Proposition de Stage : 2013-2014

Proposition de Stage : 2013-2014
Intitulé du stage
Couplage des signaux physiologiques et de données d’IRM fonctionnelle chez l’Homme sain:
acquisition et traitement des données.
Contexte du stage
Le laboratoire de Neurosciences Cognitives (LNC) est une unité INSERM qui se situe à l’Ecole
Normale Supérieure à Paris (5ème arr). Le LNC a pour but d’élucider les fondements
biologiques des fonctions mentales humaines et leurs altérations possibles dans les maladies
neurologiques et neuropsychiatriques. Ces recherches se basent sur la psychologie
expérimentale, la modélisation mathématique et la neuroimagerie (acquisition des données
au Centre de NeuroImagerie de Recherche, Hôpital Pitié-Salpêtrière, 13ème arr).
Objectifs du stage
Ce stage s’inscrit dans un projet de recherche en neuroimagerie chez l’Homme sain qui a
pour but d’étudier l’influence des facteurs physiologiques sur les données d’IRM
fonctionnelle.
Le but de ce stage est de mettre en place une procédure d'acquisition et de traitement des
données physiologiques (électrocardiographie, électromyographie, conductance cutanée,
respiration, diamètre pupillaire) afin de les corréler avec des données d'IRM fonctionnelle.
Les procédures mises en place au cours de ce stage seront ensuite utilisées largement dans
les études de neuroimagerie cognitives effectuées dans notre laboratoire.
L’enregistrement des données d’IRM fonctionnelle se fera chez des volontaires sains au
repos (IRM 3T, Siemens) et les signaux physiologiques seront acquis par des logiciels
propriétaires ("Recorder" de BrainProducts, "Acknowledge" de Biopac). Les données
physiologiques enregistrées dans l'IRM sont bruitées par l'acquisition IRM. Le but sera donc
de débruiter ces différents signaux (filtrage, analyse en composantes indépendantes, …)
pour ensuite les corréler avec les données d'IRM fonctionnelles.
Les différentes étapes de ce stage seront :
- Mise en place des enregistrements physiologiques et synchronisation avec l’IRM
avant l’acquisition.
- Acquisition des données d’IRM fonctionnelle et des différents facteurs
physiologiques.
- Traitement des signaux physiologiques, débruitage (toolbox EEGlab,
http://sccn.ucsd.edu/eeglab/).
- Traitement des données d'IRM fonctionnelles de repos (toolbox SPM sous Matlab :
http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm).
- Corrélation des signaux physiologiques débruités avec les données d’IRM
fonctionnelle de repos.
Compétences demandées
-
Avoir de solides connaissances de programmation (Matlab souhaitable).
Avoir des bases en électrophysiologie.
Avoir des bases en traitement du signal.
Bon niveau en anglais (tutoriels, articles scientifiques, réunions d'équipe).
Faire preuve de curiosité, d’autonomie, de rigueur et être motivé(e).
Compétences acquises
Au terme des 6 mois de stage, l’étudiant aura acquis les compétences suivantes :
- Compréhension du fonctionnement d’un laboratoire de recherche et d’une
plateforme expérimentale.
- Gestion des étapes d’un projet de recherche
- Acquisition de données d’IRM fonctionnelle et de facteurs physiologiques
- Traitement de signaux physiologiques variés
- Connaissances de bases en physiologie et fonctionnement du cerveau
Modalités
D’une durée de 6 mois, le stage aura lieu au Laboratoire de Neurosciences Cognitives, Unité
INSERM U 960 à l’Ecole Normale Supérieure, 29 rue d’Ulm 75005 Paris.
La mise en place du protocole expérimental et l'acquisition des données seront réalisées au
Centre de NeuroImagerie de Recherche (CENIR) Hôpital Pitié-Salpêtrière, Bâtiment ICM - 47
boulevard de l'Hôpital 75013 Paris.
Rémunération
Le (la) stagiaire percevra une gratification de stage d'environ 400€/mois.
Nom du responsable du stage
Anne-Dominique LODEHO (Ingénieur de Recherche INSERM)
Email : [email protected]
Téléphone : 01.44.32.26.43
Laboratoire de Neurosciences Cognitives, Unité INSERM U960
Ecole Normale Supérieure - 29, rue d'Ulm 75005 Paris