le virus Alkhurma

le virus Alkhurma
Dr Rémi Charrel
Unité des Virus Émergents
UMR190 "Émergence des Pathologies Virales"
Université de la Méditerranée – Institut de Recherche pour le Développement
Marseille
Virus Alkhurma
Fièvre hémorragique en Arabie Saoudite
Historique
• Virus isolé en 1995 (Zaki et al., 1997) du sang d’un
boucher de Jeddah
– fièvre, céphalées, douleurs rétro-orbitaires, myalgies,
vomissements
– Hémorragies
– Syndrome de choc
– Décès
• Identification par Mab Î Flavivirus
• 1995-2006: 37 cas
• Mortalité >30%
•
Aucune donnée pour les pays limitrophes !
1ere caractérisation
génétique
Génétiquement très proche d'un
autre flavivirus: le virus Kyasanur
Forest disease virus, virus de la
forêt de Kyasanur Î fièvre
hémorragique, mortalité 5%
Epidémiologie à partir de 16 cas confirmés par isolement viral
From Charrel et al 2008
Profils cliniques et biologiques de 16 cas confirmés (isolement viral)
From Charrel et al 2008
Pas de variabilité génétique
Analyse génétique de 11 souches humaines
isolées entre 1994 et 1999
Séquence analysée : plus de 2000 nt
soit >20% du génome,
3 gènes : enveloppe, NS3 et NS5
nucleotides
0
5'-NCR
1000
C Pr M
2000
E
3000
NS1
4000
NS2
5000
6000
NS3
7000
NS4
8000
9000
NS5
10000
11000
3'-NCR
Alkhurma virus est-il transmis par les tiques ?
• CONTRE
Î toutes les souches isolées à partir de prélèvements humains
• POUR
Î 5 cas avec notion de piqûre de tique
Î génétiquement au milieu des flavivirus transmis par les tiques
Î distribution des cas selon 2 pics coïncident avec l’activité des tiques
place of
collection
Jeddah North East
6
5
4
identification
animal
3
2
1
0
Jan Feb Mar
Apr nymphs
May Jun&
Ornithodoros
savignyi
adults
Hyalomma spp
Jul
Aug
Sep &Oct
camels
camel resting
place
number of
ticks
Nov
Dec
date of
collectio
n
64
June
2004
Î campagne de collecte de tiques (chameaux et moutons)
Jeddah South East
Ornithodoros savignyi nymphs &
adults
Hyalomma spp
camels &
camel resting
place
32
June
2004
Kilaakh
(50 km from Taif)
Hyalomma dromedarii
camels
28
January
2005
Alkhurma virus est-il transmis par les tiques ?
Louping ill virus
100
99
100
TBEVEuropean subtype
TBEV Siberian subtype
TBEV Far eastern subtype
-
90
100
Omsk hemorrhagic fever virus
Langat virus
Kyasanur Forest disease virus
75
AHFV
- JE7_ Ornithodoros savignyi
100
AHFV
- 5975
- 9518
100 AHFV
100
<100 ans
AHFV
- 1209
AHFV
- 7471
AHFV
- 7586
AHFV
- 7344
AHFV
- 7466
AHFV
- MOS
AHFV
- 1176/228/87
100
Powassan virus
Deer ck
ti virus
Rio Bravo virus
Apoi virus
0.05
Human isolates
Proposed AHFV Transmission Cycle
Ticks vector
Incidental infections
Alkhurma
virus
Alkhurma
virus
Incidental infections
Vertebrate Host
?
?
?
conclusions
• Alkhurma virus est un nouveau flavivirus responsable de fièvres
hémorragiques en Arabie Saoudite
• le taux de mortalité est élevé > 30% des cas hospitalisés
• la transmission à l'homme s'opère par contact direct, voie digestive,
piqûre de tiques
• sa distribution géographique est mal connue
• il n'existe pas de données de séroprévalence (neutralisation)
• le cycle naturel est mal connu
Acknowledgments
• French team
• Sarah Temmam
• Xavier de Lamballerie
• Saudi team
• Ali Zaki, Shamsudeen Fagbo
• Stephane Ostrowski for field assistance
• Special Pathogen Branch : Tom Ksiazek, Pierre Rollin, Stuart Nichol
• VIZIER EU project for funding