Validation de la méthode TEMPO® TC pour le dénombrement des
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Validation de la méthode TEMPO® TC pour le dénombrement des
accrÄditation Cofrac nÅ1-0144 portÄe disponible sur www.cofrac.fr SOCIETE BIOMERIEUX Service Recherche & D•veloppement Industrie Chemin de l’Orme 69280 MARCY L’ETOILE Validation AFNOR des m€thodes alternatives d’analyse Application € la microbiologie alimentaire Rapport de synthÄse (Etudes pr•liminaire et collaborative conduites selon la norme NF EN ISO 16140) Validation de la mÅthode TEMPOÇ TC pour le dÅnombrement des coliformes totaux M€thodes quantitatives Ce rapport comprend 44 pages dont 5 annexes. La reproduction de ce rapport n’est autoris€e que sous sa forme int€grale. SYNTHESE TEMPO‚ TC (Version 2) 4 aoƒt 2008 Annule et remplace la version prÄcÄdente L’ancienne version doit •tre restitu‚e ƒ ADRIA D‚veloppement ou d‚truite en interne. ADRIA DEVELOPPEMENT Creac’h Gwen - F. 29196 QUIMPER Cedex - T•l. (33) 02.98.10.18.18 - Fax (33) 02.98.10.18.08 E-mail : [email protected] - Site web : http://www.adria.tm.fr - Site r•serv• adh•rents : http://www.clubiaa.net ASSOCIATION LOI DE 1901 - N‚ SIRET 306 964 271 00036 - N‚ EXISTENCE 532900006329 - N‚TVA FR4530696427100036 BIOMERIEUX Sommaire 1 INTRODUCTION _______________________________________________ 5 1.1 R€f€rentiel de validation ____________________________________ 5 1.2 Protocole et principe de la m€thode alternative _________________ 5 1.3 Domaine d’application demand€ _____________________________ 6 1.4 M€thode de r€f€rence ______________________________________ 6 2 ETUDE COMPARATIVE _________________________________________ 7 2.1 Lin€arit€ _________________________________________________ 7 2.1.1 Matrices utilis•es et protocole de contamination __________________ 7 2.1.2 R•sultats bruts ___________________________________________ 7 2.1.3 Interpr•tation statistique ____________________________________ 8 2.1.4 Discussion_______________________________________________ 9 2.2 Exactitude relative _________________________________________ 9 2.2.1 Nombre et nature des •chantillons ____________________________ 9 2.2.2 Contamination artificielle des •chantillons ______________________ 10 2.2.3 R•sultats bruts __________________________________________ 10 2.2.4 Interpr•tation ____________________________________________ 10 2.2.5 Discussion______________________________________________ 12 2.3 Compl€ment d’€tude d’exactitude sur les produits v€g€taux _____ 13 2.3.1 Protocole_______________________________________________ 13 2.3.2 R•sultats _______________________________________________ 13 2.3.3 Interpr•tation ____________________________________________ 15 2.4 Limite de d€tection (LOD) et limite de quantification (LOQ) ______ 16 2.4.1 Protocole_______________________________________________ 16 2.4.2 R•sultats _______________________________________________ 16 2.5 Sensibilit€ relative ________________________________________ 17 2.6 Sp€cificit€/S€lectivit€ _____________________________________ 17 2.6.1 Protocoles d’essai ________________________________________ 17 2.6.2 R•sultats _______________________________________________ 18 2.7 Praticabilit€______________________________________________ 19 2.7.1 Temps r•el de manipulation et flexibilit• de la technique par rapport au nombre d’•chantillons € analyser ____________________________ 19 2.7.2 D•lai d’obtention des r•sultats_______________________________ 20 2.7.3 Traƒabilit• des r•sultats____________________________________ 20 2.7.4 Maintenance par le laboratoire ______________________________ 21 ADRIA D•veloppement Synth„se TEMPO‚ TC (Version 2) 2/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 3 ETUDE COLLABORATIVE ______________________________________ 22 3.1 Organisation de l’€tude ____________________________________ 22 3.2 Contr…le des param„tres exp€rimentaux _____________________ 23 3.2.1 Stabilit• de la souche au cours du transport ____________________ 23 3.2.2 R•sultats obtenus pour les deux m•thodes _____________________ 24 3.2.3 Temp•rature des •chantillons € r•ception ______________________ 24 3.2.4 Temp•rature des •chantillons pendant le transport _______________ 24 3.3 R€sultats des analyses ____________________________________ 25 3.3.1 Synth„se des r•sultats obtenus par les deux m•thodes ___________ 25 3.3.2 Calcul du biais___________________________________________ 26 3.3.3 Calcul de la r•p•tabilit• ____________________________________ 27 3.3.4 Reproductibilit• __________________________________________ 27 3.3.5 Dispersion entre les laboratoires _____________________________ 28 3.4 Discussion ______________________________________________ 28 4 CONCLUSION ________________________________________________ 30 Annexe 1 - Notice d’utilisation de la m•thode alternative _________________________ 32 Annexe 2 - M•thode de r•f•rence __________________________________________ 36 Annexe 3 - Etude de lin•arit• ______________________________________________ 37 Annexe 4 - Exactitude relative _____________________________________________ 41 Annexe 5 - Exactitude relative : Compl•ment d’•tude … Produits v•g•taux † (dates d’analyse : 12 et 20 octobre 2005)___________________________________________ 43 ADRIA D•veloppement Synth„se TEMPO‚ TC (Version 2) 3/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Les modifications apportÅes au rapport sont indiquÅes par un double trait dans la marge É gauche. Avant Propos L’accr€ditation du COFRAC atteste de la comp€tence des laboratoires pour les seuls essais couverts par l’accr€ditation qui sont identifi€s par le symbole. L’ensemble des renseignements permettant de valider la garantie des analyses est tenu ‚ la disposition de la Soci€t€ BIOMERIEUX. Les r€sultats sont synth€tis€s au sein de tableaux et interpr€t€s selon la norme NF EN ISO 16140. o Fabricant : Soci€t€ BIOMERIEUX Chemin de l’Orme 69280 MARCY L’ETOILE o Laboratoire expert : ADRIA D€veloppement ZA Creac’h Gwen 29196 QUIMPER Cedex o MÅthode É valider : M€thode TEMPO‚ TC pour le d€nombrement des coliformes totaux o RÅfÅrentiel de validation : Norme NF EN ISO 16140 (octobre 2003) : protocole pour la validation des m•thodes alternatives o MÅthode de rÅfÅrence : NF EN ISO 4832 (f•vrier 2003) : directives g•n•rales pour le d•nombrement des coliformes m•thode par comptage des colonies o Etendue de la validation : Tous produits d’alimentation humaine et pour animaux de compagnie, „ l’exclusion du lait cru, des boissons et de l’alimentation du b•tail NF EN ISO 4832 : essai effectu• sous le couvert de l’accr•ditation par le laboratoire expert ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 4/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 1 INTRODUCTION 1.1 R€f€rentiel de validation Le r•f•rentiel de validation utilis• est la Norme NF EN ISO 16140 (octobre 2003) : protocole pour la validation des m•thodes alternatives. 1.2 Protocole et principe de la m€thode alternative TEMPO… est une solution automatis•e qui permet de r•aliser le d•nombrement des germes indicateurs de la qualit• sanitaire dans les produits d’alimentation humaine et pour animaux de compagnie, „ l’exclusion du lait cru, des boissons et de l’alimentation du b•tail. La num•ration des micro-organismes est bas•e sur la m•thode NPP : Nombre le Plus Probable associ•e „ la technologie des cartes TEMPO…. Le syst†me TEMPO… r•alise l’interpr•tation de la croissance microbienne de chaque carte TEMPO… et calcule le r•sultat des num•rations (UFC/g). TEMPO… est compos• en deux postes d'activit• distincts : - poste de pr•paration TEMPO… pour r•aliser l’ensemencement, avec distribution d'un •chantillon alimentaire dilu• dans un flacon de milieu, puis remplissage et le scellage des cartes TEMPO… au moyen d'un instrument : TEMPO… Filler. - poste de lecture TEMPO… pour effectuer la lecture et l’interpr•tation des cartes TEMPO… par l'interm•diaire d'un instrument : TEMPO… Reader. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 5/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX La notice d’utilisation est donn•e en Annexe 1 ; le protocole g•n•ral est pr•sent• ci-apr†s : Pr•paration •chantillon 1/10†me en sac TEMPO‚ Diluant : peptone-sel Dilution 1/4000 3,9 ml eau distill•e Dilution 1/400 Dilution 1/40 3,9 ml eau distill•e st•rile 3 ml eau distill•e ‚ en flacon TEMPO TC 0,1 ml suspension 1/100 0,1 ml suspension 1/10 1 ml suspension 1/10 dans flacon (une carte) Incubation 24 h - 27 h „ 30‚C 1‚C Lecture La dilution au 1/40†me permet une num•ration dans la gamme 10 „ 49 000 ufc/g. La dilution au 1/400†me permet une num•ration dans la gamme 100 „ 490 000 ufc/g. La dilution au 1/4000†me permet une num•ration dans la gamme 1 000 „ 4 900 000 ufc/g. 1.3 Domaine d’application demand€ Tous produits d’alimentation humaine et pour animaux de compagnie, „ l’exclusion du lait cru, des boissons et de l’alimentation du b•tail. 1.4 M€thode de r€f€rence La m•thode de r•f•rence est la norme NF EN ISO 4832 (f•vrier 2003) : directives g•n•rales pour le d•nombrement des coliformes - m•thode par comptage des colonies. Le protocole est sch•matis• en Annexe 2. NF EN ISO 4832 : essai effectu• sous le couvert de l’accr•ditation par le laboratoire expert ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 6/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 2 ETUDE COMPARATIVE 2.1 Lin€arit€ 2.1.1 Matrices utilis€es et protocole de contamination Cinq cat•gories de produits ont •t• analys•es (une matrice par cat•gorie), „ cinq niveaux de contamination et deux r•p•titions ont •t• r•alis•es par •chantillon. Au total, 50 analyses ont •t• effectu•es „ la fois par la m•thode de r•f•rence et la m•thode alternative. Les niveaux de contamination, les matrices test•es, ainsi que les souches utilis•es sont list•s dans le tableau suivant : Matrice test•e Souche Taux d’inoculation Steak hach• Klebsiella oxytoca 42 100 - 500 - 1 000 - 5.103 - 5.104 Tablettes au bœuf pour chien Citrobacter freundii 35 100 - 500 - 1 000 - 5.103 - 5.104 Concombre tranch• E. coli 19 100 - 500 - 1 000 - 5.103 - 5.104 Cr†me pˆtissi†re Enterobacter agglomerans 74 100 - 500 -1 000 - 5.103 - 5.104 Poisson cru Enterobacter cloacae Ad 230 100 - 500 - 1 000 - 5.103 - 5.104 Une dilution 1/40 a •t• effectu•e pour l’analyse d’•chantillons inocul•s „ des taux compris entre 100 et 5.103 UFC/g. Une dilution 1/400 a •t• effectu•e pour l’analyse d’•chantillons inocul•s „ des taux compris entre 100 et 5.104 UFC/g. Une dilution 1/4000 a •galement •t• r•alis•e pour l’analyse d’•chantillons inocul•s „ des taux compris entre 5 000 et 5.104 UFC/g. 2.1.2 R€sultats bruts Les •chantillons ont •t• test•s en double par chacune des deux m•thodes. Deux interpr•tations de r•sultats ont •t• effectu•es : - Interpr•tation avec des dilutions combin•es : Niveau 1 : 1/40 Niveau 2 : 1/40 Niveau 3 : 1/400 Niveau 4 : 1/400 Niveau 5 : 1/4000 ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 7/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX - Interpr•tation en minimisant la variation des dilutions : Niveau 1 : 1/40 Niveaux 2-3-4-5 : 1/400 Les graphiques bidimensionnels sont donn•s en Annexe 3. 2.1.3 Interpr€tation statistique Les r•sultats des interpr•tations statistiques sont donn•es dans les tableaux suivants pour l’interpr•tation avec les dilutions combin•es ou non. - Dilutions combin€es : Matrice R R•gression Rob.F utilis•e Valeur P% critique Coefficient de Droite de r•gression* corr•lation Steak hach• 2,29 OLS1 5,529 5,41 5 0,987 logAlt= 0,072+0,980logRef Cr†me pˆtissi†re 4,43 OLS1 2,549 5,41 17 0,972 logAlt= -0,133+1,071logRef Concombres 1,43 GMFR 9,573 5,41 2 0,994 logAlt= -0,723+1,219logRef Filet de cabillaud 3,00 OLS1 1,473 5,41 33 0,990 logAlt= -0,562+1,132logRef Tablette au bœuf 2,50 OLS1 23,280 5,41 0 0,982 logAlt= -0,172+1,053logRef pour chien * le choix de l’abscisse et de l’ordonn•e d•pend du type de r•gression retenue. Interpr•tation statistique : P5% : pas significatif P<1%: tr†s significatif 1 % < P < 5 % : significatif - Dilutions (1/40 – 1/400) : Matrice R R•gression Rob.F utilis•e Valeur P% Coefficient de critique Droite de r•gression* corr•lation Steak hach• 4,86 OLS1 0,231 5,41 87 0,982 logAlt = 0,254+0,909logRef Cr†me pˆtissi†re 6,29 OLS1 2,055 5,41 22 0,947 logAlt = -0,057+1,030logRef Concombres 2,57 OLS1 3,921 5,41 9 0,987 logAlt = -0,639+1,175logRef Filet de cabillaud 3,00 OLS1 1,907 5,41 25 0,988 logAlt = -0,639+1,175logRef Tablette au bœuf 7,75 OLS1 5,152 5,41 5 0,961 logAlt = -0,488+1,134logRef pour chien * le choix de l’abscisse et de l’ordonn•e d•pend du type de r•gression retenue. Interpr•tation statistique : P5% : pas significatif P<1%: tr†s significatif 1 % < P < 5 % : significatif Les droites de r•gression sont donn•es en Annexe 3 (dilutions combin•es ou non). ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 8/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 2.1.4 Discussion Les tests de lin•arit• sont accept•s d’embl•e dans la plupart des cas : - interpr•tations des dilutions 1/40 – 1/400, - interpr•tations des dilutions combin•es pour les matrices Š steak hach• ‹, Š cr†me pˆtissi†re ‹ et Š filet de cabillaud ‹. Dans la plupart des cas, les coefficients de corr•lation sont sup•rieurs „ 0,98, valeurs •lev•es pour mettre en d•faut la robustesse des tests de lin•arit•. Ainsi, la lin•arit• ne peut Œtre r•fut•e pour les matrices concombres et tablettes au bœuf pour chien lors de l’interpr•tation de dilutions combin•es. Le test de lin•arit• est accept• dans tous les cas. 2.2 Exactitude relative 2.2.1 Nombre et nature des €chantillons Les cat•gories et types d’aliments analys•s sont r•pertori•s dans le tableau 1. Tableau 1 - Nombre et nature des €chantillons Cat•gories Types Viande crue - Charcuterie Produits carn•s Produits laitiers Fruits et v•g•taux - Plats cuisin•s Fromages au lait cru - Fromages frais - Glaces - Divers L•gumes IV†me gamme D•shydrat•s et divers - Congel•s Produits de la mer Crus - fum•s - plats traiteurs Aliments pour animaux de produits d•shydrat•s - pˆt•s - compagnie viandes crues Nombre d’•chantillons Nombre de r•sultats analys•s exploit•s 18 10 27 10 22 10 19 14 27 10 Les •chantillons non exploit•s sont dus „ l’obtention de r•sultats inf•rieurs ou sup•rieurs au seuil de num•ration de l’une et/ou de l’autre des m•thodes. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 9/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 2.2.2 Contamination artificielle des €chantillons Quatre •chantillons ont •t• contamin•s par contamination crois•e : - •chantillons n‚ 1218 et 1219 : contamin•s par du fromage au lait cru - •chantillons n‚ 1222 et 1223 : contamin•s par un produit pour animaux de compagnie cuit type saucisson. 2.2.3 R€sultats bruts Les •chantillons ont •t• analys•s en double par chacune des deux m•thodes. Tableau 2 Cat€gorie d’aliments Produits carn•s Aliments pour animaux de compagnie Fruits et v•g•taux Produits laitiers Produits de la mer Domaine de contamination (log) 1,00 „ 4,63 1,00 „ 5,43 1,85 „ 6,15 1,52 „ 5,48 1,40 „ 5,04 Les graphiques bidimensionnels pour chaque cat•gorie et pour l’ensemble des •chantillons sont donn•s en Annexe 4. 2.2.4 Interpr€tation Tableau 3 Cat•gorie n R Produits carn•s 10 2,15 Produits laitiers 10 Fruits et v•g•taux Produits de la mer 1,32 R•gression P% a t(a) b t(b) T critique „0 1 OLS1 -0,357 0,097 0,864 1,224 2,306 93 26 GMFR -0,166 0,397 1,052 0,430 2,306 70 68 utilis•e Ordonn•e Pente „ 10 3,90 OLS1 0,997 1,235 0,611 2,094 2,306 25 7 14 1,73 GMFR -0,555 1,401 1,061 0,526 2,179 19 61 10 6,00 OLS1 0,0405 0,145 0,960 0,552 2,306 89 60 54 2,42 OLS1 0,184 0,835 0,855 2,397 2,00 41 2 Aliments pour animaux de compagnie Tous produits ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 10/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Les limites de r•p•tabilit• obtenues pour la m•thode alternative et la m•thode de r•f•rence ainsi que le biais D obtenu entre les deux m•thodes sont donn•es dans le tableau 4. Tableau 4 Cat•gorie Biais D Limite de r•p•tabilit• Limite de r•p•tabilit• m•thode alternative m•thode de r•f•rence Produits carn•s - 0,368 0,411 0,191 Produits laitiers 0,015 0,367 0,279 Fruits et v•g•taux - 0,418 0,572 0,147 Produits de la mer - 0,188 0,382 0,220 Aliments pour animaux de - 0,063 0,705 0,117 - 0,303 0,435 0,176 compagnie Toutes cat•gories confondues Les droites de r•gression (sous la forme de graphiques et d’•quations) pour chacune des matrices et pour l’ensemble des matrices sont donn•es en Annexe 4. Certains •carts de d•nombrements sont observ•s entre les deux m•thodes : - d•nombrement sup•rieur par la m•thode de r•f•rence : •chantillon 505, jambon cuit •chantillon 509, plat pr•par• „ base de poisson •chantillon 423, cubes de tomate •chantillon 1130, betteraves rouges •chantillon 1132, petits pois surgel•s Dans tous les cas, les colonies •taient de diam„tre sup•rieur € 0,5 mm sur g•lose VRBL, avec une coloration rouge en absence d’aur•ole. Des colonies ont •t• pr•lev•es sur g•lose VRBL : elles pr•sentent toutes une activit• oxydase n•gative. Des caract•risations et identifications ont •t• r•alis•es par galerie API. Ainsi, des souches montrant un ph•notype lactose n•gatif ont •t• identifi•es aux esp†ces : Enterobacter agglomerans pour l’•chantillon 509, 423 et 1132 Serratia liquefaciens pour l’•chantillon 1132. d•nombrement sup•rieur par la m•thode TEMPO‚ TC : •chantillon 1218, glace „ la vanille ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 11/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 2.2.5 Discussion Les tests statistiques valident des ordonn•es „ l’origine proches de 0 et les pentes proches de 1 pour chacune des cat•gories •tudi•es s•par•ment. Une dispersion des r•sultats est observ•e entre les deux m•thodes pour la cat•gorie v•g•taux. Cette dispersion semble Œtre imputable aux d•nombrements de colonies caract•ristiques avec toutefois absence d’aur•ole sur g•lose VRBL et montrant un [lactose]n•gatif. Si l’on s’accorde sur le ph•notype lactose positif des ent•robact•ries rassembl•es dans le groupe des coliformes, la m•thode de r•f•rence montre alors un manque de sp•cificit•. Les biais entre les deux m•thodes sont compris entre -0,418 Log UFC/g et 0,015 Log UFC/g. Ces observations permettent d’appr•hender les r•sultats de tests statistiques indiquant une pente diff•rente de 1 pour toutes cat•gories confondues. Enfin, les limites de r•p•tabilit• de la m•thode alternative varient de 0,367 „ 0,705, celles de la m•thode r•f•rence de 0,117 „ 0,279. Les limites de r•p•tabilit• de la m•thode alternative sont sup•rieures „ celle de la m•thode de r•f•rence, telle qu’observ•e de mani†re g•n•rale entre une m•thode bas•e sur le principe NPP et une m•thode de d•nombrement sur g•lose (Gangar1 et Gambrel-Lenarz, 1999). 1 Gangar V., Curiale M.S., Lindberg K., Gambrel-Lenarz S. (1999) Dry rehydratable film method for enumerating confirmed Escherichia coli in poultry, meats and seafood: collaborative study. J. AOAC Int., 82 (1) :73-8 ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 12/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 2.3 Compl€ment d’€tude d’exactitude sur les produits v€g€taux 2.3.1 Protocole Vingt produits v•g•taux ont •t• analys•s en double, „ la fois par la m•thode TEMPO… TC et par la m•thode de r•f•rence NF EN ISO 4832, avec deux marques de milieu VRBL afin d’•valuer la variabilit• entre milieux provenant de fournisseurs diff•rents. 2.3.2 R€sultats Les r•sultats bruts sont donn•s en Annexe 5. Les •chantillons analys•s sont tous naturellement contamin•s. Une attention particuli†re a •t• port•e „ l’analyse de types peu repr•sent•s lors de l’•tude pr•sent•e le 19 septembre 2005, afin d’augmenter la variabilit• des matrices. Vingt-trois •chantillons ont •t• analys•s pour obtenir vingt-deux r•sultats exploitables. Les graphiques bi-dimensionnels sont donn•s figures 1 „ 4. Deux repr•sentations et interpr•tations ont •t• r•alis•es pour le milieu A : - la premi†re en cumulant les donn•es acquises lors du compl•ment d’•tude „ celles acquises lors de l’•tude pr•liminaire, soit trente-deux r•sultats, - la deuxi†me avec uniquement les donn•es du compl•ment pour que cette interpr•tation soit comparable „ celle r•alis•e avec le milieu B. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 13/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Figure 1 - Graphique bidimensionnel TEMPO‚ TC / VRBL A (22 €chantillons) Figure 2 - Graphique bidimensionnel TEMPO‚ TC / VRBL A (32 €chantillons) Produits v€g€taux Produits v€g€taux 9,00 9,00 8,00 8,00 7,00 7,00 6,00 6,00 5,00 5,00 4,00 4,00 3,00 3,00 2,00 2,00 1,00 1,00 0,00 0,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 0,00 l o g ( M €t hode de r€f €rence) 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 l o g ( M €t hode de r€f €rence) Figure 3 - Graphique bidimensionnel TEMPO‚ TC / VRBL B (22 €chantillons) Figure 4 - Graphique bidimensionnel TEMPO‚ TC / VRBL A / VRBL B Produits v€g€taux Produits v€g€taux 8 8,00 7 7,00 6 6,00 5 VRBL 9,00 5,00 4 4,00 3 3,00 2 2,00 1 1,00 0 0 0,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 l o g ( M €t hode de r€f €rence) ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 2 4 VRBL A 14/43 6 TEMPO TC VRBL B 4 aoƒt 2008 8 BIOMERIEUX 2.3.3 Interpr€tation Les interpr•tations relatives „ l’acceptation des pentes „ 1 et des ordonn•es „ 0 sont indiqu•es ci-dessous : n R R•gression a + (a) b + (b) Tcritique P(0) P (1) 0,374 0,824 0,814 1,836 2,042 42 8 utilis•e Milieu A 32 2,31 OLS1 Milieu B 22 1,42 GMFR - 0,630 1,765 1,067 0,840 2,086 9 41 Milieu A 22 2,08 OLS1 - 0,022 0,066 0,940 0,795 2,086 95 43 Les limites de r•p•tabilit• pour la m•thode alternative et pour la m•thode de r•f•rence, ainsi que le biais obtenu entre les deux m•thodes sont donn•s tableau ci-apr†s : Biais D Limite de r•p•tabilit• M•thode alternative M•thode de r•f•rence Milieu A (n = 32) - 0,205 0,440 0,191 Milieu A (n = 22) - 0,140 0,396 0,191 Milieu B (n = 22) - 0,217 0,396 0,279 Les droites de r•gression pour chacune des interpr•tations figurent en Annexe 5. 2.3.3.1 Discussion Les r•sultats obtenus avec les deux milieux VRBL montrent une diff•rence importante au niveau de l’ordonn•e „ l’origine : celle-ci est de - 0,630 avec le milieu B et de - 0,022 avec le milieu A. Selon le nombre d’•chantillons consid•r•s, les pentes varient de 0,814 „ 0,940 lors d’une comparaison avec le milieu A. Elle est de 1,067 pour le milieu B. Le graphique bidimensionnel pr•sent• figure 4 permet d’•valuer la variabilit• des r•sultats g•n•r•s par la m•thode de r•f•rence selon le milieu VRBL utilis•, indiquant l’h•t•rog•n•it• de la flore d•nombr•e entre deux milieux diff•rents utilis•s dans une mŒme m•thode de r•f•rence. Alors, selon le cas, le d•nombrement par la m•thode TEMPO‚ TC est davantage similaire „ celui obtenu sur milieu VRBL A, ou au contraire, „ celui obtenu sur milieu VRBL B. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 15/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 2.4 Limite de d€tection (LOD) et limite de quantification (LOQ) 2.4.1 Protocole La limite de d•tection de la m•thode a •t• r•alis•e en cultures pures. Trois niveaux d’inoculation ont •t• test•s, „ raison de six r•plicats par niveau, soit dix-huit analyses par la m•thode alternative. Une dilution 1/40 a •t• effectu•e. Une souche d’E. coli a •t• utilis•e pour la limite de d•tection de la m•thode TEMPO… TC. La limite de quantification a •t• effectu•e pour six d•terminations ind•pendantes de diluant st•rile. 2.4.2 R€sultats Les donn•es sont intrins†ques „ la m•thode. Les r•sultats sont donn•s dans les tableaux suivants : Tableau 5 Niveau Nombre d’•chantillons positifs Ecart-type Biais 0 UFC/g 0/6 / / 10 UFC/g 4/6 12,785 10 50 UFC/g 6/6 207,29 71 Tableau 6 Formules Valeurs obtenues LC 1,65 S0 + X0 31,1 LOD 3.3 S0 + X0 52,2 LOQ 10 S0 + X0 137,9 ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 16/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 2.5 Sensibilit€ relative Les donn•es sont intrins†ques „ la m•thode. Elles sont obtenues „ partir des r•sultats obtenus dans l’•tude de lin•arit•. Les profils de pr•cision obtenus pour les diff•rentes matrices sont pr•sent•s figure 5. Figure 5 - Profils de pr€cision obtenus pour les diff€rentes matrices 100,0% 90,0% 80,0% 70,0% CV(<x(y)>) 60,0% Steak hach• Barres pour chien 50,0% Concombres Filet de cabillaud cru congel• Cr†me patissi†re 40,0% 30,0% 20,0% 10,0% 0,0% 0 1 2 3 4 5 6 7 M€thode de r€f€rence log ufc/g (x) 2.6 Sp€cificit€/S€lectivit€ 2.6.1 Protocoles d’essai Apr†s d•cong•lation et cultures en bouillon BHI aux temp•ratures appropri•es, des dilutions d•cimales ont •t• effectu•es et d•nombr•es en double „ la fois par la m•thode TEMPO… TC et la m•thode ISO 4832. Un d•nombrement a •t• effectu• en parall†le en g•lose PCA par inclusion afin de v•rifier le taux d’inoculation. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 17/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 2.6.2 R€sultats Inclusivit€ Sur les 30 souches test•es, 4 n’ont pas r•pondu par le syst†me TEMPO… TC. Il s’agit de : - Enterobacter sakazakii 90, de ph•notype lactose positif, Escherichia hermanii 395, de ph•notype lactose n•gatif, Hafnia alvei 40, de ph•notype lactose n•gatif, Hafnia alvei 167, de ph•notype lactose n•gatif. Sur la base de la d•finition du groupe des coliformes rassemblant des ent•robact•ries de ph•notype [lactose]positif, la croissance de trois de ces souches sur g•lose VRBL met en d•faut la s•lectivit• de la m•thode de r•f•rence. 11 souches non cibles montrent une croissance sur g•lose VRBL : Lactobacillus paracasei ATCC 10746, Morganella morganii CIP A236, Proteus mirabilis 54, Proteus vulganis 56, Providencia rettgeri 12, Providencia stuartii 46, 3 souches de Salmonella, Shigella flexneri CIP 8248 et Xanthomaras maltophilia CIP 6077. La m•thode TEMPO… TC d•tecte 5 d’entre elles : 3 souches de Salmonella, Lactobacillus paracasei ATCC 10746 et Proteus mirabilis 54. La m•thode TEMPO… TC montre une sp•cificit• et une s•lectivit• sup•rieures „ celles de la m•thode de r•f•rence, permettant d’expliquer certains •carts de d•nombrements entre les deux m•thodes observ•s lors de l’•tude d’exactitude relative, principalement pour la cat•gorie V•g•taux. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 18/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 2.7 Praticabilit€ 2.7.1 Temps r€el de manipulation et flexibilit€ de la technique par rapport au nombre d’€chantillons ƒ analyser Temps en minutes Etape Pr•l†vement Ajout diluant Broyage Pr•paration des bo•tes (2) Dilutions Ensemencements Lecture Temps total Temps pour 1 •chantillon M€thode NF ISO 4832 1 •chantillon 20 •chantillons 4 45 M€thode TEMPO TC 1 •chantillon 20 •chantillons 4 45 2 15 2 15 0,3 13 / / 4 64 2 20 2,5 12,8 60 197 0,45 8,45 2 82 12,8 9,9 8,45 4,1 Les temps indiqu•s ne tiennent pas compte de la pr•paration des milieux qui vient s’ajouter uniquement pour la m•thode de r•f•rence. La m•thode TEMPO utilise le milieu TEMPO… TC qui est prŒt „ l’emploi. L’utilisation de la m•thode TEMPO… TC r•duit consid•rablement les temps de manipulation, en particulier au niveau du poste de lecture. Il faut deux fois moins de temps pour r•aliser la m•thode TEMPO… TC que la m•thode NF ISO 4832 lors de l’analyse d’une grande s•rie (20 •chantillons). Il faut souligner •galement le gain de temps au niveau de la gestion des d•chets. Le volume des consommables par la m•thode TEMPO… TC est n•gligeable par rapport au volume des consommables n•cessaires pour la m•thode NF ISO 4832. Pour un •chantillon, il faut : - pour la r•alisation de la m•thode TEMPO : * 90 ml de diluant, * 1 carte TC, * 1 flacon TC, (2) 3 dilutions x 2 bo•tes ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 19/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX - pour la r•alisation de la m•thode NF ISO 4832 : * 90 ml de diluant, * 2 tubes de TS de 9 ml, * 6 bo•tes de VRBL. L’espace d’incubation n•cessaire pour la m•thode TEMPO… TC est particuli†rement restreint par rapport „ celui de la m•thode NF ISO 4832. Un portoir de 20 cartes TEMPO (20 tests TC) mesure 22,5 cm x 10,5 cm ; pour la m•thode NF ISO 4832 (analyse de 20 •chantillons), il faut 120 bo•tes, soit 20 piles de 6 bo•tes de P•tri. 2.7.2 D€lai d’obtention des r€sultats Etape M€thode NF ISO 4832 M€thode TEMPO TC J0 J0 J1 J1 Pr•l†vement Broyage Analyse Lecture Le d•lai d’obtention des r•sultats est identique pour les deux m•thodes. 2.7.3 Tra„abilit€ des r€sultats Une traŽabilit• compl†te est assur•e au niveau du TEMPO Filler et du TEMPO Reader, „ savoir : - identification de l’•chantillon, - heure de r•alisation du test, - manipulateur ayant r•alis• le test, - lots de r•actifs et consommables utilis•s, - dur•e d’incubation •coul•e ou restant avant lecture des cartes, - heure de lecture des cartes, - nombre de lecture r•alis•e pour chaque carte - manipulateur ayant r•alis• la lecture, - •dition des r•sultats, associant le r•sultat (UFC/g) „ l’•chantillon, au param†tre test• et „ la date d’analyse, - transfert possible vers un LIMS (Laboratory Information Management System). ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 20/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 2.7.4 Maintenance par le laboratoire Les performances du TEMPO Reader sont contr•l•es une fois par mois „ l’aide du kit TEMPO QC qui est compos• de : - 3 flacons TEMPO QC 8 •M, 2 flacons TEMPO QC 20 •M, 3 cartes TEMPO QC 8 •M, 2 cartes TEMPO QC 20 •M, 1 notice. Ce kit permet de v•rifier que le niveau de fluorescence donn• par le TEMPO Reader se situe bien dans la plage de valeurs attendues, signifiant que l’appareil est conforme. L’int€r†t majeur de la m€thode TEMPO‚ TC r€side : - dans le gain de temps important au niveau de l’analyse et de la lecture, - dans le gain de place ‡ l’incubation des cartes TEMPO‚ TC et la gestion facilit€e des d€chets, - dans la traˆabilit€ compl„te de l’analyse. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 21/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 3 ETUDE COLLABORATIVE 3.1 Organisation de l’€tude Laboratoires collaborateurs Douze laboratoires ont particip• „ l’•tude. Instructions aux laboratoires collaborateurs Les instructions d•taill•es ont •t• transmises aux laboratoires par le laboratoire expert. Echantillons Du lait pasteuris• demi-•cr•m• a •t• inocul• par Escherichia coli 94, isol•e de produit laitier. Inoculation Les taux d’inoculation vis•s ont •t• les suivants : - <10 UFC/ml, 100 – 1 000 UFC/ml, 1 000 – 10 000 UFC/ml, 10 000 – 100 000 UFC/ml. Les •chantillons ont •t• r•partis „ raison de 25 ml par flacon ; chaque laboratoire a reŽu deux flacons par taux. Un •chantillon non inocul• a •t• joint au colis pour d•nombrement de la flore a•robie m•sophile par la m•thode NF ISO 4833. Etiquetage, exp€dition Les •chantillons cod•s (code connu uniquement du laboratoire expert) ont •t• plac•s dans des caisses isothermes contenant des blocs r•frig•rants et exp•di•s aux diff•rents laboratoires „ l’aide d’un transport express. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 22/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Un flacon t•moin temp•rature contenant un enregistreur de temp•rature a •t• joint au colis, afin de suivre la temp•rature au cours du transport et de la mesurer „ r•ception. Les •chantillons ont •t• livr•s en 24 h aux laboratoires collaborateurs. La temp•rature des •chantillons devait Œtre inf•rieure ou •gale „ 8‚C pendant le transport, et comprise entre 0‚C et 8‚C „ l’arriv•e. Analyses Les laboratoires collaborateurs et le laboratoire expert ont effectu• les analyses „ la fois par la m•thode alternative et par la m•thode de r•f•rence. 3.2 Contr…le des param„tres exp€rimentaux 3.2.1 Stabilit€ de la souche au cours du transport Afin de v•rifier la stabilit• de la souche de Escherichia coli 94, un d•nombrement des six flacons inocul•s a •t• effectu• le jour de l’inoculation, ainsi qu’apr†s 24 h et 48 h de conservation „ 2‚C ; les r•sultats sont report•s dans le tableau 7. Tableau 7 - D€nombrement d’Escherichia coli 94 par la m€thode NF EN ISO 4832 (en log UFC/ml) Taux 1 Taux 2 Taux 3 R•p•tition R•p•tition R•p•tition R•p•tition R•p•tition R•p•tition 1 2 1 2 1 2 J0 1,91 2,04 2,97 2,93 3,96 3,83 J1 1,89 1,77 2,92 2,99 3,83 3,90 J2 1,98 2,04 2,88 2,93 3,84 3,90 Aucune •volution de la souche n’est observ•e au bout de 48 h de conservation dans la caisse isotherme. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 23/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 3.2.2 R€sultats obtenus pour les deux m€thodes Les r•sultats de d•nombrement des coliformes par le laboratoire expert par la m•thode ISO 4832 et par la m•thode TEMPO… TC sont pr•sent•s dans le tableau 8, ainsi que les r•sultats obtenus „ partir des dilutions 1/40 et 1/400 pour la m•thode TEMPO… TC. Tableau 8 - R€sultats du laboratoire expert (en log UFC/g) Taux vis• (log UFC/g) M•thode de r•f•rence ISO 4832 Duplicat 1 <1 1„2 2„3 3„4 < 1,00 1,89 2,92 3,83 Duplicat 2 < 1,00 1,77 2,99 3,90 M•thode alternative TEMPO… TC Duplicat 1 D 1/40 D 1/400 < 1,00 < 1,00 1,85 2,08 2,92 2,86 3,83 3,83 Duplicat 2 D 1/40 D 1/400 < 2,00 < 2,00 2,00 < 2,00 2,93 2,86 4,32 4,08 Les taux de contamination vis•s ont •t• atteints. 3.2.3 Temp€rature des €chantillons ƒ r€ception Les temp•ratures mesur•es „ r•ception sont donn•es dans le tableau 9. Tableau 9 - Temp€rature des €chantillons ‡ r€ception Laboratoires A B C D E F G H I J K L 3.2.4 Temp•rature mesur•e „ r•ception (‚C) 2,6 3,4 4,9 2,0 4,2 3,2 3,2 4,8 2,7 1,4 4,9 4,8 Date de r•ception des •chantillons Date d’analyse J1 (18/10/2005) J1 (18/10/2005) Temp€rature des €chantillons pendant le transport Aucune anomalie n’a •t• observ•e pendant le transport ; la temp•rature mesur•e pendant le transport •tait comprise entre 0 et 3,5‚C. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 24/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 3.3 R€sultats des analyses 3.3.1 Synth…se des r€sultats obtenus par les deux m€thodes Une synth†se des r•sultats est pr•sent•e tableau 10 (r•sultats obtenus avec la dilution 1/40 par la m•thode TEMPO… TC) et tableau 11 (r•sultats obtenus avec la dilution 1/400 par la m•thode TEMPO… TC). Tableau 10 - Synth„se des r€sultats obtenus avec la dilution 1/40 par la m€thode TEMPO‚ TC (en log UFC/g) Niveau 0 Laboratoires M‚thode de Niveau 1 Niveau 2 Niveau 3 M‚thode M‚thode de M‚thode M‚thode de M‚thode M‚thode de M‚thode r‚f‚rence alternative r‚f‚rence alternative r‚f‚rence alternative r‚f‚rence alternative A <1 <1 <1 <1 2,00 1,95 2,00 1,85 2,90 2,96 2,97 3,23 3,95 3,95 4,08 3,72 B <1 <1 <1 <1 2,04 2,00 2,00 2,11 2,93 2,98 3,04 3,04 4,00 3,92 4,32 4,04 C <1 <1 <1 <1 1,93 2,00 1,86 2,11 2,71 2,83 2,86 2,72 3,85 3,85 3,96 4,08 D <1 <1 <1 <1 1,98 1,90 1,64 2,00 2,91 2,91 3,00 2,72 3,89 3,95 4,08 4,04 E <1 <1 <1 <1 2,04 2,11 1,77 1,84 2,93 2,93 2,92 2,86 3,93 3,99 4,04 3,89 F <1 <1 <1 <1 1,88 1,95 2,00 1,85 2,83 2,90 2,80 2,86 3,94 3,93 4,04 4,08 G <1 <1 <1 <1 1,98 2,11 2,04 2,04 2,80 2,90 3,11 2,76 3,85 3,77 3,96 4,32 H <1 <1 <1 <1 2,00 1,78 2,15 2,15 2,77 2,82 2,96 3,00 3,89 3,95 4,32 4,40 I <1 <1 <1 <1 2,08 1,95 2,08 1,85 2,86 2,95 3,04 3,04 3,93 3,94 4,08 4,18 J <1 <1 <1 <1 1,81 1,85 1,00 1,86 3,04 2,90 2,86 2,92 3,85 3,87 3,96 3,89 K <1 <1 <1 <1 1,98 1,85 1,93 1,77 2,90 2,91 2,92 3,08 3,89 3,95 4,08 4,04 L <1 <1 <1 <1 2,04 1,93 1,65 2,11 2,92 2,97 2,95 3,08 3,96 4,00 4,18 4,48 Tableau 11 - Synth„se des r€sultats obtenus avec la dilution 1/400 par la m€thode TEMPO‚‚ TC (en log UFC/g) Niveau 0 M‚thode Laboratoires de r‚f‚rence Niveau 1 Niveau 2 Niveau 3 M‚thode alternative M‚thode de r‚f‚rence M‚thode alternative M‚thode de r‚f‚rence M‚thode alternative M‚thode de r‚f‚rence M‚thode alternative A <1 <1 <2 <2 2,00 1,95 <2 2,00 2,90 2,96 2,64 2,86 3,95 3,95 3,92 3,97 B <1 <1 <2 <2 2,04 2,00 2,32 <2 2,93 2,98 2,76 2,65 4,00 3,92 4,00 3,91 C <1 <1 <2 <2 1,93 2,00 <2 2,00 2,71 2,83 2,77 2,32 3,85 3,85 4,04 3,85 D <1 <1 <2 <2 1,98 1,90 <2 2,32 2,91 2,91 2,77 2,85 3,89 3,95 4,08 4,18 E <1 <1 <2 <2 2,04 2,11 <2 2,00 2,93 2,93 2,65 2,52 3,93 3,99 3,76 3,66 F <1 <1 <2 <2 1,88 1,95 2,32 2,00 2,83 2,90 3,18 2,04 3,94 3,93 3,84 3,86 G <1 <1 <2 <2 1,98 2,11 2,52 2,00 2,80 2,90 2,93 2,86 3,85 3,77 4,04 3,98 H <1 <1 <2 <2 2,00 1,78 <2 <2 2,77 2,82 2,76 2,65 3,89 3,95 3,92 3,90 I <1 <1 <2 <2 2,08 1,95 2,32 <2 2,86 2,95 2,51 2,95 3,93 3,94 4,11 3,81 J <1 <1 <2 <2 1,81 1,85 <2 2,32 3,04 2,90 3,11 3,00 3,85 3,87 4,00 3,76 K <1 <1 <2 <2 1,98 1,85 2,00 2,00 2,90 2,91 2,77 3,04 3,89 3,95 4,04 3,85 L <1 <1 <2 <2 2,04 1,93 <2 <2 2,92 2,97 2,77 2,85 3,96 4,00 4,26 4,08 ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 25/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 3.3.2 Calcul du biais Pour chaque niveau, la diff•rence des moyennes des r•plicats (di) obtenues par la m•thode alternative et la m•thode de r•f•rence est calcul•e : di = (Mi,alt - Mi, r•f). La m•diane (MED {di} des di permet de d•terminer le biais D (MED{di} = biais D). Le biais D et l’•cart-type robuste S {di} = K1Sn donnent une statistique de t (t(d) = MED{di} n /S{di}). Cette valeur de t obtenue est compar•e „ une valeur critique trouv•e dans la table de Student (pour n = 12, t critique = 2,201). Les valeurs de t(d) obtenues par niveau sont report•es dans le tableau 12. Tableau 12 - Valeurs de t(d) obtenues par niveau Niveau Nombre de r‚sultats exploitables (nombre de laboratoires) 0 Biais D t(d) d 1/40 d 1/400 d 1/40 d 1/400 t critique ddl (n-1) n = 12 / / / / / / 1 n = 12 - 0,05 / 1,684 / 2,201 Biais non significatif 2 n = 12 0,08 - 0,16 2,400 3,647 2,201 Biais significatif 2,201 Biais significatif Biais non significatif (D 1/400) 3 n = 12 0,16 0,02 3,766 0,650 Conclusion Niveau critique : t(d) < t critique ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 26/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 3.3.3 Calcul de la r€p€tabilit€ Les valeurs obtenues pour la limite de r•p•tabilit•, ainsi que les valeurs obtenues pour le test F sont donn•es dans le tableau 13. Tableau 13 - Valeurs obtenues pour la limite de r€p€tabilit€ et valeurs pour le Test F Nombre de Limite de r‚p‚tatibilit‚ r‚sultats M‚thode M‚thode Niveau exploitables alternative de (nombre de r‚f‚rence d 1/40 d 1/400 laboratoires) d 1/40 d 1/400 F critique (0,05 ; n ; n) P% d 1/40 d 1/400 1 n = 12 0,226 0,458 / 4,12 / 2,69 1 / 2 n = 12 0,161 0,277 0,371 2,98 5,35 2,69 4 0 3 n = 12 0,144 0,319 0,279 4,88 15,44 2,69 1 0 Interpr•tation statistique P 5% : non significatif 0,1 % < P < 1 % : tr†s significatif 3.3.4 F calcul‚ 1 % < P < 5 % : significatif P < 0,1 % : hyper significatif Reproductibilit€ Les valeurs obtenues pour la limite de reproductibilit•, ainsi que les valeurs obtenues pour le test F sont donn•es dans le tableau 14. Tableau 14 - Valeurs obtenues pour la limite de reproductibilit€ et valeurs pour le Test F Niveau Nombre de r‚sultats exploitables (nombre de laboratoires) Limite de reproductibilit‚ M‚thode M‚thode alternative de r‚f‚rence d 1/40 d 1/400 F calcul‚ (ou 1/F) d 1/40 d 1/400 P% F critique (0,05 ; n - 1; n - 1) d 1/40 d 1/400 1 n = 12 0,274 0,500 / 3,34 / 2,82 3 / 2 n = 12 0,183 0,392 0,550 4,57 9,01 2,82 1 0 3 n = 12 0,157 0,445 0,308 8,07 3,87 2,82 0 2 Interpr•tation statistique P 5% : non significatif 0,1 % < P < 1 % : tr†s significatif ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 1 % < P < 5 % : significatif P < 0,1 % : hyper significatif 27/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Les rapports limite de reproductibilit• / limite de r•p•tabilit• sont donn•s dans le tableau 15. Tableau 15 - Rapports limite de reproductibilit€ / limite de r€p€tabilit€ Niveau Nombre de r‚sultats exploitables (nombre de laboratoires) Limite de reproductibilit‚ / limite de r‚p‚tabilit‚ M‚thode alternative M‚thode de r‚f‚rence d 1/40 d 1/400 1 n = 12 1,213 1,091 / 2 n =12 1,141 1,412 1,481 3 n =12 1,087 1,398 1,106 Niveau critique : reproductibilit• / r•p•tabilit• : < 2 3.3.5 Dispersion entre les laboratoires Nombre de r‚sultats exploitables (nombre de laboratoires) M‚thode de r‚f‚rence F ou 1/F* 1 n =12 2 3 Niveau M‚thode alternative F ou 1/F F crititque (0,05 ; n - 1 ; n) d 1/40 d 1/400 1,942 1,382 / 2,79 n =12 1,602 2,990 1,602 2,79 n =12 1,363 2,907 1,447 2,79 Niveau critique : F ou 1/F < F (critique) 3.4 Discussion Il est „ noter qu’un seul lot de milieu VRBL prŒt „ l’emploi, fourni par la Soci•t• BIOMERIEUX a •t• utilis• pour la r•alisation de la m•thode de r•f•rence par les laboratoires collaborateurs, •vitant ainsi d’introduire toute variabilit• li•e au milieu utilis• dans la m•thode de r•f•rence. Le biais obtenu entre la m•thode TEMPO… TC et la m•thode ISO 4832 est non significatif pour le niveau 1 avec la dilution 1/40 et pour le niveau 3 avec la dilution 1/400. Un biais significatif est observ• pour le niveau 2 avec les deux dilutions et pour le niveau 3 pour la dilution 1/40. Cependant, les •carts observ•s entre les deux m•thodes sont faibles, •tant compris entre -0,16 et +0,16 Log UFC/g. Les valeurs observ•es lors de l’•tude pr•liminaire variaient de -0,368 Log UFC/g et 0,015 Log UFC/g. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 28/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Les tests statistiques indiquent une diff•rence entre les limites de r€p€tabilit€ et de reproductibilit€ des deux m•thodes. L’annexe 6 r•pertorie des limites de r•p•tabilit• et de reproductibilit• calcul•es au cours de diff•rentes •tudes collaboratives pour les m•thodes de r•f•rence. Ainsi, selon le niveau de contamination et le type de matrice, les valeurs observ•es pour la m•thode ISO 4832 varient de : - 0,117 et 0,352 pour les limites de r•p•tabilit•, - 0,157 et 0,951 pour les limites de Reproductibilit•. En fonction du taux de contamination et de la dilution r•alis•e, la m•thode alternative TEMPO‚ TC montre : - des limites de r•p•tabilit• comprises entre 0,277 et 0,371 - des limites de Reproductibilit• comprises entre 0,308 et 0,550. Les valeurs obtenues pour la m•thode de r•f•rence au cours de cette •tude sont particuli†rement satisfaisantes ; les valeurs de la m•thode alternative TEMPO… TC sont similaires aux valeurs habituellement observ•es pour la m•thode ISO 4832. Les rapports limite de reproductibilit€ / limite de r€p€tabilit€ observ•s pour la m•thode TEMPO… TC et la m•thode de r•f•rence sont comparables entre les laboratoires. La dispersion entre les laboratoires est d’ordre similaire entre les deux m•thodes : - au niveau 1, - aux niveaux 2 et 3, avec la dilution 1/400 lors de la r•alisation de la m•thode TEMPO… TC. La dilution 1/40 g•n†re une dispersion entre laboratoires, sup•rieure „ celle de la m•thode de r•f•rence aux niveaux 2 et 3. Il est „ noter que cette dilution ne repr•sente pas la dilution usuellement utilis•e pour ces niveaux de contamination. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 29/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX 4 CONCLUSION Les conclusions de l’€tude comparative sont les suivantes : La m€thode TEMPO‚ TC montre une lin€arit€ et une exactitude relative satisfaisantes. Certains €carts de d€nombrements sont observ€s entre les deux m€thodes, plus particuli„rement dans la cat€gorie v€g€taux. Vingt produits v€g€taux suppl€mentaires ont €t€ analys€s, par la m€thode TEMPO‚ TC et par la m€thode de r€f€rence NF EN ISO 4832, avec deux marques de milieu VRBL. Lors de la comparaison des donn€es avec les d€nombrements issus de la m€thode TEMPO‚ TC, les r€sultats montrent l’h€t€rog€n€it€ de la flore d€nombr€e entre deux milieux diff€rents utilis€s dans une m†me m€thode de r€f€rence. Alors, selon le cas, le d€nombrement par la m€thode TEMPO‚ TC est davantage similaire ‡ celui obtenu par l’un ou l’autre des milieux VRBL test€s. Les identifications men€es ‡ partir de colonies sur milieu VRBL indiqueraient de meilleures s€lectivit€ et sp€cificit€ de la m€thode TEMPO‚ TC en comparaison ‡ celles de la m€thode de r€f€rence, m€thode de r€f€rence dont les caract€ristiques de sp€cificit€ et s€lectivit€ d€pendraient de la marque de milieu utilis€. Les limites de r€p€tabilit€ de la m€thode alternative sont sup€rieures ‡ celle de la m€thode de r€f€rence, mais montrent des valeurs satisfaisantes. Les biais entre les deux m€thodes sont faibles, compris entre -0,368 Log UFC/g et 0,015 Log UFC/g. La m€thode TEMPO‚ TC montre une s€lectivit€ et sp€cificit€ satisfaisantes L’int€r†t majeur de la m€thode TEMPO‚ TC r€side : - dans le gain de temps important au niveau de l’analyse et de la lecture, dans le gain de place ‡ l’incubation des cartes TEMPO‚ TC et la gestion facilit€e des d€chets, dans la traˆabilit€ compl„te de l’analyse. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 30/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Les conclusions de l’€tude interlaboratoire sont les suivantes : Les biais observ€s entre les deux m€thodes montrent des valeurs faibles. Les limites de r€p€tabilit€ et de Reproductibilit€ de la m€thode TEMPO‚ TC sont comparables ‡ celles g€n€ralement observ€es pour la m€thode de r€f€rence ISO 4832. La dispersion des r€sultats entre laboratoires est similaire entre les deux m€thodes, pour les dilutions g€n€ralement appliqu€es au d€nombrement des coliformes totaux par la m€thode TEMPO‚ TC. ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 31/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Annexe 1 - Notice d’utilisation de la m€thode alternative ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 32/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 33/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 34/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 35/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Annexe 2 - M€thode de r€f€rence Suspension m†re (produit solide) Echantillon pour essai (produit liquide) et dilutions d•cimales en tryptone NaCl 1 ml par bo•te Ajout de 15 ml de milieu s•lectif solide : g•lose lactos•e bili•e au cristal violet et au rouge neutre VRBL Solidification Ajout de 4 ml de VRBL (double couche) Incubation 24 h 2 h „ 30‚C 1 Comptage des colonies caract•ristiques (violac•es, d'un diam†tre de 0,5 mm ou plus, parfois entour•es d'une zone rougeˆtre) ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 36/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Annexe 3 - Etude de lin€arit€ Graphiques bi-dimensionnels : analyse avec dilutions combin€es Barres pour chien 9,00 9,00 8,00 8,00 7,00 7,00 log(M€thode alternative) log(M€thode alternative) Steak hach€ 6,00 5,00 4,00 3,00 6,00 5,00 4,00 3,00 2,00 2,00 1,00 1,00 0,00 0,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 0,00 1,00 2,00 log(M€thode de r€f€rence) 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 7,00 8,00 9,00 Cr„me patissi„re 9,00 9,00 8,00 8,00 7,00 7,00 log(M€thode alternative) log(M€thode alternative) 4,00 log(M€thode de r€f€rence) Concombres 6,00 5,00 4,00 3,00 6,00 5,00 4,00 3,00 2,00 2,00 1,00 1,00 0,00 0,00 0,00 3,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 7,00 8,00 0,00 9,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 log(M€thode de r€f€rence) log(M€thode de r€f€rence) Filet de cabillaud 9,00 8,00 log(M€thode alternative) 7,00 6,00 5,00 4,00 3,00 2,00 1,00 0,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 log(M€thode de r€f€rence) ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 37/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Graphiques bi-dimensionnels : analyse avec dilutions les plus usuelles Barres pour chien 9,00 9,00 8,00 8,00 7,00 7,00 6,00 log(M€thode alternative) log(M€thode alternative) Steak hach€ 5,00 4,00 3,00 6,00 5,00 4,00 3,00 2,00 2,00 1,00 1,00 0,00 0,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 0,00 1,00 2,00 log(M€thode de r€f€rence) 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 7,00 8,00 9,00 Cr„me patissi„re 9,00 9,00 8,00 8,00 7,00 7,00 log(M€thode alternative) log(M€thode alternative) 4,00 log(M€thode de r€f€rence) Concombres 6,00 5,00 4,00 3,00 6,00 5,00 4,00 3,00 2,00 2,00 1,00 1,00 0,00 0,00 3,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 0,00 log(M€thode de r€f€rence) 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 log(M€thode de r€f€rence) Filet de cabillaud 9,00 8,00 log(M€thode alternative) 7,00 6,00 5,00 4,00 3,00 2,00 1,00 0,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 log(M€thode de r€f€rence) ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 38/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Droites de r€gression : dilutions combin€es Barre pour chien - R€gression OLS 1 Concom bres - R€gression GMFR 6,00 6,00 y = 1,2193x - 0,7233 y = 1,0532x - 0,172 5,00 5,00 4,00 4,00 3,00 3,00 2,00 2,00 1,00 1,00 0,00 0,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 0,00 6,00 1,00 2,00 4,00 5,00 6,00 Filet de cabillaud - R€gression OLS 1 Cr„m e patissi„re - R€gression OLS 1 6,00 6,00 y = 1,1318x - 0,5623 y =1,0706x - 0,1333 5,00 5,00 4,00 4,00 3,00 3,00 2,00 2,00 1,00 1,00 0,00 0,00 0,00 3,00 R€f €r e n c e R€f €r e n c e 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 0,00 6,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 R€f €r e n c e R€f €r e n c e Steak hach€ - R€gression OLS 1 6,00 y = 0,9803x + 0,0719 5,00 4,00 3,00 2,00 1,00 0,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 R€f €re nc e ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 39/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Droites de r€gression : dilutions usuelles Barre pour chien - R€gression OLS 1 Concom bres - R€gression OLS 1 6,00 6,00 y =1,1336x - 0,4879 y =1,1746x - 0,6388 5,00 5,00 4,00 4,00 3,00 3,00 2,00 2,00 1,00 1,00 0,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 0,00 6,00 0,00 1,00 2,00 R€f €r e n c e 3,00 4,00 5,00 6,00 R€f €re nc e Cr„m e patissi„re - R€gression OLS 1 Flet de cabillaud - R€gression OLS 1 6,00 6,00 y =1,0302x - 0,0568 5,00 y =1,1449x - 0,5753 5,00 4,00 4,00 3,00 3,00 2,00 2,00 1,00 1,00 0,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 0,00 6,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 R€f €re nc e R€f €re nc e Steak hach€ - R€gression OLS 1 6,00 y = 0,9099x + 0,254 Alternative 5,00 4,00 3,00 2,00 1,00 0,00 0,00 2,00 4,00 6,00 R€f€rence ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 40/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Annexe 4 - Exactitude relative Graphiques bidimensionnels Produits alimentation animale 9,00 9,00 8,00 8,00 7,00 7,00 6,00 6,00 log(M€thode alternative) log(M€thode alternative) Produits carn€s 5,00 4,00 3,00 5,00 4,00 3,00 2,00 2,00 1,00 1,00 0,00 0,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 0,00 1,00 2,00 log(M€thode de r€f€rence) 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 7,00 8,00 9,00 7,00 8,00 9,00 Produits laitiers 9,00 9,00 8,00 8,00 7,00 7,00 6,00 6,00 log(M€thode alternative) log(M€thode alternative) 4,00 log(M€thode de r€f€rence) Produits v€g€taux 5,00 4,00 3,00 5,00 4,00 3,00 2,00 2,00 1,00 1,00 0,00 0,00 3,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 0,00 1,00 2,00 log(M€thode de r€f€rence) 3,00 4,00 5,00 6,00 log(M€thode de r€f€rence) Produits de la mer Tous produits 9,00 9,00 8,00 8,00 7,00 log(M€thode alternative) log(M€thode alternative) 7,00 6,00 5,00 4,00 3,00 2,00 5,00 4,00 3,00 2,00 1,00 1,00 0,00 0,00 6,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 7,00 8,00 9,00 0,00 log(M€thode de r€f€rence) ADRIA D•veloppement ‚ Synth„se TEMPO TC (Version 2) 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 log(M€thode de r€f€rence) 41/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Droites de r€gression pour chacune des matrices et pour l’ensemble des matrices Produits carn€s - R€gression OLS 1 Produits d'alimentation animale R€gression OLS 1 6,00 6,00 y = 0,9597x + 0,0405 5,00 5,00 4,00 4,00 Alternative Alternative y = 0,8638x - 0,0347 3,00 2,00 1,00 3,00 2,00 1,00 0,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 0,00 0,00 6,00 1,00 3,00 4,00 5,00 6,00 R€f€rence Produits v€g€taux - R€gression OLS 1 Produits laitiers - R€gression GMFR 6,00 6,00 y = 0,6109x + 0,9972 y = 1,0522x - 0,1655 5,00 5,00 4,00 4,00 Alternative Alternative 2,00 R€f€rence 3,00 2,00 1,00 0,00 0,00 3,00 2,00 1,00 0,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 0,00 1,00 R€f€rence 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 R€f€rence Produits de la mer - R€gression GMFR y = 1,0608x - 0,555 Tous produits - R€gression OLS 1 6,00 6,00 5,00 5,00 4,00 4,00 Alternative Alternative y = 0,8551x + 0,1842 3,00 2,00 2,00 1,00 1,00 0,00 0,00 0,00 3,00 1,00 2,00 3,00 4,00 5,00 0,00 6,00 2,00 3,00 4,00 5,00 6,00 R€f€rence R€f€rence ADRIA D•veloppement Synth„se TEMPO‚ TC (Version 2) 1,00 42/43 4 aoƒt 2008 BIOMERIEUX Annexe 5 - Exactitude relative : Compl€ment d’€tude ‰ Produits v€g€taux Š (dates d’analyse : 12 et 20 octobre 2005) Droites de r€gression pour la cat€gorie ‰ Produits V€g€taux Š TEMPO‚ TC / VRBL A (22 €chantillons) Produits v€g€taux - R€gression OLS 1 8,00 y = 0,9402x - 0,0223 6,00 4,00 2,00 0,00 0,00 2,00 4,00 6,00 8,00 R€f €r e n c e TEM PO‚ TC / VRBLA (32 €chantillons) Produits v€g€taux - R€gression OLS 1 8,00 y = 0,814x + 0,3744 6,00 4,00 2,00 0,00 0,00 2,00 4,00 6,00 8,00 R€f €r e n c e TEMPO‚ TC / VRBL B (22 €chantillons) Produits v€g€taux - R€gression GMFR 8,000 y = 1,0675x - 0,63 6,000 4,000 2,000 0,000 0,00 2,00 4,00 6,00 8,00 R€f € r e n c e ADRIA D•veloppement Synth„se TEMPO‚ TC (Version 2) 43/43 4 aoƒt 2008