Globc: outils, liens utiles
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Globc: outils, liens utiles
Working Note Globc: outils, liens utiles Table of Contents 1 Globc: outils et liens utiles . . . . . . . . . . . . . . 1.0.1 Machines: . . . . . . . . . . . . . . . 1.0.1.1 connections internes . . . . . . . . . . . . 1.0.1.2 connections externes: . . . . . . . . . . . . 1.0.2 Outils de développement: . . . . . . . . . . . . 1.0.2.1 configuration standard . . . . . . . . . . . . 1.0.2.1.1 ouverture de compte stagiaires: . . . . . . . . . 1.0.2.2 éditeurs . . . . . . . . . . . . . . . 1.0.2.3 logiciel de gestion de versions CVS: . . . . . . . . 1.0.2.4 Tcl Tk . . . . . . . . . . . . . . . 1.0.2.5 Langages de programmation . . . . . . . . . . 1.0.3 Simulations: . . . . . . . . . . . . . . . 1.0.3.1 logiciel PALM (http://www.cerfacs.fr/globc/PALM_WEB/) . . . 1.0.3.2 logiciel OASIS, PRISM (http://www.cerfacs.fr/~valcke/PRISM/prism.html) 1.0.3.3 modèles ORCAVAR, Arpège,ORCA(OPA): . . . . . . . 1.0.4 Manipulation de sorties de modèle (fichiers Netcdf): . . . . . . 1.0.4.1 logiciel OASIS (interpolateur) (http://www.cerfacs.fr/globc/software/oasis/index.html) . . . . . . 1.0.4.2 outils nco (/usr/local/bin) . . . . . . . . . . . 1.0.4.3 utilitaires de manipulation de fichiers Netcdf . . . . . . . 1.0.4.4 outils Statpack(imhotep) . . . . . . . . . . . 1.0.5 Visualisation: . . . . . . . . . . . . . . 1.0.5.1 Netcdf . . . . . . . . . . . . . . . 1.0.5.2 Ferret . . . . . . . . . . . . . . . 1.0.5.3 logiciel IDL, librairies xxx, vxx, interpolations . . . . . . 1.0.5.4 logiciel NCL . . . . . . . . . . . . . . 1.0.5.5 Wavelet analysis (http://paos.colorado.edu/research/wavelets/) . . . 1.0.5.6 outils divers: . . . . . . . . . . . . . . 1.0.6 Biblio, rapports: . . . . . . . . . . . . . . 1.0.6.1 connection PC Windows (meta) pour Word, Powerpoint . . . . 1.0.6.2 logiciel Latex . . . . . . . . . . . . . 1.0.6.3 outil Webify (conversion Powerpoint->html) . . . . . . . 1.0.6.4 divers . . . . . . . . . . . . . . . 1.0.7 Communications: . . . . . . . . . . . . . . 1.0.7.1 browser . . . . . . . . . . . . . . . 1.0.7.2 mailer pine . . . . . . . . . . . . . . 1.0.7.3 demande de congés: gnews . . . . . . . . . . 1.0.8 Moteur de recherche . . . . . . . . . . . . . 1.0.9 Liens labos . . . . . . . . . . . . . . . 1.0.9.1 CERFACS . . . . . . . . . . . . . . 1.0.9.2 Projets européens . . . . . . . . . . . . . 1.0.9.3 ECMWF . . . . . . . . . . . . . . . 1.0.9.4 IPSL-LODYC . . . . . . . . . . . . . 1.0.10 Publications . . . . . . . . . . . . . . . 1.0.11 Toulouse pratique . . . . . . . . . . . . . -i- . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 3 3 3 3 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 3 3 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 5 5 5 5 5 5 5 6 6 6 6 6 6 6 6 1 Globc: outils et liens utiles Mise à jour: janvier 2003 Note: dans tous les fichiers liés, remplacer "stagiaire" par votre nom de login ($USER ou $LOGNAME) 1.0.1 Machines: 1.0.1.1 connections internes .rhosts (http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Outils/.rhosts) 1.0.1.2 connections externes: Météo-France (log_kami) Ecmwf (ecaccess (http://www.ecmwf.int/services/ecaccess/)) : ajouter set path = ( $path /usr/ecaccess/client/tools ) dans votre .cshrc, voir Patrick Laporte pour permissions d’accès Idris (log_rhodes) 1.0.2 Outils de développement: 1.0.2.1 configuration standard 1.0.2.1.1 ouverture de compte stagiaires: 1. Demande formulaire (http://shou.cerfacs.fr/csg/services/CFX_Registration_Form.pdf) a CSG Vérifier que le terminal peut se connecter à elnino ou vortex Faire ajouter le nom de login du stagiaire à la liste GLO (et non GLOSEUL) (Gérard Déjean) 2. Détarer dans le HOME le fichier Env_Std.tar (http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Outils/Env_Std.tar) (est egalement disponible en local: /home/maisonna/Intendance/Ouverture_Compte). Commande: tar xvf Env_Std.tar 3. Lancer sh_install 4. Se deloguer et se reloguer. Le nouvel environnement doit etre active. 5. Mailer : modifier éventuellement le .pinerc Envoyer un premier mail au nouveau titulaire du compte pour que sa boite à lettre se crée -1- 6. Pour la personnalisation de l’environnement, voir Sophie Valcke (elle a le même) 7. (optionnel) Le fichier Env_Std_Imhotep.tar (compris dans Env_Std.tar) peut etre copie et decompresse sur la machine de calcul. Le script sh_install peut etre execute pour que l’environnement standard sur imhotep soit installe. 8. Imprimer les recommandations (README.txt (http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Outils/README.txt)) 1.0.2.2 éditeurs vi (http://www.cerfacs.fr/~daget/vi.htm) ou gvim (/usr/local/bin/gvim) version multimedia, securisee de vi (parc sgi et imhotep) (site officiel (http://www.vim.org/)) emacs (.emacs (http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Outils/.emacs)) 1.0.2.3 logiciel de gestion de versions CVS: ajouter CVSROOT dans votre .cshrc, ou alias du type: alias cvsorca ’cvs -d :local:/home/evian/ROOTCVS’ tkcvs: utilisation interactive de CVS (/usr/local/bin/tkcvs) CVS--Concurrent Versions System - Table of Contents (http://www.ensta.fr/~doc/in204/doc/cvs-doc-cederqvist/cvs-html/cvs_toc.html) CVS BUBBLES (http://www.loria.fr/~molli/cvs-index.html) Introduction à CVS (http://www.ensta.fr/~doc/in204/doc/cvs-doc-bouyer/cvs-html/index.html) CVShome.org (http://www.cvshome.org/docs/manual/cvs.html) Concurrent Version System (http://www-igm.univ-mlv.fr/~dr/XPOSE/CVS_DESPRE/CVS1.html) 1.0.2.4 Tcl Tk Environnement de developpement:vtcl (http://sourceforge.net/projects/vtcl) Le Portail de Tcl Tk Francophone (http://www.larochelle-innovation.com/tcltk/) Tcl Developer Site (http://www.scriptics.com/) 1.0.2.5 Langages de programmation Unix shells Unix (http://www.shellunix.com/index.html) Cours Unix debutants IDRIS (http://www.idris.fr/data/cours/cours-IDRIS.html#Unix-u) Commandes de base Unix (http://www.infres.enst.fr/~danzart/fiches/unix_abrege.html) -2- Fortran Manuel Fortran 77 (http://hpcf.nersc.gov/vendor_docs/ibm/xlf/html/lr02.HTM) Initiation Fortran 77 (http://www.enstimac.fr/~gaborit/lang/CoursDeFortran/Fortran.html) Le cours de Fortran d’Anne en PDF (http://www.idris.fr/data/cours/lang/fortran/fortran_base/Fortran_base.pdf) Numerical Recipes in Fortran 77 (http://www.library.cornell.edu/nr/bookfpdf.html) Autres Eléments d’HTML (http://www.imaginet.fr/ime/html32.htm) Javascripts (http://www.kazaap.com/kazaap.htm) Programmation Perl (http://www2.learningtree.com/fr/schedule.asp?c=431&o=loc) 1.0.3 Simulations: 1.0.3.1 logiciel PALM (http://www.cerfacs.fr/globc/PALM_WEB/) 1.0.3.2 logiciel OASIS (http://www.cerfacs.fr/globc/software/oasis/index.html), PRISM (http://www.cerfacs.fr/~valcke/PRISM/prism.html) 1.0.3.3 modèles ORCAVAR, Arpège,ORCA(OPA): OPA System Team - WORK PLAN (http://www.lodyc.jussieu.fr/~opatlod/WORKPLAN/) IOIPSL 1999 (http://www.ipsl.jussieu.fr/~ioipsl/) IOIPSL: documentation pdf OPA modelling system (http://www.lodyc.jussieu.fr/opa/) CVS - OPA (http://www.ipsl.jussieu.fr/cgi-bin-opalod/cvsweb.cgi/) FAQ ORCA (http://www.lodyc.jussieu.fr/opa/QUESTIONS/#2-0) 1.0.4 Manipulation de sorties de modèle (fichiers Netcdf): 1.0.4.1 logiciel OASIS (http://www.cerfacs.fr/globc/software/oasis/index.html) (interpolateur) 1.0.4.2 outils nco (/usr/local/bin) NCO Homepage (http://nco.sourceforge.net/) 1.0.4.3 utilitaires de manipulation de fichiers Netcdf Création et retouche de masques: persona (http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Persona/readme.html) Conversion de format: Vairmer2Netcdf (http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Vair2cdf/readme.html) (local:/home/evian/eric/Vair2cdf/sh_vair2cdf et imhotep:/home/globc_home/maisonna/Vair2cdf/sh_vair2cdf) -3- 1.0.4.4 outils Statpack(imhotep) ajouter set path=($path /home/globc/maisonna/statpack3/bin) a votre .cshrc 1.0.5 Visualisation: 1.0.5.1 Netcdf Netcdf pour Fortran (http://www.unidata.ucar.edu/packages/netcdf/guidef/) 1.0.5.2 Ferret Ferret IPSL (http://www.ipsl.jussieu.fr/~brocksce/ferret/docs/ferret.html) Ferret Doc 5.0 (http://ferret.wrc.noaa.gov/Ferret/Documentation/Users_Guide/v50_2000/fer_html.htm) Ferret Home Page (http://ferret.wrc.noaa.gov/Ferret/) Librairie SIBYLLE (http://www.cerfacs.fr/~maisonna/Ferret/scripts.html) (visualisation des grilles ORCA et Arpège, utilitaires développés par les utilisateurs du Cerfacs) Impression Postscript: alias metatolps source /usr/local/ferret540/paths/ferret_paths; Fprint -o \!* -p landscape metafile.plt alias metatopps source /usr/local/ferret540/paths/ferret_paths; Fprint -o \!* metafile.plt 1.0.5.3 logiciel IDL, librairies xxx, vxx, interpolations 1.0.5.4 logiciel NCL NCL (http://www.cgd.ucar.edu/csm/support/NCL/ref.shtml) The NCAR Command Language (http://ngwww.ucar.edu/ncl/) 1.0.5.5 Wavelet analysis (http://paos.colorado.edu/research/wavelets/) 1.0.5.6 outils divers: xv (/usr/local/bin/xv) acroread (/usr/local/bin/Acrobat4.05/bin/acroread et sur meta (Windows)) ghostview (/usr/local/bin/ghostview) La foire aux logiciels IPSL (http://www.ipsl.jussieu.fr/~ioipsl/foire.html) GMT (http://gmt.soest.hawaii.edu/gmt/examples/ex14/job14.csh.txt) GRIB2IEEE (ftp://wesley.wwb.noaa.gov/pub/wgrib/grib2ieee.txt) DODS (http://www.unidata.ucar.edu/packages/dods/) 1.0.6 Biblio, rapports: 1.0.6.1 connection PC Windows (meta) pour Word, Powerpoint rsh meta x11 -display $DISPLAY et ajouter, dans votre .rhosts, la ligne votre_login meta -4- 1.0.6.2 logiciel Latex (/usr/local/bin/setuplatex.csh) Conversion Latex-> RTF : /usr/local/glob/uti/latex2rtf-1.9.13/latex2rtf 1.0.6.3 outil Webify (conversion Powerpoint->html) set path = ( $path /usr/local/glob/uti/WEBIFY/bin ) et alias webify ’webify /home/maisonna/Webify/webify.template \!* ’ ou copier et modifier ce fichier Utilisation: 1: dans Powerpoint, imprimer dans un fichier (imprimante lg ou lc). 2: Renommer le .prn en .ps. 3: Lancer la commande Unix webify fichier.ps 1.0.6.4 divers agrep: grep avec fonctionnalités supplémentaires (/usr/local/glob/uti/AGREP/agrep-2.04/agrep) f2html: convertisseur Fortran -> HTML (/usr/local/glob/uti/F2HTML/fortran2html_4.4/bin/f2html) octave: matlab gratuit sur SUN (/usr/local/glob/uti/OCTAVE/bin/octave) wget: aspire des sites Web entiers (/usr/local/glob/uti/WGET/wget) gifscycle: film avec des gifs (/usr/local/glob/uti/gifsicle-1.30) html2ps: convertisseur (/usr/local/glob/uti/html2ps-globc/bin/html2ps) html2txt: convertisseur (/usr/local/glob/uti/html2txt/html2txt) xwpick: capture d’écran ameliorée (/usr/local/glob/uti/xwpick-2.20/xwpick) 1.0.7 Communications: 1.0.7.1 browser netscape opera (sur station SUN) (/usr/local/glob/uti/OPERA/bin/opera) outils: realplay, flahplayer (voir CSG) 1.0.7.2 mailer pine filtres: .procmailrc 1.0.7.3 demande de congés: gnews Ne pas oublier de remplir et faire signer la feuille de demande de conges (Voir Nathalie Brousset) Signaler votre absence avec l’utilitaire "gnews" -5- 1.0.8 Moteur de recherche Google (http://www.google.com/) 1.0.9 Liens labos 1.0.9.1 CERFACS Site externe Cerfacs (http://www.cerfacs.fr/) Intranet Cerfacs (http://shou.cerfacs.fr/) Phone Directory (http://shou.cerfacs.fr/services/Phone_Directory.htm) Plans d’accès Météopole (http://www.cnrm.meteo.fr/ama2002/acces2002.html) Enregistrement TR/WN (http://shou.cerfacs.fr/docu/Report_Number/index.html) Bibliotheque CERFACS (http://shou.cerfacs.fr/docu/index.html) 1.0.9.2 Projets européens DEMETER Home Page (http://wms.ecmwf.int/research/demeter/) Predicate Reading (http://ugamp.nerc.ac.uk/predicate/) PREDICATE Metoffice (http://www.met.reading.ac.uk/~rowan/fp5/predicate.html) PRISM Home Page (http://www.cerfacs.fr/~valcke/PRISM/prism.html) 1.0.9.3 ECMWF Nos sorties atmospheriques (http://wms.ecmwf.int/services/archive/d/catalog/class=dm/date=last/expver=crfc/) ERA-40 (http://wms.ecmwf.int/research/era/Project_status.html) ECMWF Home Page (http://www.ecmwf.int/) 1.0.9.4 IPSL-LODYC plan Jussieu (http://www.admp6.jussieu.fr/planCampus.htm) IPSL --Offres d’emploi (http://www.ipsl.jussieu.fr/actualites/Secretariat/Offres.htm) Le Modèle LMDZ (http://www.lmd.jussieu.fr/~lmdz/) IOIPSL 1999 (http://www.ipsl.jussieu.fr/~ioipsl/) OPA modelling system (http://www.lodyc.jussieu.fr/opa/) 1.0.10 Publications Coaps Journal Holdings (http://www.coaps.fsu.edu/lib/jrn/) Tellus - Series A (http://www.munksgaarddirect.dk/usr/munksgaard/tidsskrifter.nsf/newcomlink/046?OpenDocument) JGR (http://www.agu.org/pubs/inpress.html) 1.0.11 Toulouse pratique Aeroport: Aéroport de Toulouse (http://www.toulouse.aeroport.fr/) Routes:Trafic Rocade (http://www.trafic.asf.fr/trafic/cartes.asp?niveau1_6) Cinemas: ABC TOULOUSE, (http://www.abc-toulouse.net/)Toulouse cinemas (http://www.toulouseweb.com/cinemas.htm) -6- Bus:SEMVAT (http://www.semvat.com/) Librairie: Ombres Blanches (http://www.ombres-blanches.fr/) Theatres: TNT, (http://www.tnt-cite.com/)Jules Julien, (http://www.ifrance.com/julesjulien/)Théâtre du Capitole (http://www.theatre-du-capitole.org/) Musique: Orchestre du Capitole de Toulouse, (http://www.onct.mairie-toulouse.fr/)LE BIKINI (http://www.lebikini.com/) Mairie: Mairie Tlse (http://www.mairie-toulouse.fr/) -7-