programme définitif

PROGRAMME
Lundi 11 Janvier 2016
17:00 - 19:00
Inscriptions
19:15 - 20:00
Apéritif
20:00 - 21:00
Dîner
21:15 - 21:20
Ouverture des 12ème rencontres Plantes Bactéries (Frédérique
Van Gijsegem)
21:20 - 22:00
Session introductive - Invité : Martin Grube (Institute of
Plant Sciences, Karl-Franzens-University, Graz, Austria)
Bacteria in lichens: the bacterial microbiome of a symbiotic structure
Mardi 12 Janvier 2016
08:30 Session 1 : Communautés bactériennes associées aux plantes et à leurs
bio-agresseurs (hologénome, bactériome) (Modérateurs : Lionel Moulin et
Alain Sarniguet)
Invité : Fabrice Roux (LIPM, Castanet-Tolosan) : The genetics of plant microbe interactions in the model plant species Arabidopsis thaliana: from crop
strains to microbiomes in natural settings.
09:10 Plant root exudates shape the diversity of denitrifying bacteria and
stimulate their activity. Haichar Feth el Zahar (Université C. Bernard, Lyon)
09:25 Influence de la stratégie de gestion des ressources des plantes sur le
fonctionnement des communautés bactériennes dénitrifiantes dans la rhizosphère
via l’exsudation racinaire. Julien Guyonnet (Université C. Bernard, Lyon)
09:40 Diversity and dynamics of seed-associated microbial assemblages.
Matthieu Barret (IRHS, Beaucouzé)
09:55 Differences in stability of the seed microbiota in response to invasion by
phytopathogenic microorganisms. Samir Rezki (IRHS, Beaucouzé)
10:10 Effect of heavy metals on invasive knotweed (Fallopia spp.) and the
combined effect of metal pollution and plant colonization on MultiDrug Resistance
(MDR) phenotypes in soil bacteria. Serge Michalet (Ecologie microbienne,
Villeurbanne)
10:30 - 11:00
Pause
11:00 Uncovering wheat root-associated microbial communities by an amplicon
barcoding approach. Cindy Dasilva (IPME, IRD, Montpellier)
11:15 Impact of biosolid containing nanomaterials on a soil-plant-bacteria
system. Blanche Collin (IBEB/SBVME/LEMIRE, Saint Paul lez Durance)
11:30 Opération pilote de renforcement des populations d'Astragalus
tragacantha dans le Parc National des Calanques. Lucie Miché (IMBE, Aix
Marseille)
11:45 - 12:15
Présentation Posters Impairs
#1
Escaping underground NETs: extracellular DNases are novel virulence
factors of the plant pathogenic bacterium Ralstonia solanacearum. Caitilyn Allen
#3
Recherche de VNTR chez Bulkholderia glumae et diversité des souches
isolées de Colombie. Gilles Béna
#5
Toward the characterisation of the Nod Factor independent recognition
events between Aeschynomene and its Bradyrhizobium symbiotic partner.
Fabienne Cartieaux
#7
EUCLID: Leveraging IPM for sustainable production of fruit and
vegetable crops in partnership with China. Charlotte Chandeysson
#9
Mise à jour de la classification du groupe Pseudomonas syringae et des
outils simples et rapides d'identification. Charlotte Chandeysson
# 11
Analyse métagénomique de la diversité des bactéries pectinolytiques
issues de champ de pomme de terre isolées à partir de symptômes de jambe noire.
Jérémy Cigna
# 13
Influence of carbon sources on the mobility of plant pathogenic bacteria
of the genus Dickeya. Nicole Cotte-Pattat
# 15
Denitrification process by Pseudomonas brassicacearum. Sylvain
Fochesato
# 17
Tracking
type
three
effectors
solanacearum/eggplant interaction through
approaches. Jérémy Guinard
(T3E)
role
in
Ralstonia
functional and evolutionary
# 19
Xylella fastidiosa outbreak in Europe : new genotypes in Corsica. Bruno
Legendre
12:30 - 13:30
Déjeuner
14:00 -16:00
Table ronde Approches GWA (Genome Wide Association)
animée par Richard Berthomé et Laurent Noël
17:00 Session 2 : Programmes symbiotiques : composantes, contrôle, origine
évolutive (Modérateurs : Pascal Ratet et Florence Wisniewski)
Invité : Lionel Navarro (ENS, Paris) : Transcriptional control of immuneresponse genes by DNA methylation and demethylation.
17:40 Multiple steps control immunity during the legume rhizobia symbiotic
interaction. Fathi Berrabah (IPS2, Orsay)
17:55 Proteomics analysis of a defensive nodule points to a negative role of
ethylene during the late stage of the symbiosis. Benjamin Gourion (IPS2, Orsay)
18:10 Transcripto-proteomic dissection of differentiated bacteroid physiology in
the Legume-Rhizobium symbiosis. Florian Lamouche (I2BC, Gif sur Yvette)
18:25 Molecular analysis of BclA, an antimicrobial peptide transporter involved
in bacteroid differentiation during Aeschynomene/Bradyrhizobium symbiosis.
Quentin Barrière (I2BC, Gif sur Yvette)
18:40 To inoculate or not to inoculate… On the interest of bringing back
together original symbiotic partners. Yves Prin (LSTM, Montpellier)
18:55 - 19:25
Présentation Posters Impairs (suite)
# 21
Use of Chlorophyll Fluorescence Imaging to phenotype the suppression
by XopF1 and Hpa2 of a HR induced by non-pathogenic strains of Xanthomonas
on Nicotiana benthamiana and Capsicum annuum. Valérian Meline
# 23
Do small interfering RNAs and RNAses III play roles in Medicago
truncatula nodule development? Jérémy Moreau
# 25
Biocontrôle : étude d’un moyen de lutte contre Dickeya, agent pathogène
responsable de la jambe noire et de la pourriture molle sur pomme de terre.
Euphrasie Munier
# 27
Caractériser des ressources génétiques pour lutter contre le cortège
d’espèces de Pectobacterium et Dickeya pathogènes de la pomme de terre.
Angélique Quêtu-Laurent
# 29
Emergence of Xanthomonas citri pv. citri in Martinique. Damien
Richard
# 31
Cerium oxide nanoparticles modulate plant response and plant bacteria
interactions. Catherine Santaella
# 33
Identifying Xanthomonas oryzae pv. oryzae strains and adapted sources of
resistance among rice breeding lines in Mali. Cheik Tekete
# 35
Exploration de la composante épigénomique de la stimulation des
défenses du pommier. Romain Warneys
# 37
How diverse is the Ralstonia solanacearum species complex in the SouthWest Indian Ocean islands? Noura Yahiaoui
19:30 - 20:30
Dîner
21:00
Session posters impairs
Mercredi 13 Janvier 2016
08:30 Session 3 : Réponses moléculaires et résistance
(Modérateurs : Christophe Garcion et Lionel Navarro)
des
plantes
Invité : Laurent Deslandes (LIPM, Castanet-Tolosan) : The Arabidopsis RRS1R/RPS4 immune receptor pair senses bacterial effector activities
09:10 Targeted promoter editing for rice resistance to Xanthomonas oryzae pv.
oryzae reveals functional variation among SWEET14-inducing TAL effectors.
Florence Auguy (IPME, IRD, Montpellier)
09:25 Flavescence dorée phytoplasma/grapevine interactions: identification and
characterization of surface proteases and identification of plant genes involved in
FD resistance. Camille Jollard (UMR 1332 Biologie du Fruit et Pathologie,
Bordeaux)
09:40 Engineering broad resistance tailored against rice bacterial blight in Mali.
Hinda Doucouré (Université des Sciences Techniques et Technologiques de
Bamako, Mali)
09:55 Insights into the molecular basis of rhamnolipid and surfactin perception
by plant cells. Patricio Luzuriaga (UFR SEN, Reims)
10:10 A knowledge-based molecular screen uncovers a broad spectrum
OsSWEET14 resistance allele to bacterial blight from wild rice. Mathilde Hutin
(IPME, IRD, Montpellier)
10:30 - 11:00
Pause
11:00 Transcriptomic and physiological changes of wheat in response to
beneficial and pathogenic bacteria. Daniel Garcia-Seco (IPME, IRD,
Montpellier)
11:15 An adaptor kinase confers expanded recognition specificity to a plant
NLR: Bases génétiques et mécanistiques de la résistance à la pourriture noire chez
Arabidopsis. Laurent Noël (LIPM, Castanet-Tolosan)
11:30 - 12:00
Présentation Posters pairs
#2
First lessons from
metabolomics. Benoit Alunni
Aeschynomene/Bradyrhizobium
whole
nodule
#4
Plant response to biotic and abiotic stresses: mechanisms involved in
Arabidopsis thaliana defense response modulation to Ralstonia solanacearum in a
global warming context. Richard Berthomé
#6
Importance of hydathodes in controlling Brassicaceae vascular immunity
to Xanthomonas. Aude Cerruti
#8
Diversité des agrobactéries de la rhizosphère. David Chapulliot
# 10
Resistance of Dickeya and Pectobacterium to antimicrobial peptides: a
Gram-positive solution for soft rot enterobacteria. Guy Condemine
# 12
Characterization of the cassava bacterial blight in Venezuela: diversity of
Xanthomonas axonopodis pv. Manihotis (xam) and its talome. Carolina Flores
# 14
Towards identification and characterization of flavescence dorée
phytoplasma effectors. Christophe Garcion
# 16
A single natural nucleotide mutation in the efpR gene enhance the in
planta fitness of the bacterial pathogen Ralstonia solanacearum. Alice Guidot
# 18
Génomique évolutive du complexe d’espèces Xanthomonas axonopodis,
impact de la recombinaison dans la divergence et l’adaptation. Marion Le Saux
# 20
Medicago truncatula nodule-root (noot) genes are guards of the symbiotic
organ identity. Kevin Magne
12:30 - 13:30
Déjeuner
17:00 Session 4 : Evolution,phylogénie et taxonomie
(Modérateurs : Lionel Gagnevin et Alice Guidot)
des
bactéries
Invité : Adrien Rieux (University College, London, UK) : Inferences from tipcalibrated phylogenies: conceptual bases, applications and prospects in plantpathogenic bacteria.
17:40 Divergent evolution of inorganic nitrogen metabolism in Ralstonia
solanacearum strains led to distinct responses to low-oxygen conditions. Beth
Dalsing (University of Wisconsin, Madison, USA)
17:55 Diversity of TAL effectors from Xanthomonas strains responsible for
common bacterial blight of bean. Mylène Ruh (IRHS, Beaucouzé)
18:10 In planta natural transformation: one of driving forces of evolution in
R. solanacearum. Franck Bertolla (Ecologie microbienne, Villeurbanne)
18:25 Simplified MLSA schemes for species identification of plant-pathogenic
bacteria. Perrine Portier (IRHS, Beaucousé)
18:40 TALbase and QueTAL: tools for the study of TAL effectors function and
evolution. Alvaro Pérez -Quintero (IPME, IRD, Montpellier)
18:55 - 19:25
Présentation Posters pairs (suite)
# 22
Validation of a detection scheme based on PCR and isolation for the
detection of Xanthomonas axonopodis pv. allii in vegetative parts of Alliaceae and
in onion seeds. Aurélie Moreau
# 24
Soil, wheat genotype and their interaction impact PGP patterns of
culturable endophytic bacteria. Lionel Moulin
# 26
Diversité et structuration des populations de Pseudomonas syringae en
vergers d’abricotier. Luciana Parisi
# 28
Effet de l’inoculation de la bactérie PGPR Azospirillum sur l’abondance et
la diversité génétique de groupes fonctionnels microbiens phytobénéfiques de la
rhizosphère du maïs. Sébastien Renoud
# 30
Modification of maize xylem sap and leaf metabolite profiles in response
to seed inoculation by the PGPR Azospirillum lipoferum CRT1. Camille Rozier
# 32
The cytokinin signalling RRB3 transcription factor regulates the
expression of the symbiotic nodulation genes NSP2 and bHLH476 in Medicago
truncatula. Sovanna Tan
# 34
Symbiose associative Azospirillum / céréales : vers l’identification de
déterminants génétiques végétaux essentiels pour l’interaction. Marine Valette
# 36
Histidine kinases hybrides chez Azospirillum : de la génomique à
l’analyse fonctionnelle. Florence Wisniewski-Dyé
# 38
Natural variation of nitrogen nutrition effect on Arabidopsis thaliana
tolerance to Dickeya dadantii. Alia Dellagi
19:30 - 20:30
Dîner
21:00
Session posters pairs
Jeudi 14 Janvier 2016
08:30 Session 5 : Physiologie, génétique et génomique des bactéries
(Modérateurs : Wafa Achouak et Guy Condemine)
Invité : Christoph Keel (Université de Lausanne, Suisse) : Bodyguards of plant
roots: beneficial rhizosphere bacteria with antifungal and insecticidal activities.
09:10 Ralstonia solanacearum infections change the chemical composition of
tomato xylem sap. TiffanyLowe (University of Wisconsin, Madison, USA)
09:25 Un ARN régulateur plasmidique contrôle l'expression de gènes
flagellaires chromosomiques chez la bactérie phytopathogène Agrobacterium
fabrum. Benjamin Diel (Ecologie microbienne, Villeurbanne)
09:40 Régulation de la voie métabolique des acides hydroxycinnamiques chez
Agrobacterium fabrum et importance écologique dans l’interaction avec la plante.
Thibault Meyer (Ecologie microbienne, Villeurbanne)
09:55 Quorum sensing et transfert des plasmides chez le phytopathogène
Agrobacterium vitis. Quentin Duplay (Ecologie microbienne, Villeurbanne)
10:10 The Ralstonia solanacearum secretome: type 3 effectors, type 3associated proteins and their role in pathogenicity. Fabienne Vailleau (LIPM,
Castanet-Tolosan)
10:30 - 11:00
Pause
11:00 GABA signaling of the host plant suppresses quorum-sensing and the
horizontal transfer of the virulence plasmid in Agrobacterium tumefaciens.
Almudena Gonzalez-Mula (I2BC, Gif sur Yvette)
11:15 Multifunctionality of Bacillus lipopeptide antibiotics: roles in plantmicrobe interactions and disease control. Marc Ongena (Laboratoire Microbial
Processes and Interactions, Gembloux, Belgique)
11:30 Full elucidation of the hitherto unknown structure of albicidin, a potent
antibiotic produced by Xanthomonas albilineans. Stéphane Cociancich (BGPI,
CIRAD, Montpellier)
12:00 - 13:30
Déjeuner
14:00 - 16:00
Table ronde PAcBio, animée par Denis Faure et Alice Guidot
avec la participation de Baptiste Majonnade et Ludovic Legrand
17:15 Session 6 : Emergence et lutte biologique (Modérateurs : Marie-Anne
Barny et Denis Faure)
Invité : Yupa Hanboonsong (Khon Kaen University Thailand) Integrated
management of sugarcane white leaf disease and its vectors in Thailand.
17:55 A sap alien: breaking news of Xylella fastidiosa, an emerging plant
pathogen in France. Nicolas Denancé (IRHS, Beaucouzé)
18:10 Articulating microbiology with disease and community ecology to further
understanding of pathogen emergence. Christelle Lacroix (Pathologie Végétale,
INRA, Montfavet)
18:25 The acquisition of a Type 3 Secretion System as a first step for emergence
of novel pathogenic strains of Xanthomonas. Tristan Boureau (IRHS,
Beaucouzé)
18:40 PGPR et blé : quand la coopération fait la force ! Yoann Besset-Manzoni
(Ecologie microbienne, Villeurbanne)
18:55 Burkholderia phytofirmans PsJN-induced resistance in grapevine against
Botrytis cinerea: antimicrobial effect and/or priming of carbohydrate metabolism
and plant defenses? Lisa Sanchez (UFR SEN, Reims)
19:10 From crops to clouds and back again: The dual life of the ubiquitous
Pseudomonas syringae. Cindy Morris (Pathologie Végétale, INRA, Montfavet)
19:30 - 20:30
Dîner
21:00 et plus
Soirée Dansante
Vendredi 15 Janvier 2016
09:00 Session 7 : Dynamique, épidémiologie et génétique des populations
bactériennes associées aux plantes (Modérateurs : Marie Agnès Jacques et
Olivier Pruvost)
Invité : Xavier Bailly (INRA, Clermont-Ferrand) Diversification of rhizobia and
adaptation to their host plants through the lens of population of genomics: First
insights and pending questions.
09:40 Field-based experimental evolution of a natural population of Ralstonia
solanacearum phylotype I in response to monoculture of resistant and susceptible
eggplant. Jérémy Guinard (UMR PVBMT, Saint Pierre de la Réunion)
09:55 Xanthomonas arboricola fits the epidemic bacterial population model
with epidemic clones superimposed upon a recombinant network. Déborah Merda
(IRHS, Beaucouzé)
10:10 Ground covers in orchards: reservoirs and potential sources of inoculum
of Pseudomonas syringae. Benoit Borschinger (Pathologie Végétale, INRA,
Montfavet)
10:25 Epidemiology of potato bacterial wilt in Madagascar: genetic diversity
and population structure of the Ralstonia solanacearum species complex (Rssc).
Santatra Ravelomanantsoa (UMR PVBMT, Saint Pierre de la Réunion)
10:40 Le chancre bactérien du kiwi : une épidémie mondiale sur une culture de
domestication récente. Amandine Cunty (Anses)
10:55 Dynamique structurale et fonctionnelle des génomes des populations
phytopathogènes Dickeya solani et Dickeya dianthicola. Pauline Blin (I2BC, Gif
sur Yvette)
11:10 - 11:30
Pause
11:30 - 12:00
Clôture et remise des prix pour les doctorants : meilleure
présentation et meilleur poster
12:00 - 12:45
Déjeuner