-Dias S. (2009)
Lipase/acyltransferase-catalysed interesterification of fat blends containing n-3 polyunsaturated
fatty acids. Eur. J. Lipid Sci. Technol. 111, 120-134.
• Osorio N. M., Dubreucq E., da Fonseca M. M. R. and Ferreira-Dias S. (2009) Operational stability of
immobilised lipase/acyltransferase during interesterification of fat blends. Eur. J. Lipid Sci.
Technol. 111, 358-367.
• Intapun J., Sainte-Beuve J., Bonfils F., Tanrattanakul V., Dubreucq E. and Vaysse L. (2009)
Characterization of natural rubber cup coagula maturation conditions and consequences on dry
rubber properties. J. Rubber Res. 12, 171-184.
• Cambon E., Bourlieu C., Salum T. F. C., Piombo G., Dubreucq E. and Villeneuve P. (2009) Ability of
Vasconcellea x heilbornii lipase to catalyse the synthesis of alkyl esters from vegetable oils.
Process Biochem. 44, 1265-1269.
• Tiran C., Lecomte J., Dubreucq E. and Villeneuve P. (2008) Chemo-enzymatic epoxidation of fatty
compounds – focus on processes involving a lipase-catalyzed perhydrolysis step., OCL. 15, 179183.
• Rodphukdeekul S., Liengprayoon S., Santisopasri V., Sriroth K., Bonfils F., Dubreucq E. and Vaysse
L. (2008) Effect of smoking on lipids content, macromolecular structure and rheological
properties of Hevea brasiliensis sheet rubber. Kasetsart J. (Nat. Sci.). 42, 306-314.
• Liengprayoon S., Bonfils F., Sainte-Beuve J., Sriroth K., Dubreucq E. and Vaysse L. (2008)
Development of a new procedure for lipid extraction from Hevea brasiliensis natural rubber. Eur.
J. Lipid Sci. Technol. 110, 563-569.
Brevets:
• Dubois J.-L., Bourlieu-Lacanal C., Lecomte J., Dubreucq E. and Villeneuve P. (2012) Method for
producing ricinoleic acid ester by selective enzymatic transesterification. Patent
US20120065419.
• Kempers P., Schörken U., Gutsche B., Wolf T., Dubreucq E. and Moreau B. (2011) Method for
producing esters of short-chains alcohols from triglyceride-rich oils. Patent application
EP2298727A1.
• Weiss A., Müller M., Dubreucq E. and Moulin G. (2010) Emulsions in enzymatic reactions. Patent
US20100323415.
• Dubreucq E., Weiss A., Gutsche B., Fabry B. and Moulin G. (2010) Process for the production of
fatty acid alkyl esters by integrating alcoholic fermentation and esterification. Patent
US20100234458, CA2654585.
• Dubois J.-L., Bourlieu-Lacanal C., Lecomte J., Dubreucq E. and Villeneuve P. (2010) Procédé de
production d'ester d'acide ricinoléique par transestérification enzymatique. Patent
WO2010100366, FR2010050314.
• Dubreucq E., Weiss A. and Moulin G. (2007) Polypeptides with perhydrolase activity. Patent
application EP1847599A1 Patent EP1847599.
• Dubreucq E., Weiss A., Gutsche B., Fabry B. and Moulin G. (2007) Process for the production of
fatty acid alkyl esters. Patent WO07140862, EP1865048.
• Dubreucq E., Weiss A. and Molitor J.-P. (2006) Use of PIT-emulsions in biocatalytic reactions with
lyases and oxidoreductases. Patent application C 3032 PCT/EP/16.02.2005 Patent
WO2006087119, EP1848809, DE102005007174.0, US2008227170A1.
• Dubreucq E., Weiss A., Müller M. and Moulin G. (2005) Use of PIT emulsions in enzymatic
reactions. Patent DE10337451A1, EP04008770, WO2005017142, US20100323415A1.
• Dubreucq E., Bigey F., Moulin G. and Weiss A. (2003) Lipase/acyltransferase. Patent
EP1275711A1, WO03006644, CA2403025, US2004142441.
19
Dr. Claire DUMAS
Chargée de recherche
Laboratoire
de
Biotechnologie
l’Environnement (LBE), INRA
de
Mail : [email protected]
Tel : 04 68 42 51 76
Parcours professionnel :
Depuis Septembre 2008 : Chercheur au Laboratoire de Biotechnologie de l’Environnement
(LBE) - Narbonne
2007-2008 : Post-doctorat en GPE - Laboratoire d’Ingénierie des Systèmes Biologiques et des
Procédés (LISBP)-Toulouse Etude et modélisation de la digestion anaérobie des boues : effet
d’un co-traitement aérobie hyperthermophile sur la biodégradabilité des boues
2004-2007 : Doctorat en GPE - Laboratoire de Génie Chimique (LGC) –Toulouse Catalyse
électromicrobienne dans les piles à combustible
Domaines de compétences :
•
•
•
Génie de procédés/ bioprocédés
Digestion anaérobie des résidus solides, co-digestion
Biodégradabilité, bioaccessibilité de la biomasse lignocellulosique, caractérisation de la
matière organique
Diplômes et formations :
2004-2007 : Doctorat en Génie des Procédés et de l’Environnement (GPE) de l’Institut
National Polytechnique (INP) – Toulouse
2001-2004: Diplôme d’ingénieur et DEA en GPE. Institut National des Sciences Appliquées
(INSA) – Toulouse.
1999-2001 : Institut National des Sciences Appliquées (INSA) – Rouen
1999: Baccalauréat scientifique. Lycée Notre Dame de Bon Secours- Perpignan.
Recherches actuelles :
•
•
•
•
digestion anaérobie des résidus solides
procédé de méthanisation par voie sèche
bioaccessibilité des résidus lignocellulosiques
valorisation de macro-algues en biométhane
Active participation aux projets de recherches (projet ANR)
2009/2012: ANAMIX: Caractérisation des paramètres rhéologiques et des transferts pour
l'amélioration des procédés de méthanisation par voie sèche
2009/2012: WIN SEA FUEL: Production de macro-algues en mer pour une valorisation
intégrée de biocarburant
2012-2015: STOCKACTIF: Stockage actif de la biomasse pour faciliter sa transformation
industrielle
20
Autres activités :
•
•
•
Enseignements –Institut Universitaire Technologique de Génie chimique de Toulouse
(2004-2008) et de Narbonne (2008-2012) et INSA (Excel/Access and électrochimie) –
Toulouse (2004-2008)
Reviewer d’articles dans Applied Microbiology and Biotechnology, Bioresource technology,
Waste management et Biosystems Engineering.
Participation à des jurys de concours de maître de conférences
Principales communications scientifiques et présentations dans le domaine:
•
•
•
•
•
•
•
•
Abbassi-Guendouz A, Brockmann D, Trably E, et al. (2012) Total solids content drives high solid
anaerobic digestion via mass transfer limitation. Bioresource Technology 111:55-61. doi:
10.1016/j.biortech.2012.01.174
Carrère H, Dumas C, Battimelli A, et al. (2010) Pretreatment methods to improve sludge anaerobic
degradability: a review. Journal of hazardous materials 183:1-15. doi:
10.1016/j.jhazmat.2010.06.129
Dumas C, Perez S, Paul E, Lefebvre X (2010) Combined thermophilic aerobic process and
conventional anaerobic digestion: effect on sludge biodegradation and methane production.
Bioresource technology 101:2629-36. doi: 10.1016/j.biortech.2009.10.065
Monlau F, Barakat A, Trably E, et al. (2011) Lignocellulosic materials into Biohydrogen and
Biomethane: impact of structural features and pretreatment. Critical Reviews in Environmental
Science and Technology. doi: 10.1080/10643389.2011.604258
Quéméneur M, Bittel M, Trably E, et al. (2012) Effect of enzyme addition on fermentative hydrogen
production from wheat straw. International Journal of Hydrogen Energy. doi:
10.1016/j.ijhydene.2012.04.083
Dumas C., Ghizzi Damasceno da Silva G., Rouau X., Carrère H., Steyer J.-P.. Wheat straw milling effect
on biogas production. Lignobiotech one - 28 March-1st April 2010, Reims (FR).
Dumas C., Latrille E., Trably E., Steyer J.-P., Carrere H. Interest of anaerobic digestion for bioenergy
production from biomass COST Action CM0903 UBIOCHEM – Córdoba (SP)- 13-15 May, 2010.
Claire Dumas, M. Quéméneur, M. Bittel, E. Trably, L. Fourage, G. Ravot, J.P. Steyer and H. Carrère
Effect of enzyme addition on fermentative hydrogen production from wheat straw; International
Journal of Hydrogen Energy . (4-6 June 2012) Renewable resources and biorefineries Toulouse
(France)
21
Dr. Benoît GABRIELLE
Professeur, AgroParisTech
UMR INRA AgroParisTech Environnement et
Grandes Cultures
Mail : [email protected]
Tel : 01.30.81.55.51
Parcours professionnel :
• Visiting Scholar à l'Institute of Arable Crops Research (Angleterre) (1997) et à Cornell
Univerrsity (Ithaca, NY, USA) (1998)
• Chargé de Recherche à l’nstitut National de la Recherche Agronomique (1998-2007)
• Professeur en physique de l'environnement, AgroParisTech (2008)
Domaines de compétences :
Modélisation des agro-écosystèmes, évaluation environnementale, analyse en cycle de vie,
biomasse / bioénergie
Diplômes et formations :
•
•
•
•
Ingénieur de l’Ecole Centrale de Paris, spécialité énergétique (1993)
Diplôme d’Etudes Approfondies : Physique des fluides (1993)
Docteur de l’Ecole Centrale de Paris (1996)
Habilitation à Diriger des Recherches (HDR) (Université Paris VI, 20/01/06)
Recherches actuelles :
• Quantification et prévision des impacts environnementaux des cultures, intégrant les
émissions vers l’atmosphère (ammoniac, oxydes d’azote, gaz à effet de serre, pesticides),
vers les eaux (nitrates, pesticides), et le compartiment sol (matière organique)
• Modélisation des cycles bio-géochimiques dans les sytèmes sol-plante et expérimentations
au champ pour tester les modèles
• Analyses de cycles de vie et leur adaptation aux filières agricoles. Etude de deux grandes
filières : recyclage des déchets en agriculture et cultures à vocation énergétique.
Autres activités :
•
•
Participation au comité technique sur les évaluations en cycle de vie des biocarburants
(ADEME/Ministère de l'industrie, 2008/2009), aux prospectives 'Agriculture 2013' (INRACrédit Agricole-Groupama), et sur les stratégies de réduction des impacts des pesticides
(INRA/ENDURE) et des émissions de gaz à effet de serre agricoles (2012). Membre du
Comité de Gouvernance de l'ADEME sur le Bilan Carbone.
'Lead-author' du rapport spécial du GIEC (Groupe intergouvernemental d'experts sur
l'évolution du climat - IPCC) sur les énergies renouvelables pour la partie biomasseénergie.
22
•
•
Membre du comité d'évaluation du programme 'Bioénergie' de l'Agence Nationale de la
Recherche.
Membre du comité scientifique de la conférence ECOTECH (France, 2008), du 19th
Nitrogen Workshop (Italie, 2009), de l'European Biomass Conference (Milan, 2012), de la
conférence LCA Fodd (Saint-Malo, 2012). Membre du comité éditorial des revues
internationales Global Change Biology - bioenergy et Biofuels.
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine :
Gabrielle, B., Gagnaire, N. -2008 - Life-cycle assessment of straw use in bio-ethanol production: a case-study
based on deterministic modelling. Biomass and Bioenergy 32, 431-441.
Mamy, L.; Gabrielle, B. & Barriuso, E. Compared environmental balances of weeding programmes for
glyphosate -tolerant and non-tolerant crops Environ. Pollution, 2010, 158, 3172-3178
Gabrielle, B. How to ensure a reliable and sustainable supply of biomass feedstock? Invited Keynote
Lecture at the 1st LignoBioTech International Conference, Reims, France, 1 April 2010, 2010
Bessou, C.; Ferchaud, F.; Gabrielle, B. & Mary, B. Biofuels, greenhouse gases & climate change. A review.
Agron. Sustain. Dev., 2011, 31, 1-79
Lehuger, S.; Gabrielle, B.; Laville, P.; Lamboni, M.; Loubet, B. & Cellier, P. Predicting and mitigating the net
greenhouse gas emissions of crop rotations in Western Europe Agricultural Forest Meteorology, 2011,
151, 1654-1671.
Gabrielle, B.; Nguyen The, N.; Maupu, P. & Vial, E. Life-cycle assessment of eucalyptus short-rotation
coppices for bioenergy production in Southern France GCB Bioenergy, 2012, (in press)
23
Toulouse White Biotechnology (TWB)
Olivier Galy
Chef de Projet
Mail: [email protected]
Tel : +33(0)5 67 04 88 00
Historique : TWB a été créé en février 2012, lors de sa première assemblée
générale, et grâce au financement de l’Agence Nationale de la Recherche au titre
du programme Investissements d’Avenir. TWB est porté par l’INRA et un
composé d’un consortium regroupant 21 sociétés, 5 investisseurs, 9 organismes
publics régionaux ou organismes de recherche.
Domaines de compétences : TWB s’appuie sur les compétences des
laboratoires du LISBP (Laboratoire d’Ingénierie des Systèmes Biologiques et des
Procédés) de l’INSA de Toulouse. Les compétences couvrent des activités allant
de l’ingénierie biologique (ingénierie enzymatique et métabolique, biologie de
synthèse) à l’évaluation à l’échelle du pilote préindustriel.
Activités principales : TWB met en place des collaborations avec de nombreux
industriels dans ses domaines de compétences.
TWB participe à plusieurs projets industriels cofinancés par des fonds publics :
Syntacs pour la production d’additifs alimentaires, ProBio3 pour la production
de bio kérosène, Thanaplast pour le développement de bio polymères.
Recherches actuelles : TWB finance ses propres projets de développement
dans les domaines de la génération de biocarburants, bio polymères,
biomatériaux, et synthons par biologie de synthèse.
Plateformes technologiques : TWB a mis en place des plateformes
technologiques permettant de réaliser le continuum de la recherche de
nouveaux outils biologiques à la production préindustrielle. Ces plateformes
permettent
des productions et des sélections à haut débit de banques de
microorganismes, de méta génomes et de variant d’enzymes pour optimiser la
production de composés d’intérêt, des cultures microbiennes et des
biotransformation pour l’étude et l’optimisation de la conversion des matières
premières carbonées.
Ces approches sont accompagnées par l’évaluation environnementale, ainsi que
l’évaluation de l’acceptation éthique et sociétale des projets.
24
Dr. Alain GUIBERT
Directeur
CRT/CRITT Bio-Industries
Mail : [email protected]
Parcours professionnel :
De 1983 à 2004 : Société Béghin-Say - Direction de la Recherche :
Responsable du site de Toulouse spécialisé en synthèse enzymatique et techniques séparatives.
Directement rattaché au Directeur de la Recherche.
Depuis 2004 : Directeur du CRT/CRITT Bio-Industries
• Administrer le CRT/CRITT BIO-Industries
• Diriger les recherches menées en partenariat avec des industriels
• Encadrement de 18 personnes et gestion d’un budget de 1 500 k€ pour le CRITT.
De 2007 à 2011 : Directeur du SAIC INSATRANSFERT
Gérer les activités industrielles et commerciales de l’INSA de Toulouse directement
liées à la recherche menée dans l’établissement et à sa valorisation
Domaines de compétences :
Biotechnologie blanche, transfert de technologies, changement d’échelle et industrialisation
de procédés
Diplômes et formations :
1983 : Doctorat en microbiologie de l’Institut National des Sciences Appliquées de Toulouse
Directeur de thèse : Professeur Pierre Monsan
1981 : Diplôme d’Ingénieur de l’Institut National des Sciences Appliquées de Toulouse –
Option Génie Biochimique et Alimentaire
Recherches actuelles :
Recherche partenariale dans le domaine de compétences
Principales réalisations :
•
•
•
•
•
•
Mise au point et industrialisation d’un procédé de production de sucre à partir de fruits
déclassés – nominal 10 000 t/an (2008)
Mise au point et industrialisation d’un procédé de production de sucre inverti – nominal
5000 t/an (2000)
Mise au point et industrialisation d’un procédé discontinu de production d’isomaltulose nominal 10000 t/an (1997)
Mise au point et industrialisation d’un procédé de production de prébiotique à destination
humaine : Actilight - nominal 4 000 t/an (1995)
Mise au point et industrialisation d’un procédé de production de prébiotique à destination
animale : Profeed R – nominal 2 000 t/an (1988)
Création et démarrage du site de Recherche de Toulouse (1983)
Publications : 18 articles internationaux et 3 brevets
25
Dr. Herman HOFTE
Directeur de Recherche
Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR1318 INRAAgroParisTech
Mail : [email protected]
Tel : 01 30 83 33 90
Parcours professionnel :
2002-2009 : INRA, Directeur du Laboratoire de Biologie Cellulaire (85 employés)
Depuis 1997 : Directeur de Recherche
1992-1997 : INRA, centre de Versailles : Chargé de recherche
1989-1992 : University of California San Diego (USA), séjour postdoctoral : (EMBO)
1984-1989: « Plant Genetic Systems » Gand (B)
Domaines de compétences :
•
•
•
Biologie Cellulaire et physiologie végétale
Paroi cellulaire
Génétique moléculaire, génomique Arabidopsis, Brachypodium
Diplômes et formations :
•
•
PhD Biologie, Université de Gand (B), ”Insecticidal Crystal Proteins in Bacillus
thuringiensis”. promoter Marc Van Montagu : 1988
HDR Université PXI, Orsay : 1996
Recherches actuelles :
•
•
•
Synthèse cellulose, pectines
Contrôle de l’intégrité de la paroi primaire
Manipulation de la composition pariétale dans des graminées
Autres activités :
•
•
•
•
•
Coordinateur du projet « Investissement d’Avenir » : « Biomasse pour le futur »
(subvention 10M€, 8 ans)
Membre de « l’Editorial Board » : Plant Cell ; Current Biology ; Biofuel Bioproducts and
Biorefining ; J Plant Research
Faculty of F-1000 « Section Head , Plant Cell Biology »
Membre de comités dévaluation AERES, ANR (Chimie Durable Industries Innovation), ATIP
(CNRS)
Membre de « Scientific Advisory Board » :
- Université Wageningen (NL), Plant Science Group, 2012
- Université Gand/VIB (B), Plant Systems Biology, 2012
- Australian Research Council, centre of excellence : Plant Cell Walls, 2012
- Université Gand, « Speerpunt, Biotechnology for a sustainable economy », 2011
- Umea Plant Science Centre (S), 2011
- Université Tübingen (All), ZMBP 2008-2010
26
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
93 publications à comité de lecture ; facteur H (web of science) : 47
•
•
•
•
•
•
•
•
Wolf, S., Hematy, K., and Hofte, H. (2012). Growth control and cell wall signaling in plants. Annu Rev
Plant Biol 63, 381-407.
Bischoff V, Desprez T, Mouille G, Vernhettes S, Gonneau M, Hofte H. 2011. Phytochrome regulation of
cellulose synthesis in Arabidopsis. Current Biology, 21 : 1821-1827.
Crowell EF, Timpano H, Desprez T, Franssen-Verheijen T, Emons AM, Hofte H, Vernhettes S. 2011.
Differential regulation of cellulose orientation at the inner and outer face of epidermal cells in the
Arabidopsis hypocotyl. Plant Cell 23: 2592-605
Peaucelle A, Braybrook SA, Le Guillou L, Bron E, Kuhlemeier C, Hofte H. 2011. Pectin-induced
changes in cell wall mechanics underlie organ initiation in Arabidopsis. Current Biology, 21 : 17201726.
The International Brachypodium Initiative, (2010). "Genome sequencing and analysis of the model
grass Brachypodium distachyon." Nature 463: 763-768.
Crowell, E.F., Bischoff, V., Desprez, T., Rolland, A., Stierhof, Y.D., Schumacher, K., Gonneau, M., Hofte,
H. and Vernhettes, S. (2009) Pausing of Golgi bodies on microtubules regulates secretion of cellulose
synthase complexes in Arabidopsis. Plant Cell, 21, 1141-1154.
Hématy, K., Sado, P-E., Van Tuinen, A., Rochange, S., Desnos, T., Balzergue, S., Pelletier, S., Renou, J-P.,
and Höfte, H. (2007) A Receptor-Like Kinase mediates the response of Arabidopsis cells to the
inhibition of cellulose synthesis. Current Biology, 17, 922-931.
Mouille, G., Robin, S., Lecomte, M., Pagant, S., and Höfte, H. (2003). Classification and identification of
Arabidopsis cell wall mutants using Fourier Transform InfraRed (FT-IR) microspectroscopy. Plant
Journal, 35, 393-404.
Conférences sélectionnées 2011-2012
27/1/11
Louvain
Neuve
la Belgian
Arabidopsis
Root
Network ,
International
Symposium
24/2/11
Paris
Salon de l’Agriculture
28/2/11
Grignon
Conference Global Research
Alliance
16-21/4/11 Wageningen Botanical Microscopy Meeting
29/8Paris
Biorefinery Summerschool
2/9/11
9/2/12
Paris
Collège de France, séminaire
24/2/12
Paris
13/3/12
Paris
4/6/12
Groningen
(NL)
Melbourne
11/6/12
Developmental regulation of wall synthesis
and remodeling
Des Plantes pour le Futur
Biomass crops for the future
Cellulose synthesis and growth control
Tailoring Plants for Biorefinery Uses
L’adaptation
de
la
biomasse
lignocellulosique à ses usages
Colloque « Molecular Farming » Biotechnologie verte : applications nonAgroParisTech
pharmaceutiques
Academie
des
Sciences : Co-organisator, Synthèse et remodelage
Colloque : « Détermination de la de la paroi chez les plantes
forme cellulaire :
Evolution convergente de la
paroi chez les bactéries,
champignons et plantes »
Summer course Glycosciences
Biosynthesis of Plant Cell Wall Glycans
University of Melbourne
"Control of cell wall integrity during
growth"
27
Dr. Carole JOUVE
Laboratoire d’ingénierie des systèmes et des
procédés (LISBP)
Mail : [email protected]
Tel : 05 61 55 94 47
Parcours professionnel :
2008- présent : Professeur des Universités, 64ième section,
Département de Génie Biochimique Alimentaire, Institut National des Sciences
Appliquées de Toulouse,
Responsable Equipe de Génie Microbiologique
1999-2008 Maître de Conférences, 64ième puis 62ième section, PEDR (2007),Département de Génie Biochimique Alimentaire, Institut National des Sciences
Appliquées de Toulouse,
Responsable Equipe de Génie Microbiologique depuis janvier 2007
1993-1999 Maître de Conférences, 62 ième section, Institut Universitaire Professionnalisé
de Produits de Consommation Alimentaire, Université Aix Marseille III.
1992-1993 Attachée Temporaire d’Enseignement et de Recherche, Maîtrise des Sciences
et Techniques Produits de Consommation Alimentaire, Université Aix Marseille
III.
1991-1992
Maître Auxiliaire. Lycée Technique Pasquet. Arles.
1988-1991
Moniteur d’Enseignement, Ecole Nationale Supérieure d’Ingénieur de Génie
Chimique, Toulouse.
Domaines de compétences :
Génie des Bioprocédés, Génie Microbiologique, Fermentation, Bioenergie, Biotechnologies,
Chimie verte.
Diplômes et formations :
2008
2007
1991
1988
1987
Qualification aux fonctions de Professeur 62ieme section
Habilitation à Diriger des Recherches de l'Institut National Polytechnique de
Toulouse, Transferts et Réactions en milieux diphasiques pour intensifier les
performances des procédés. Soutenance le 23 janvier 2007, à l’Institut National
des Sciences Appliquées de Toulouse (31)
Thèse de l'Institut National Polytechnique de Toulouse, placée sous la
direction des Professeurs H. ANGELINO et G. LACOSTE, à l'Ecole Nationale
Supérieure des Ingénieurs de Génie Chimique de Toulouse. Soutenance le 15
Novembre 1991, Institut National Polytechnique de Toulouse (31).
Diplôme d'Etudes Approfondies de Génie Chimique de l'Institut National
Polytechnique de Toulouse (31)
Diplôme d'Ingénieurs de Génie Chimique de l'Ecole Nationale Supérieure
d'Ingénieurs de Génie Chimique de Toulouse (31)
28
Autres activités :
2011-13 : Vice-présidente du Comité d’évaluation ANR BioMe
2011-13 : co Directrice GDR CNRS Bioénergies
2008-13 : Membre Comité d’Evaluation ANR PNRBioEnergie
2010-13 : Membre Alliance ANCRE. Représentante CNRS/Bioenergies Voie microbienne.
2010 : Membre du Comité Scientifique du Congrès National de SFM Juin 2010
2009 : Membre du Comité d’Organisation et du Comité Scientifique de Atelier franco-ukrainien
"Biomasse &Energie" Octobre 2009
2008-10 : Membre de jury de recrutement INRA CEPIA CR et IR
2009 : Membre commission CNECA 3 - ministère agriculture
2008 -13: Reviewer pour Applied Biochemistry and Biotechnology et Bioprocess and
Biosystem
Engineering. Expertise Agrice/Ademe/ANR/COFECUB/AERES/CNRS/INRA
2007-13 : Responsable Equipe de Génie Microbiologique
2007-10 : Membre élue Conseil Scientifique Centre INRA Toulouse
2005-07 : Membre Comité d’Evaluation ANR PNRB
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
Publications:
• Assessment of Candida Shehatae viability by flow cytometry and fluorescent probes
Journal of Microbiological Methods acceptée pour publication en juillet 2012
J.MONTHEARD,S.GARCIER,E.LOMBARD,X.CAMELEYRE,S. GUILLOUET, C.MOLINA-JOUVE,
S.ALFENORE
• Comparison of the Transient Responses of Escherichia coli to a Glucose Pulse of Various
Intensities.
Applied Microbiology and Biotechnology (2012) (IF 3.28, Classement 41/160)
SUNYA, S., DELVIGNE, F., URIBELARREA, J. L., MOLINA-JOUVE C., GORRET, N.
• Transcriptomic Analyses during the Transition from Biomass Production to Lipid Accumulation in
the Oleaginous Yeast Yarrowia lipolytica
PLoS ONE 6((2011): e27966. doi:10.1371/journal.pone.0027966
MORIN N, CESCUT J, BEOPOULOS A, LELANDAIS G, LE BERRE V, URIBELARREA JL,
MOLINA-JOUVE C, NICAUD JM
• Real-time monitoring of metabolic shift and transcriptional induction of yciG:luxCDABE E.coli
reporter strain to a glucose pulse of different concentrations.
Journal of Biotechnology (2012), volume 157, issue 3, pp: 379- 390
SUNYA S, GORRET N, DELVIGNE F, URIBELARREA JL, MOLINA-JOUVE C
• Optimizing pressurized liquid extraction of microbial lipids using the response surface method.
J. Chromatography A (IF=4.1) 1218 (3), 373-379.
J. CESCUT, E. SEVERAC, C. MOLINA-JOUVE, J.L. URIBELARREA
• Effect of controlled oxygen limitation on Candida shehatae physiology for Ethanol Production
from xylose and glucose
Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology. (IF 1.919) 37 (5): 437-445
R. FROMANGER, S.E. GUILLOUET, J.L. URIBELARREA, C. MOLINA-JOUVE, X. CAMELEYRE
Brevets:
•
•
CNRS/Airbus 08/07252 « Nouveau procédé de culture de levures du genre Yarrowia »
EADS/INSA FR 11 59361 « Procédé de culture de levures oléagineuses sur substrat carboné »
29
Toulouse White Biotechnology (TWB)
Michel Manach
Business Development
Mail: [email protected]
Tel : +33(0)6 45 48 10 87
Historique : TWB a été créé en février 2012, lors de sa première assemblée
générale, et grâce au financement de l’Agence Nationale de la Recherche au titre
du programme Investissements d’Avenir. TWB est porté par l’INRA et un
composé d’un consortium regroupant 21 sociétés, 5 investisseurs, 9 organismes
publics régionaux ou organismes de recherche.
Domaines de compétences : TWB s’appuie sur les compétences des
laboratoires du LISBP (Laboratoire d’Ingénierie des Systèmes Biologiques et des
Procédés) de l’INSA de Toulouse. Les compétences couvrent des activités allant
de l’ingénierie biologique (ingénierie enzymatique et métabolique, biologie de
synthèse) à l’évaluation à l’échelle du pilote préindustriel.
Activités principales : TWB met en place des collaborations avec de nombreux
industriels dans ses domaines de compétences.
TWB participe à plusieurs projets industriels cofinancés par des fonds publics :
Syntacs pour la production d’additifs alimentaires, ProBio3 pour la production
de bio kérosène, Thanaplast pour le développement de bio polymères.
Recherches actuelles : TWB finance ses propres projets de développement
dans les domaines de la génération de biocarburants, bio polymères,
biomatériaux, et synthons par biologie de synthèse.
Plateformes technologiques : TWB a mis en place des plateformes
technologiques permettant de réaliser le continuum de la recherche de
nouveaux outils biologiques à la production préindustrielle. Ces plateformes
permettent
des productions et des sélections à haut débit de banques de
microorganismes, de méta génomes et de variant d’enzymes pour optimiser la
production de composés d’intérêt, des cultures microbiennes et des
biotransformation pour l’étude et l’optimisation de la conversion des matières
premières carbonées.
Ces approches sont accompagnées par l’évaluation environnementale, ainsi que
l’évaluation de l’acceptation éthique et sociétale des projets.
30
Dr. Valérie Méchin
Chargée de Recherche
Institut Jean-Pierre Bourgin, UMR 1318
INRA-AgroParisTech
Mail : [email protected]
Tel : 01.30.83.37.96
Parcours professionnel :
Depuis 2003, Chargée de Recherche à l’INRA dans le département CEPIA
(caractérisation et élaboration des produits issus de l’agriculture) en forte interaction avec le
département GAP (génétique et amélioration des plantes).
Domaines de compétences :
Biochimie et génétique de la lignification des parois végétales en relation avec leur
dégradabilité.
Diplômes et formations :
•
•
Doctorat en Génétique et Amélioration des plantes de l’Institut National Agronomique
de Paris-Grignon, 2000. Facteurs biochimiques et génétiques explicatifs de la variabilité
pour la valeur alimentaire du maïs fourrage.
Habilitation à Diriger des Recherches de l’Université Paris-Sud, 2012. Valorisation de la
biomasse lignocellulosique – Dégradabilité et lignification chez le maïs.
Recherches actuelles :
Impact de la composition biochimique des parois de graminées et de la répartition des
lignines au sein des tiges sur la dégradabilité
Etude de la structure des lignines et de la réticulation des parois de graminées par les
acides p-hydroxycinnamiques
Modélisation de la lignification
Qualité de la biomasse lignocellulosique, lignification et réponses au stress hydrique
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
Barrière Y., Méchin V., Lefèvre B., Maltèse S., 2012. QTLs for agronomic and cell wall traits in a
maize RIL progeny from a cross between an old Minnesota13 line and a modern Iodent
line. TAG, Online first 22 march 2012.
Zhang Y., Culhaoglu T., Pollet B., Melin C., Denoue D., Barriere Y., Baumberger S., and Méchin V.,
2011. Impact of lignin structure and cell wall reticulation on maize cell wall
degradability. JAFC, Journal of Agricultural and Food Chemistry 59 : 10129–10135.
Méchin V., Riboulet C., Guillaumie S., and Barrière Y., 2011. Investigating maize cell wall traits
for improvement of silage and biofuel production in Europe. In Advances in maize, Prioul JL
(Ed).
31
Demont-Caulet N., Lapierre C., Jouanin L., Baumberger S., and Méchin V., 2010. Peroxidasecatalyzed copolymerization of coniferyl and sinapyl alcohols: a kinetic approach of an
endwise process. Phytochemistry 71 (14-15) : 1673-1683.
Barrière Y., Méchin V., Riboulet C., Guillaumie S., Bosio M., Fabre F., Lapierre C., Pichon M., and
MartinantJ.P., 2009. Genetic and genomic approaches for improving biofuel production
from maize. Euphytica 170 (1-2) : 183-202.
Riboulet C., Guillaumie S., Méchin V., Bosio M., Pichon M., Goffner D., Lapierre C., Martinant J.P.,
and Barrière Y., 2009. Kinetic of phenylpropanoid gene expression in maize ear growing
internodes : relationships with cell wall deposition. Crop Science 49 (1) : 211-223.
Méchin V., Baumberger S., Pollet B., and Lapierre C., 2007. Peroxidase activity can dictate the
in vitro lignin dehydrogenative polymer structure. Phytochemistry 68, 571-579.
Barrière Y., Riboulet C., Méchin V., Maltese S., Pichon M., Cardinal A., Lapierre C., Lübberstedt T.,
and Martinant J.P., 2007. Genetics and Genomics of Lignification in Grass Cell Walls Based
on Maize as Model Species. Genes, Genomes and Genomics 1(2), 133-156.
Méchin V., Argillier O., Rocher F., Hébert Y., Mila I., Pollet B., Barrière Y. and Lapierre C., 2005.
In search of a maize ideotype for cell wall enzymatic degradability using histological and
biochemical lignin characterization. J. Agric. Food Chem. 53 : 5872-5881
Barrière Y., Ralph J., Méchin V., Guillaumie S., Grabber JH., Argillier O., Chabbert B., LapierreC.,
2004. Genetic and molecular basis of grass cell wall biosynthesis and degradability. II.
Lessons from brown-midrib mutants. Comptes Rendus Biologies 327 (9-10) : 847-860.
Méchin V., Argillier O., Hébert Y., Guingo E., Moreau L., Charcosset A., Barrière Y., 2001. Genetic
analysis and QTL mapping of cell wall digestibility and lignification in silage maize. Crop
Sci. 41 : 690-697.
Méchin V., Argillier O., Barrière Y., Mila I., Pollet B., Lapierre C., 2000. Relationships of cell wall
composition to in vitro cell wall digestibility of maize inbred line stems. J. Sci. Food Agric.
80 : 574-580.
32
Dr. Pierre MONSAN
Directeur
UMS Toulouse White Biotechnology
Mail : [email protected]
Tel : 06 75 03 87 83
Parcours professionnel :
1969
1973
1981
1984
1985
1989
1992
1993
2000
2002
2003
2008
2009
2012
Assistant, INSA Toulouse
Maître-Assistant, INSA Toulouse
Professeur 2ème Classe, INSA Toulouse
Fondateur/Directeur Scientifique société BioEurope, Toulouse (en délégation)
Professeur 1ère Classe, INSA Toulouse
Directeur Général, Président du Directoire, BioEurope, Toulouse
Directeur Scientifique BioEurope (Groupe Solabia)
Professeur, INSA Toulouse
Professeur à l’Ecole des Mines de Paris (responsable Option Biotechnologie)
Professeur Classe Exceptionnelle 1er Echelon, INSA Toulouse
Professeur Classe Exceptionnelle 2ème Echelon, INSA Toulouse
Membre Senior de l’Institut universitaire de France
Membre Senior renouvelé de l’Institut universitaire de France
Bénéficiaire de la Prime d’excellence scientifique
Directeur du démonstrateur pré-industriel « Toulouse White Biotechnology »
Domaines de compétences :
Biotechnologie, Biocatalyse, Enzymologie, Technologie enzymatique, Ingénierie moléculaire
d’enzymes
Diplômes et formations :
1965
1969
1970
1978
Baccalauréat Math. Elem., Montpellier (mention B)
Ingénieur INSA Toulouse option Chimie Biologique et Alimentaire (rang 1er)
Docteur Ingénieur, INSA Toulouse
Docteur d’Etat, Sciences Naturelles, Université P. Sabatier, Toulouse
Recherches actuelles :
Ingénierie moléculaire de glucane-saccharases
Synthèse enzymatique d’oligosides, polyosides et gluco-conjugués
Autres activités :
•
•
•
•
•
Professeur Mines ParisTech Option Biotechnologie
Membre fondateur de l’Académie des Technologies
Directeur-adjoint du LISBP-INSA
Représentant de la France auprès du Conseil de la Fédération Européenne des
Biotechnologie
Représentant de la France auprès de l’ « International Carbohydrate Society »
33
•
•
•
•
•
Membre du Conseil Scientifique du Projet « Innovative Bioproduction » de l’Université
de Kobe, Japon
Membre du comité d’experts de l’appel à projets « ERA-NET Industrial Biotechnology »
Membre du comité de pilotage de l’appel à projets « Chaires industrielles » de l’ANR
Membre du Conseil Scientifique de l’Ecole d’Ingénieurs de Purpan
Membre de l’Observatoire de la Biologie de synthèse du CNAM
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
Publications :
Moulis C., Joucla G., Harrison D., Fabre E., Potocki-Véronèse G., Monsan P., Remaud-Siméon M. (2006)
Understanding the polymerisation mechanism of glycoside-hydrolase of family 70
glucansucrases. J. Biol. Chem., 281, 31254-31267.
Guieysse D., Cortés J., Puech-Guenot S., Barbe S., Lafaquière V., Monsan P., Siméon T., André I., RemaudSiméon M. (2008) A structure-controlled lipase enantioselectivity investigated by a path
planning approach. ChemBioChem, 9, 1308-1317.
Champion E., André I., Moulis C., Boutet J., Descroix K., Morel S., Monsan P., Mulard L., Remaud-Siméon
M. (2009) Design of -transglucosidases of controlled specificities for programmed
chemo-enzymatic synthesis of antigenic oligosaccharides. J. Amer. Chem. Soc., 131, 73797389.
Monsan P., Remaud-Siméon M., André I. (2010) Transglucosidases as efficient tools for
oligosaccharide and glucoconjugate synthesis. Curr. Opin. Microbiol., 13, 293-300.
Tasse L., Bercovici J., Pizzut-Serin S., Robe P., Tap J., Klopp C., Cantarel B.L., Coutinho P.M., Henrissat B.,
Leclerc M., Doré J., Monsan P., Remaud-Siméon M., Potocki-Véronèse G. (2010) Functional
metagenomics to mine the human gut microbiome for dietary fiber catabolic enzymes.
Genome Res., 20, 1605-1612.
Serino M., Luche E., Gres S., Baylac A., Bergé M., Cenac C., Waget A., Klopp P., Iacovoni J., Klopp C.,
Mariette J., Bouchez O., Lluch J., Ouarné F., Monsan P., Valet P., Roques C., Amar J., Boulournié A.,
Théodorou V., Burcelin R. (2011) Metabolic adaptation to a high-fat diet is associated with a
change in the gut microbiota. Gut, 61, 543-553.
Guérin F., Barbe S., Pizzut S., Véronèse G., Guieysse D., Guillet V., Monsan P., Mourey L., Remaud-Siméon
M., Tranier S., André I. (2012) Structural investigation of the thermostability and product
specificity of amylosucrase from the bacterium Deinococcus geothermalis. J. Biol. Chem.,
287, 6642-6654.
Brison Y., Pijning T., Tranier S., Fabre E., Mourey L., Morel S., Potocki-Véronèse G., Monsan P., RemaudSiméon M., Dijkstra B. W. (2012) Functional and structural characterization of an -1,2
branching sucrase derived from DSR-E glucansucrase. J. Biol. Chem., 287, 7915-24.
Brevets :
Bozonnet S., Remaud-Siméon M., Willemot R.-M., Monsan P., 2001.- Molécules d’acides nucléiques
codant une dextrane saccharase catalysant la synthèse de dextrane portant des ramifications de
type alpha-1,2 osidiques. Brevet France n° 2 822 162 et Certificat d’utilité n° 2 822 163
(Déposant CNRS).
Monsan P., Valet P., Saulnier-Blache J.-S., Remaud-Siméon M., 2002.- Utilisation de pré-biotiques pour la
prévention de l’installation de diabète de type II. Brevet France n° 2 844 453 (Déposant INRA).
Monsan P., Remaud-Siméon M., Potocki-Véronèse G., Moulis C., 2006.- Construction de nouveaux variants de
l’enzyme dextrane-saccharase DSR-S par ingénierie moléculaire. Brevet France n° 2 897 069
(Déposant CNRS).
34
Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB)
UMR 1318 INRA/AgroParisTech
Dr Grégory Mouille
Responsable de la Plateforme de
Chimie du Végétal de l’IJPB
Mail : [email protected]
Tel : 01 30 83 33 91
Parcours professionnel :
-Actuellement : DR2 INRA, Responsable de la Plateforme de Chimie du Végétal de
l’Institut Jean-Pierre Bourgin et chercheur au sein de l’équipe Paroi Primaire et
Elongation Cellulaire
-1999/2003 : Post-doctorant à l’Institut Jean –Pierre Bourgin, INRA de Versailles.
Etude de la biosynthèse de la paroi chez Arabidopsis thaliana
-1998/1999 : Post-Doctorant au CSIRO of Plant Industry of Canberra (Australie).
Définition des fondements génétiques et biochimiques de la diversité variétale chez le
blé.
Domaines de compétences :
Biochimie des polysaccharides et Génétique végétale.
Diplômes et formations :
1994/1997 Doctorat Laboratoire de Chimie Biologique UMR 8576 CNRS & USTL,
Université de Lille 1. Biosynthèse de l’amidon chez l’algue unicellulaire
Chlamydomonas reinhardtii.
Recherches actuelles :
Dissection génétique des mécanismes d’adhésion cellulaire chez les plantes et étude du
rôle de la paroi au cours du développement.
Autres activités :
Coordination scientifique de la Plateforme de Chimie du Végétal de l’IJPB.
Plateforme analytique dédiée à l’analyse de composés issues des végétaux : métabolites
(I aires et II aires), hormones végétales, biomasse (Lignocellulosique et Lipides).
35
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
1. Peaucelle A., Louvet R., Johansen J.N., Salsac F., Morin H., Fournet F., Belcram K., Gillet F.,
Herman Höfte H., Laufs P., Mouille G. and Pelloux J. (2011). Transcription factor
BELLRINGER modulates phyllotaxis by regulating the expression of a pectin methyl
esterase in Arabidopsis. Development.
2. Pelletier S., Van Orden J., Wolf S., Vissenberg K., Delacourt J., Assoumou Ndong Y., Pelloux J.,
Bischoff V., Urbain A., Mouille G., Lemonnier G., Jean-Pierre Renou J.P. and Höfte H. (2010).
A role for pectin de-methylesterification in a developmentally regulated growth
acceleration in dark- grown Arabidopsis hypocotyls. New Phytologist. Vol. 188 (3), 726739
3. Peaucelle A., Louvet R., Johansen JN., Höfte H., Laufs P. Pelloux J. and Mouille G*. (2008)
Arabidopsis Phyllotaxis Is Controlled by the Methyl-Esterification Status of Cell-Wall
Pectins. Current Biology. Vol.18, 1–6.
4. Ralet M.C., Crépeau M.J., Lefèbvre J., Mouille G., Höfte H., and Thibault J.F. (2008). Reduced
number of homogalacturonan domains in pectins of an Arabidopsis Mutant enhances the
flexibility of the polymer. Biomacromolecules; Vol. 9: 1454-1460.
5. Mouille G.*, Ralet M.-C., Cavelier C., Eland C., Effroy D., Hématy, K., McCartney L., Truong
H.N., Gaudon V., Thibault J.-F., Marchant A., Höfte H. (2007) Homogalacturonan synthesis in
Arabidopsis thaliana requires a novel Golgi-localized protein with a putative methyltransferase domain. Plant Journal. Vol. 50, 605-614.
36
Dr. Michael J. O’DONOHUE
Directeur de Recherches
Laboratoire d’ingénierie des systèmes et des
procédés (LISBP)
Mail : [email protected]
Tel : 06 32 29 27 97
Parcours professionnel :
Octobre 1991 - Décembre 1991 - Postdoctorant au laboratoire de Biophysique, UniversitéPolytechnique de Portsmouth
Janvier 1992 - Décembre 1993 – Postdoctorant à l’INSERM U266, Faculté de Pharmacie,
Université Paris V
Décembre 1995 - Postdoctorant UR426, INRA-Jouy, Jouy-en-Josas
Janvier 1996 - Janvier 2006 – Chargé (et ensuite Directeur) de Recherches à l'UMR
URCA/INRA 614, Reims
Depuis septembre 2006 - Directeur de Recherches (INRA) affecté à l'UMR INSA/INRA 792,
Toulouse*
Depuis septembre 2008 - Chef de Département Adjoint du département CEPIA (INRA)
Domaines de compétences :
Biochimie des protéines ; biocatalyse-enzymologie ; biorafinnerie
Diplômes et formations :
1984-1987 Bachelor of Science (BSc hons) en Sciences Biomoléculaire – UniversitéPolytechnique de Portsmouth
1987-1991 Docteur en Biologie Moléculaire et Biocimie de protéines (PhD.)- UniversitéPolytechnique de Portsmouth (directeur Professor G. Geoff KNEALE)
2000 Habilitation à Diriger des Recherches -Université de Reims Champagne-Ardenne
Recherches actuelles :
Depuis mon recrutement à l’INRA en 1996, je développe des projets liés à l’ingénierie
d’enzymes impliquées dans la dégradation ou la modification des parois lignocellulosiques.
Spécialiste des hémicellulases, et donc des sucres à cinq carbones (les pentoses) mon activité
m’a conduit progressivement vers des projets ayant pour finalité le bioraffinage. Actuellement,
j’anime un groupe de recherche d’environ 12 personnes au sein de l’Unité LISBP, INSA
Toulouse. Mes recherches actuelles portent spécifiquement sur la découverte de nouvelles
enzymes pour la dégradation et la modification de la biomasse (hémicellulases, mais aussi
cellulases) et aussi sur l’ingénierie de ses enzymes pour le développement d’outils
biocatalytiques robustes aptes à un déploiement industriel. Depuis 2010, je coordonne un gros
projet européen (FP7 BIOCORE) focalisé sur la bioraffinerie et, par ailleurs, je suis chef adjoint
du département CEPIA (INRA).
37
Mots clefs: Ingénierie des enzymes; études structure-fonction; lignocellulases; bioraffinerie;
métagénomique fonctionnelle ; pentoses
Autres activités :
Actuellement je suis impliqué dans l’action européenne KIC Climate Change et je suis
régulièrement sollicité pour participer à des comités d’évaluation en France (ex. ANR et
ADEME) et à l’étranger (Université de Liège). J’ai été le créateur du congrès international
« Biomass-derived pentoses » qui serait en 2013 à sa troisième édition.
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
Auteur de plus de 50 publications des revues internationales.
Brevets :
Actuellement j’envisage de breveter plusieurs enzymes découvertes récemment. En
conséquence, je suis à la recherche de partenaires souhaitant exploiter ces inventions
Publications pour la période 2010-2012
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Song, L.; Laguerre, S., Dumon, C., Bozonnet, S. O’Donohue, M. J. (2010) A high throughput screening
system for the evaluation of biomass-hydrolyzing glycoside hydrolases. Biores. Technol. 101(21),
8237-8243. (WOS)
H. Bouraoui, I. Boukari, J. P. Touzel, M. O'Donohue and M. Manai. (2010) Caldimonas hydrothermale
sp nov., a novel thermophilic bacterium isolated from roman hot bath in south Tunisia. Archives of
Microbiology. 192 (6), 485-491. (WOS)
C. Dumon, L. Song, S. Bozonnet, R. Fauré, M. J. O’Donohue (2012) Progress and future prospects for
pentose-specific biocatalysts in biorefining. Proc. Biochem., 3, 345-554 (WOS)
Boukari, I., O’Donohue, M., Rémond, C. and Chabbert, B. (2011) Probing a family GH11 endo--1,4xylanase inhibition mechanism by phenolic compounds: Role of functional phenolic groups. J. Mol.
Catal. B. 72, 130-138. (WOS)
Bouraoui, H., Aissa, M.B., Abbassi, F., Touzel, J.-P., O'Donohue, M. and Manai, M. (2012)
Characterization of Deinococcus sahariens sp. nov., a radiation-resistant bacterium isolated from a
Saharan hot spring. Arch Microbiol. 194, 315–322 (WOS)
Bernard, L., Chapuis-Lardy, L., Razafimbelo, T., Razafindrakoto, M., Pablo, A.-L., Legname, E., Poulain,
J., Bruls, T., O'Donohue, M., Brauman, A., Chotte, J.-L. and Blanchart, Eric (2012) Endogeic
earthworms shape bacterial functional communities and affect organic matter mineralization in a
tropical soil. ISME J. 6(1), 213–222 (WOS) doi: 10.1038/ismej.2011.87
Boukari, I., Rémond, C., O’Donohue, M. and Chabbert, B. (2012) Effect of lignin content on a GH11
endoxylanase acting on glucuronoarabinoxylan-lignin nanocomposite. Carbohydr. Pol. (online 19th
March) (WOS)
Song, L., Siguier, B., Dumon, C., Bozonnet, S. and O'Donohue, M. J. (2012) Engineering better
biomass-degrading ability into a GH11 xylanase using a directed evolution strategy. Biotechnol
Biofuels 5:3
Boonvitthya, N., Burapatana, V., Bozonnet, S., O'Donohue, M. J. and Chulalaksananukul, W. (2012)
Comparison of the heterologous expression of Trichoderma reesei endoglucanase II and
cellobiohydrolase II in the yeasts Pichia pastoris and Yarrowia lipolytica. Mol. Biotechnol. DOI
10.1007/s12033-012-9557-0.
Paës, G., Cortés, J., Siméon, T., O'Donohue, M. J. and Tran, V. (2012) Thumb-loops up for catalysis: a
structure/function investigation of a functional loop movement in a GH11 xylanase. Comp. Struct.
Biotechnol. J. In press.
Borsenberger, V., Ferreira, F., Pollet, A., Desrousseaux, M-L., Massou, S., Courtin, C.M., O'Donohue, M.
J. and Fauré, R. (2012) A versatile and colorful screening tool for the identification of
arabinofuranose-acting enzymes. ChemBiochem. In press.
Texier, H., Dumon, C., Neugnot-Roux, V., Maestracci, M. and O’Donohue, M. Redefining XynA from
Penicillium funiculosum IMI 378536 as a GH7 cellobiohydrolase (2012) J. Ind. Micriobiol. Biotechnol.
In press
38
•
Arab-Jaziri, F. Bissaro, B., Barbe, S., Saurel, O. Débat, H., Dumon, C., Gervais, V., Milon, A., André, I.,
Fauré, R. and O'Donohue, M. J. The functional roles of H98 and W99 and β2α2 loop dynamics in the
α-L-arabinofuranosidase from Thermobacillus xylanilyticus. (2012) FEBS J. In press.
39
Dr. Denis POMPON
Directeur de recherche
Laboratoire d’ingénierie des systèmes et des
procédés (LISBP)
Mail : [email protected]
Tel : 05.67.04.88.06
Parcours professionnel :
Ingénieur Chimiste de formation suivit d’un doctorat dans le domaine des mécanismes
enzymatiques d’oxydo-réduction. Chercheur au CNRS (Sciences de la vie) depuis 1977.
Actuellement directeur de recherche responsable au LISBP d’une équipe d’une dizaine de
personnes dans le domaine de l’ingénierie métabolique et de l’ingénierie des protéines avec un
accent sur les chaines biologiques de transfert d’électrons et les systèmes membranaires
compartimentés impliqués dans la biosynthèse des stéroides, terpènoides et caroténoides.
Domaines de compétences :
Ingénierie des protéines et des assemblages moléculaires biologiques. Evolution dirigée des
protéines. Production de protéines hétérologues. Ingénierie métabolique des levures
(principalement métabolisme périphérique). Biologie de synthèse. Approches combinatoire
d’ingénierie et méthodes d’ingénierie des génomes faisant appel aux mécanismes de
recombinaison. Mécanismes d’auto-assemblage, nano-biotechnologies et approches molécule
unique. Biocapteurs.
Diplômes et formations :
Ingénieur Chimiste. Doctorat d’Etat es Sciences Naturelles.
Recherches actuelles :
Voies synthétiques artificielles de biosynthèse de caroténoïdes, d’oxystérols d’intérêt
thérapeutique et de triperpénoides. Glyco-conjugués de flavonoïdes et conversion de dioxyde
de carbone en molécules organiques d’intérêt dans des levures par utilisation d’énergies
décarbonées. Biocapteurs environnementaux.
Autres activités :
Consultant pour des sociétés de biotechnologie. Membres de conseils scientifiques
d’organismes (INRA, IFREMER), d’associations (FRM) ou d’instances d’évaluation (AERES,
Communauté européenne, revues scientifiques). Responsable de GDR (jusqu’à 2011).
Implication dans la structuration de la Biologie de Synthèse au niveau national. Participation à
des enseignements.
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Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
Publications :
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•
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•
Abecassis V., Pompon D. and Truan G. (2003) Producing chimeric genes by CLERY: in vitro and in
vivo recombination. Methods Mol. Biol. 231, 165-173.
Szczebara F. M., Chandelier C., Villeret C., Masurel A., Bourot S., Duport C., Blanchard S., Groisillier A.,
Testet E., Costaglioli P., Cauet G., Degryse E., Balbuena D., Winter J., Achstetter T., Spagnoli R.,
Pompon D. and Dumas B. (2003) Total biosynthesis of hydrocortisone from a simple carbon source
in yeast. Nat. Biotechnol. 21, 143-149.
Nthangeni M. B., Urban P., Pompon D., Smit M. S. and Nicaud J. M. (2004) The use of Yarrowia
lipolytica for the expression of human cytochrome P450 CYP1A1. Yeast. 21, 583-592.
Pompon D. and Laisne A. (2007) PDNA as building blocks for membrane-guided self-assemblies.
Biochem. Soc. Trans. 35, 495-497.
Taly V., Urban P., Truan G. and Pompon D. (2007) A combinatorial approach to substrate
discrimination in the P450 CYP1A subfamily. Biochim. Biophys. Acta. 1770, 446-457.
Jezequel L., Loeper J. and Pompon D. (2008) Sequence-independent construction of ordered
combinatorial libraries with predefined crossover points. BioTechniques. 45, 523-532.
Pompon D., Truan G. and Urban P. (2008) Ingénierie des cytochromes P450. Biofutur. 34-38.
Urban P., Truan G. and Pompon D. (2008) High-throughput enzymology and combinatorial
mutagenesis for mining cytochrome P450 functions. Expert Opin. Drug Metab. Toxicol. 4, 733-747.
Pompon D., Urban P. and Truan G. (2009) Differences in functional clustering of endogenous and
exogenous substrates between members of the CYP1A subfamily. The Open Drug Metabolism
Journal. 3, 17-30.
Aigrain L., Moréra S., Pompon D. and Truan G. (2009) Structure of the open conformation of a
functional chimeric NADPH cytochrome P450 reductase. EMBO Rep. DOI:10.1038/embor.2009.82.
Duval A, Laisné A, Pompon D, Held S, Bellemain A, Moreau J, Canva M. (2009) Polarimetric surface
plasmon resonance imaging biosensor. Opt Lett. 2009 Dec 1;34(23):3634-6. doi:
10.1364/OL.34.003634.
131. Kastelic D, Frković-Grazio S, Baty D, Truan G, Komel R, Pompon D . (2009) A single-step
procedure of recombinant library construction for the selection of efficiently produced llama VH
binders directed against cancer markers. J Immunol Methods. 2009 Oct 31;350(1-2):54-62. Epub
2009 Sep 8.
Brevets:
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•
•
•
D. POMPON, A. BELLAMINE, F. DELORME, A. PERRET (1995) Souches de levure humanisées
exprimant des cytochromes P450. Priorité Française 1995, Extensions 1996, 1998 (CNRS/RhônePoulenc-Rorer)..
D. POMPON, W. BOIREAU. Priorité française avril 2001 Extension PCT 2002. Structure Bicouche
supportée de présentation d’un acide nucléique associé à une protéine. CNRS 239156-D19502,
(2001).
D. POMPON ET AL. (2001) Souche de levure produisant des stéroïdes de façon autonome. AventisPharma-CNRS (Priorité Française février 2001, extension PCT 2002).
D. POMPON, B. DUMAS, R. SPAGNOLI. Souche de levure produisant du cholestérol et leurs
applications. (2004), PCT 2005. FRAV2004-012.
41
Dr. Jean-Philippe Steyer
Directeur du LBE
Laboratoire
de
Biotechnologie
l’Environnement – INRA-LBE
de
Mail : [email protected]
Tel : 04.68.42.51.51
Parcours professionnel :
01/1992 – 09/1993 : Ingénieur au sein de la société Sanofi à Aramon.
10/1993 : Chargé de Recherche au LBE de l’INRA à Narbonne.
01/2004 : Directeur de Recherche 2ème classe au LBE de l’INRA à Narbonne.
01/2009 : Directeur du LBE de l’INRA à Narbonne
01/2011-présent : Directeur de Recherche 1ère classe au LBE de l’INRA à Narbonne
Domaines de compétences :
Instrumentation, modélisation et optimisation de procédés biologiques
Diplômes et formations :
12/1991 : Doctorat de l’Université Paul Sabatier de Toulouse
01/1998 : Habilitation à Diriger des Recherches – Université de Perpignan
Recherches actuelles :
Optimisation des procédés de digestion anaérobie (production CH4 et H2), couplage avec des
procédés de micro algues.
Autres activités :
2002-présent : membre nommé du Technical Committee sur le Control of Biotechnological
Processes de l'International Federation on Automatic Control (IFAC)
2006-2010 : éditeur associé de la revue internationale à comité de lecture Water Research
2006-2011 : élu du Conseil Scientifique du département "Environnement et Agronomie" de
l’INRA
2008-présent : membre du Task Group on Systems Analysis and Computing de l’International
Water Association.
2008-présent : représentant élu de l’Europe du Sud au sein du Specialist Group on Anaerobic
Digestion de l’International Water Association.
2009-présent : membre de l'International Advisory Board de l'Excellence Center for
Development Cooperation - Sustainable Water Management in Developing Countries (Exceed)
à Braunschweig, Allemagne
42
Dr. Jean-Philippe Steyer
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
Brevets
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Depuis 2004 : contrat de licence signé avec la société belge Applitek sur le transfert de savoir-faire
du capteur titrimétrique Anasense®
En 2007 et 2009, co-inventeur de 2 brevets ("Bioréacteur et procédé pour la production de biogaz"
patent FR2925040 WO2009101297 et "Procédé de fixation de CO2 et de traitement de déchets
organiques par couplage d'un système de digestion anaérobie et d'un système de production de
microorganismes phytoplanctoniques", n° de dépôt 0950334).
Conférences
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•
•
Pons, M.-N., Jeppsson, U., Alex, J., Steyer, J.-P., Gernaey, K.V., Copp, J.B., Rosen, C., Vanrolleghem, P.A.
“10 years of benchmarks development for improving wastewater treatment plants control
strategies”, Conférence invitee à XVII Congresso Brasileiro de Engenharia Química COBEQ 2008, 1417 Sept. 2008, Récife, Brésil (6 pages sur CDROM).
N. Bernet, R. Escudié, F. Habouzit, J-Ph. Steyer : "Anaerobic biofilm processes: a review of 15 years of
research", 12th IWA World Congress on Anaerobic Digestion (AD12), 31 Octobre-4 Novembre, 2010,
Guadalajara, Mexique.
R. Girault, J-Ph. Steyer, D.J. Batstone, P.D. Jensen, I. Nopens, U. Zaher, A-G. Sadowski, F.Béline, A. Żak,
O. Kujawski, N.C. Holm, S.G.E. Rönner-Holm: "Fractionation and calibration of ADM1. Lab-scale and
full-scale experiences", WWTMod2010, the 2nd IWA/WEF Wastewater Treatment Modelling
Seminar, 28-30 Mars 2010, Mont-Sainte-Anne, Québec, Canada,
D. J. Batstone, Y. Amerlinck, G. Ekama, R. Goel, P. Grau, B. Johnson, I. Kaya, J-Ph. Steyer, I. Takács, P. A.
Vanrolleghem, Eveline Volcke: "Towards a Generalized Physicochemical Framework: WWTmod
Workshop Position Paper", WEFTEC 2010, New Orleans, USA, October 2–6, 2010 (18 pages sur CDROM).
J.J. Godon, L. Arcemisbehere, J. Hamelin, R. Escudié, T. Bouchez, A. Guillot, T. Li, E. Miambi, A. Robert,
J-Ph. Steyer : "How animals can help us on anaerobic digestion? The microbial and process
engineering points of view", 1st International Conference on Biogas Microbiology, 14-16 Septembre
2011, Leipzig, Allemagne (keynote invitee).
Ouvrage
•
G. Olsson, M. Nielsen, Z. Yuan, A. Lynggaard-Jensen, J-Ph. Steyer: "Instrumentation, Control and
Automation in Wastewater Systems", IWA publishing, 246 pages (2005)
Revues internationales
•
•
•
•
•
J-Ph. Steyer, O. Bernard, D. Batstone, I. Angelidaki: "Lessons learnt from 15 years of ICA in anaerobic
digestion processes", Water Science & Technology, vol. 53, n°4-5, pp. 25-33, 2006.
L. Lardon, A. Hélias, B. Sialve, O. Bernard, J-Ph. Steyer : ”Life-Cycle Assessment of Biodiesel
Production from Microalgae”, Environ. Sci. Technol., vol. 43, n°17, pp. 6475–6481, 2009.
M. Lesteur, V. Bellon-Maurel, C. Gonzalez, E. Latrille, J.M. Roger, G. Junqua, J-Ph. Steyer : "Alternative
methods for determining anaerobic biodegradability: A review", Process Biochemistry, vol. 45, n°4,
pp. 431-440, 2010.
X.M. Guo, E. Trably, E. Latrille, H. Carrère, J-Ph. Steyer : "Hydrogen production from agricultural
waste by dark fermentation: A review", International Journal of Hydrogen Energy, vol. 35, n° 19, pp.
10660-10673, 2010.
M. Quéméneur, J. Hamelin, A . Barakat, J-Ph. Steyer, H. Carrère, E. Trably : “Inhibition of fermentative
hydrogen production by lignocellulose-derived compounds in mixed cultures”, International Journal
of Hydrogen Energy, vol. 37, pp. 3 150-3159, 2012.
43
Dr. Jean TAYEB
Directeur Adjoint 3BCAR
UMR FARE - Reims
Mail : [email protected]
Tel : 03.26.77.35.92
Parcours professionnel :
09/2006-Present : Ingénieur de Recherche INRA – Chargé de mission nationale « Chimie
Verte et Carbone Renouvelable » - Directeur de l’UMR FARE en 2007-2008-2009
06/2003-07/2006 : Directeur Général - Centre Technique de la Charcuterie-Salaison
09/2000-05/2003 : Directeur Développement Technologique - Groupe SODIAAL (marques
Yoplait, Candia , Le Rustique, Richemonts)
09/1995-08/2000 : Chef de Groupe Développement - Groupe SODIAAL (marques Yoplait,
Candia, Le Rustique, Richemonts)
01/1991-08/1995 : Directeur Recherche Développement - Biscuiterie Nantaise (Groupe
General Mills puis Pepsico)
09/1986-12/1990 : Chargé de Recherche INRA – Centre de Nantes
10/1981-08/1986 : Attaché Scientifique Contractuel INRA – Centres de Jouy en Josas,
Antilles-Guyane (Service National), puis Nantes à partir de septembre 1983
Domaines de compétences :
Bioénergies et chimie verte, Physico-chimie des matériaux, Microbiologie industrielle,
Alimentation et nutrition, Gestion des connaissances
Diplômes et formations :
1986 : Doctorat de l’Ecole de Mines de Paris, option Science et Génie des Matériaux
1981 : Ingénieur physicochimiste ESPCI - Paris
Recherches actuelles :
Production d’éthanol de 2ème génération par voie biologique
Autres activités :
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o
o
o
o
o
Membre du bureau de la Commission Biomolécules du pôle IAR (Industrie et AgroRessource)
Membre du Steering Committee du Joint Program Bio-Energy de l’European Energy
Research Alliance (EERA)
Coordinateur INRA du Projet Futurol et membre du Comité Scientifique de ce projet
Participation à des commissions d’évaluation AERES
2003-2006 : CoPrésident du Conseil Scientifique du Programme National de Recherche
en Alimentation de l’ANR (PNRA - budget : 14 M€).
1996-2003 : Président du Conseil Scientifique de l’ACTIA (Association des Centres
Techniques des Industries Agro-alimentaires)
44
Dr. Jean Tayeb
Principales communications scientifiques dans le domaine:
Abecassis J., Tayeb J. coordinateurs, et 24 autres contributeurs (2010) Faisabilité de la bioraffinerie.
Rapport de la Tache 9 dans le sous-atelier « Exploration de la diversité des solutions végétales
envisageables pour produire la biomasse » de l’ARP VEGA, sous presse, 62 pages
Tayeb J. (2010) Procédés technologiques pour la production de biocarburants. Académie d’Agriculture
de France, Paris, 10 mars 2010.
Conférences invitées
Tayeb J. (2009) Filières énergétiques à base de biomasse. Colloque REGEFOR - La forêt face aux défis
énergétiques (Nancy – 8 au 10 juin 2010)
Tayeb J (2010) Caractéristiques de la biomasse attendues en entrée de bioraffinerie. Colloque Arvalys Critères de qualité pour les céréales de demain (Paris – 22 juin 2010)
Tayeb J (2012) Production de biocarburants à partir de biomasse lignocellulosique. Journées Techniques
ONF (Paris – 19-20 juin 2012)
45
Nathalie TURC
Directrice adjointe
Institut Carnot 3BCAR
[email protected]
01 42 75 92 93
Parcours professionnel :
Depuis 2011 : Directrice adjointe Institut Carnot 3BCAR
Depuis 2008 : Responsable Pôle Agro-alimentaire et Bio-industries - INRA
Transfert
2002-2007 : Chargée de valorisation – INRA Transfert, Paris
2000-2001 : ingénieur de recherche chimie organique et biochimie –
GlaxoSmithKline, Royaume-Uni
Domaines de compétences :
Bioénergies et chimie verte – Agro-alimentaire
Montage & gestion de projets de recherche
Partenariats public-privé
Licensing
Propriété Intellectuelle
Etude de positionnement technico-économique
Aide à la création d’entreprises innovantes
Diplômes et Formations : Ingénieur chimie – génie des procédés, ESCPE Lyon
Autres activités : Membre des Comités de Propriété Intellectuelle et
Valorisation de différents projets d’envergure
46
Laboratoire
de
Chimie
Industrielle, INP Toulouse
Pr Carlos VACA-GARCIA
Agro-
[email protected]
05 34 32 35 03
Parcours professionnel :
2007Full Professor at INP-ENSIACET (PART OF UNIVERSITE DE TOULOUSE)
2001-2007
Associate Professor (Maître de Conférences H.D.R.) at INP-ENSIACET
1999-2001
Assistant Professor (Maître de Conférences) at INP-ENSIACET
1998-1999
Postdoctoral Fellow at KYOTO UNIVERSITY (Japan) in the Dept. of Wood Science
and Technology
1990-1993
Project Manager at CIATEJ, GUADALAJARA
Diplômes et formations :
Nov 1997
Jun 1994
Aug 1991
PhD with European Label Agroresources Sciences INP TOULOUSE.
Assessor: Pr. M.E. Borredon
MSc Chemical reactivity of vegetable raw materials INP TOULOUSE
(FRANCE)
BSc Chemical Engineering UNIVERSITY OF GUADALAJARA (Mexico)
Recherches actuelles :
CHEMICAL REACTIVITY OF LIPIDS: New amphiphilic reagents for cellulose,
biolubricants
CELLULOSE DERIVATIVES: Chemical protection of wood, bioplastics
BIOREFINERY OF MICROALGAE
Autres activités :
Since 2011 Director of the Laboratory of Agro-Industrial Chemistry (UMR 1010
INRA/INP-ENSIACET)
Since 2009 Coordinator of the INP-ENSIACET International Relations
Since 2005 Member of the Scientific Committee in the conference Renewable Resources &
Biorefineries
Since 2007 Member of the Advisory Editorial Board for the journal Biofuels, Bioproducts
& Biorefining
Since 2010 Expert for the AERES (Agency for the Evaluation of Research and Higher
Education)
2001-2010 Head of the Green Chemistry Program in INP-ENSIACET
2004-2011 Leader of a research group: Chemical modification of polyols and lipids
2002-2006 Member of the Administrative Board of MIDITECH (Association for the
Promotion of Innovation)
2005-2008 Coordinator of a European Project (FP6, Collective Research, SURFASAM)
2011-2013 Coordinator of an ANR Project : Biorefinery of microalgae
Principales communications scientifiques dans le domaine:
VACA-GARCIA C., THIEBAUD S., BORREDON M.E., GOZZELINO G.* (1998) Cellulose esterification
with fatty acids and acetic anhydride in lithium chloride/N,N-dimethylacetamide medium. J. Am. Oil
47
Chem. Soc. 75, 315-319.
*Politecnico di Torino, Italy.
VACA-GARCIA C., BORREDON M.E. (1999) Solvent-free fatty acylation of cellulose and
lignocellulosic wastes. Part 2, reactions with fatty acids. Bioresour. Technol. 70, 135-142.
VACA-GARCIA C., BORREDON M.E., GASET A. (2001) Determination of the degree of substitution of
mixed cellulose esters by elemental analysis. Cellulose 8, 225-231.
VACA-GARCIA C., GOZZELINO G.*, GLASSER W.G.**, BORREDON M.E. (2003) Dynamic mechanical
thermal analysis transitions of partially and fully substituted cellulose fatty esters. J. Polym. Sci. Part
B, Polym. Phys. 41, 281-288.
*Politecnico di Torino.
**Virginia Tech, USA.
QUESADA J., MORARD M., VACA-GARCIA C., BORREDON E. (2003) Preparation of alkenyl succinic
anhydrides from vegetable oil FAME. J. Am. Oil Chem. Soc. 80, 281-286.
LA MANTIA F.P.*, TZANKOVA DINTCHEVA N.*, MORREALEA M.*, VACA-GARCIA C. (2004) Green
composites of organic materials and recycled post-consumer polyethylene. Polym. Int. 53, 18881891.
*Università di Palermo, Italy
GRADWELL S.E.*, RENNECKAR S.*, ESKER A.R.*, HEINZE T.**, GATENHOLM P.***, VACA-GARCIA C.,
GLASSER W.G.* (2004) Surface modification of cellulose fibers, towards wood composites by
biomimetics. C.R. Biologies 327, 945-953.
*Virginia Tech, USA.
**Friedrich-Schiller-Universität Jena, Germany.
***Chalmers University of Technology, Sweden.
CANDY L., VACA-GARCIA C., BORREDON E. (2005) Synthesis of alkenyl succinic anhydrides from
methyl esters of high oleic sunflower oil. Eur. J. Lipid Sci. Technol. 107, 3-11.
CANDY L., VACA-GARCIA C., BORREDON E. (2005) Synthesis and characterization of oleic succinic
anhydrides, structure-property relations. J. Am. Oil Chem. Soc. 82, 271-277.
PEYDECASTAING J., GIRARDEAU S., VACA-GARCIA C., BORREDON E. (2006) Long chain cellulose
esters with very low DS obtained with non-acidic catalysts. Cellulose 13, 95-103.
DOI : http://dx.doi.org/10.1007/s10570-005-9012-5
MORARD M., VACA-GARCIA C., STEVENS M.*, VAN ACKER J.*, PIGNOLET O., BORREDON E. (2007)
Durability improvement of wood by treatment with Methyl Alkenoate Succinic Anhydrides (M-ASA)
of vegetable origin. Int. Biodeterior. Biodegrad. 59, 103-110.
DOI : http://dx.doi.org/10.1016/j.ibiod.2006.08.003
*Universiteit Gent, Belgium
AUGIER L., SPERONE G., VACA-GARCIA C., BORREDON E. (2007) Influence of the wood fibre filler on
the internal recycling of poly(vinyl chloride)-based composites. Polym. Degrad. Stab. 92, 1169-1176.
DOI : http://dx.doi.org/10.1016/j.polymdegradstab.2007.04.010
BRAS J., VACA-GARCIA C., BORREDON E., GLASSER W.G.* (2007) Oxygen and water vapor
permeability of fully substituted long chain cellulose esters (LCCE). Cellulose 14, 367-374.
DOI : http://dx.doi.org/10.1007/s10570-007-9123-2
*Virginia Tech, USA
STEFANOIU F., CANDY L., VACA-GARCIA C., BORREDON E. (2008) Kinetics and mechanism of the
reaction between maleic anhydride and fatty acid esters. Eur. J. Lipid Sci. Technol. 110, 441-447.
DOI : http://dx.doi.org/10.1002/ejlt.200700181
PEYDECASTAING J., VACA-GARCIA C., BORREDON E. (2008) Quantitative analysis of mixtures of
various linear anhydrides and carboxylic acids. Chromatographia 68, 685-688.
DOI : http://dx.doi.org/10.1365/s10337-008-0765-5
PEYDECASTAING J., VACA-GARCIA C., BORREDON E. (2009) Accurate determination of the degree
of substitution of long chain cellulose esters. Cellulose 16, 289-297.
DOI : http://dx.doi.org/10.1007/s10570-008-9267-8
MAZZA M., CATANA D.A., VACA-GARCIA C., CECUTTI C. (2009) Influence of water on the dissolution
of cellulose in selected ionic liquids. Cellulose 16, 207-215.
DOI : http://dx.doi.org/10.1007/s10570-008-9257-x
48
Laboratoire de Chimie Agro-Industrielle
Dr Gérard VILAREM
Directeur Adjoint
Mail : [email protected]
Tel : 33(0)5 32 34 35 49/40
Parcours professionnel :
•
Recherche :
2011-ce jour : Directeur Adjoint de l’UMR 1010 INRA / INPT-ENSIACET - LCA
1992-ce jour:
Responsable du groupe de recherche : « Colorants naturels,
huiles essentielles et métabolites secondaires »
•
Transfert de technologie :
1992-2011 : Directeur du Centre de Ressources Technologiques CATARCRITT Agroressources (CRT N° 96/7)
Domaines de compétences :
Fractionnement, caractérisation des métabolites II aires
Diplômes et formations :
1994 : Habilitation à Diriger des Recherches Institut National Polytechnique
de Toulouse
1988 : Doctorat de l'Institut National Polytechnique de Toulouse (Spécialité
Agrochimie)
Recherches actuelles :
Fractionnement, caractérisation et applications des pigments et colorants
naturels :
Extraction, fractionnement, caractérisation, recherche de l’amélioration des
propriétés technologiques, études de production à l’échelle semi-industrielle (5
publications, 1 brevet, 10 communications & congrès, 7 thèses).
Fractionnement, caractérisation des huiles essentielles et autres
métabolites secondaires à activités biologiques et à propriétés physicochimiques spécifiques :
Extraction, fractionnement, caractérisation, études d’extraction à l’échelle
laboratoire et pilote avec dispositifs expérimentaux d’assistance. Etude en
interne ou au travers de collaborations, des activités antifongiques,
antihelminthiques, antioxydantes et/ou des propriétés solvantes (20
publications, 22 communications & congrès, 10 thèses).
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Etudes et développement de procédés alternatifs d’extraction :
Etude et mise en œuvre de procédés alternatifs de fractionnement à l’échelle
pilote : extraction en extrudeuse bi-vis, extraction assistée par ultrasons ou
sous-induction directe (6 publications, 1 brevet, 1 chapitre d’ouvrage
scientifique, 11 communications & congrès ,7 thèses).
Autres activités :
-Expert pour L’Agence d’Evaluation de la Recherche et de l’Enseignement
Supérieur (AERES) (2009-2012)
-Membre Expert du Club de l’Innovation pour le Pôle de Compétitivité
AGRIMIP Sud-Ouest Innovation (2008-2012)
-Membre de la Commission de Sélection des Centres de Ressources
Technologiques (2006-2012)
-Expert scientifique OSEO (1993,1998, 2005, 2007,2008)
Principales communications scientifiques et brevets dans le domaine:
Improving light fastness of natural dyes on cotton yarn. CRISTEA D.,
VILAREM G. Dyes and Pigment, 70, 238-245, 2006.
Hydrodistillation of caraway by direct induction heating assited by
magnetic field process. LAGUNEZ RIVERA L., VILAREM G. Flavour and
Fragrance Journal, 22, 178-183, 2007.
Extraction assistée par Induction thermomagnétique Directe (ITMD)
Eco-extraction du végétal : Chapitre 6 : Procédés innovants et solvants
alternatifs. Dunod : Technique et Ingénierie, Paris, 2011. VILAREM.G,
LAGUNEZ-RIVERA L
Procédé de fractionnement de sous-produits animaux issus des procédés
utilisés dans la filière de la charcuterie industrielle. Brevet Français: FR 2
962 883 (27/01/2012) Inventeurs: FORET S., MATHIEU C., RAYNAUD C., RIGAL
L. et VILAREM G. Demandeur : SEC SNC
50

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