La sélection génétique en aquaculture continentale
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La sélection génétique en aquaculture continentale
La sélection génétique en aquaculture continentale Pratiques et perspectives pour les professionnels JOURNEE–RENCONTRES DU MARDI 22 JANVIER 2002 Organisée par l'ADAPRA à l'Ecole Normale Supérieure de Lyon SOMMAIRE Introduction et programme de la journée -------------------------------- p.2 Communication 1 ---------------------------------------------------------------------- p.3 La sélection de la Truite – Programme PROSPER (M. Vandeputte) Communication 2 ---------------------------------------------------------------------- p.7 Organisation des professionnels dans l'amélioration génétique en France (P. Haffray) Communication 3 -------------------------------------------------------------------- p.25 Bases pour l'amélioration génétique de la carpe commune en France (D.Vallod) Communication 4 -------------------------------------------------------------------- p.39 Amélioration des méthodes d'élevage de l'omble chevalier et mise au point d'un hybride truite fario et omble chevalier (C. Gillet) Liste des sigles ----------------------------------------------------------------------- p.51 Liste des participants ------------------------------------------------------------- p.53 Journée Sélection Génétique 1 INTRODUCTION Le principe de la journée-rencontres est de permettre aux professionnels de la pisciculture et aux techniciens aquacoles de traiter avec les spécialistes de la recherche d'un thème bien précis qui est au cœur des préoccupations de la profession. Financée dans le cadre du Pôle d'Expérimentation et de Progrès Aquaculture (PEP), cette journée doit permettre la réflexion et l'émergence des besoins de la profession pouvant permettre ensuite la réalisation de programmes d'expérimentation. Cette journée abordera la question de la génétique en aquaculture continentale. La pratique de la génétique devient de plus en plus incontournable pour assurer les conditions optimales d'élevage, en terme de croissance, de reproduction, de contrôle sanitaire, de traçabilité des populations, etc. De plus en plus intégrée en salmoniculture, avec notamment l'application du programme PROSPER appliqué à la truite arc-en-ciel, les connaissances et les travaux réalisés sur la carpe, le silure sont encore très limités. C'est un véritable défi qui est aujourd'hui posé aux professionnels de l'aquaculture d'eau douce, d'autant plus que les travaux abordant la sélection génétique coûtent très cher et demandent de mutualiser les moyens. PROGRAMME DE LA JOURNEE Matinée La sélection de la truite – Programme PROSPER – M. VANDEPUTTE – INRA Organisation des professionnels dans l'amélioration génétique en France P. HAFFRAY – SYSAAF Après-midi Bases techniques et scientifiques pour l’amélioration génétique de la Carpe Commune en France D. VALLOD – ISARA, M. VANDEPUTTE – INRA Travaux sur l'omble chevalier C. GILLET – INRA Perspectives d'application en Rhône-Alpes : discussion avec les professionnels Journée Sélection Génétique 2 La sélection de la truite Programme prosper M. VANDEPUTTE – INRA Journée Sélection Génétique 3 COMMUNICATION 1 : La sélection de la Truite – Programme PROSPER RESUME La croissance est le premier critère sur lequel les pisciculteurs souhaitent une sélection génétique de leur cheptel. Après une mise au point méthodologique sur la sélection, nous examinerons les raisons de l’échec de nombreux programmes de sélection massale (choix des individus ayant les meilleures performances). Suite à cette analyse, seront introduits les principes du programme PROSPER, développé à l’INRA depuis 1986 par Bernard Chevassus sur la truite commune. Les 4 grands principes sont les suivants : 1. Disposer d’une variabilité génétique initiale suffisante 2. Maîtriser la consanguinité dans la population sélectionnée 3. Sélectionner à l’intérieur de groupes constitués de façon à maximiser la part de la variabilité génétique dans la variabilité des performances observées 4. Sélectionner par éliminations progressives en compétition avec des animaux de même poids moyen Après 5 générations de sélection, le gain de poids observé est en moyenne de 13% par génération, variant de 10 à 20 % selon les mesures. On observe peu de variations sur la qualité du produit, et la variabilité génétique est en grande partie préservée. Ce programme est donc un succès, et son application à d’autres espèces est en cours. Il faut maintenant étudier plus en détail les différentes hypothèses sous-jacentes afin de pouvoir proposer des simplifications et/ou des améliorations du processus. Journée Sélection Génétique 4 COMMUNICATION 1 : La sélection de la Truite – Programme PROSPER ► La sélection de la truite : programme prosper Journée ADAPRA « Génétique en aquaculture continentale », Lyon, 22/01/02 Marc Vandeputte, INRA Génétique des Poissons, 78352 Jouy en Josas Tél : 01.34.65.23.64. Fax : 01.34.65.23.90. - E-mail: [email protected] La croissance est le premier critère sur lequel les pisciculteurs souhaitent une sélection génétique de leur cheptel. La méthode la plus simple et la moins coûteuse en théorie pour permettre cette amélioration par voie génétique est la sélection massale (sélection des animaux présentant les meilleures performances de croissance). Cependant, de nombreuses expériences réalisées chez diverses espèces de poissons (salmonidés, tilapia, carpe) montrent une efficacité faible à nulle de cette méthode. A contrario, la sélection familiale ou combinée (qui réclame des quantités de bassins très importantes) a montré son efficacité chez les salmonidés. La méthode PROSPER (PROcédure de Sélection individuelle optimisée par Epreuves Répétées) a été développée pour tenter de proposer une alternative moins coûteuse à la sélection familiale, en prenant en considération les facteurs qui pouvaient limiter l’efficacité de la sélection massale. Ces facteurs possibles sont a priori de quatre types : ● Une variabilité génétique insuffisante de la population de base, ne permettant pas d’avoir accès dans cette population à des poissons de bonne valeur génétique 1. Population de base synthétique pour plus de variabilité génétique ● Un risque d’augmentation de la consanguinité avec une forte pression de sélection dans une population de structure mal contrôlée ● Une modification de la performance par la présence d’effets maternels initiaux susceptibles de masquer la valeur génétique des individus ● La présence d’interactions sociales (agressivité) pouvant là aussi masquer ou augmenter artificiellement le potentiel de croissance de certains individus. La méthode PROSPER répond point par point à ces problèmes potentiels, en s’assurant : 1. De disposer d’une variabilité génétique initiale suffisante (fig. 1) 2. Contrôle de la consanguinité : le produit commercial est un croisement entre deux lignées ayant de forts effectifs génétiques efficaces 2. De maîtriser la consanguinité dans la population sélectionnée (fig. 2) 3. De sélectionner à l’intérieur de groupes constitués de façon à maximiser la part de la variabilité génétique dans la variabilité des performances observées (fig. 3) Journée Sélection Génétique 5 COMMUNICATION 1 : La sélection de la Truite – Programme PROSPER 4. De sélectionner par éliminations progressives en compétition avec des animaux de même poids moyen (fig. 4) Ce programme a été mis en œuvre à partir de 1986 dans les structures de l’INRA et à la SEMII (Inra-Ifremer) sur deux lignées de truite commune (Salmo trutta) par B. Chevassus et des collaborateurs. La sélection est effectuée sur la longueur totale du poisson, qui est très corrélée au poids et plus facile à mesurer précisément sur un grand nombre d’individus en conditions de terrain. Après 5 générations de sélection, le gain de poids observé est en moyenne de 13% par génération, variant de 10 à 25 % selon les mesures. On observe peu de variations sur la qualité du produit, si ce n’est une légère modification du format (augmentation de la taille de la tête et de l’axe vertébral). Il est remarquable de constater qu’il n’y a aucune augmentation de la composition corporelle (pas d’augmentation des lipides) 3. Groupes optimaux : nombreux mâles (variance génétique maximum, femelles triées par taille d’œufs (effets maternels minimaux) Par ailleurs, un test en compétition sur l’une des lignées semble montrer que les poissons sélectionnés ne montrent pas de surcroît d’agressivité par rapport aux témoins. La variabilité génétique est en grande partie préservée (à plus de 95% en mesurant avec des marqueurs génomiques), ce qui montre que les mesures prises pour éviter la consanguinité ont été efficaces. Pour ce qui est de l’efficacité alimentaire, aucune modification n’est détectable entre témoins et sélectionnés, ce qui signifie que l’indice de consommation est le même entre les deux lignées, et sous un autre angle que le surcroît de croissance observé chez les sélectionnés est dû uniquement à une capacité d’ingestion supérieure. PETITS éliminés GROS MOYENS période de croissance GROS 4 cycles MOYENS PETITS (éliminés) 4. Contrôle des interactions sociales : épreuves répétées sur groupes triés Ce programme est donc un succès, et son application à d’autres espèces (truite arcen-ciel, bar, daurade, turbot, carpe) est en cours. Par ailleurs, il faut maintenant étudier plus en détail les différentes hypothèses sous-jacentes et l’effet de chacune des mesures prises afin de pouvoir proposer des simplifications et/ou des améliorations du processus, car si l’ensemble est efficace, il est possible que certaines parties du protocole soient inutiles, et au contraire que d’autres soient insuffisamment contraignantes. Journée Sélection Génétique 6 Organisation des professionnels dans l'amélioration génétique en France P. HAFFRAY – SYSAAF Journée Sélection Génétique 7 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France RESUME Depuis 1991, 16 entreprises piscicoles et conchylicoles françaises innovantes se sont organisées dans le cadre du SYSAAF pour disposer d’un appui technique spécialisé en matière d’amélioration génétique et sanitaire des cheptels de truite arc-en-ciel, de truite fario, d’omble de fontaine, de bar, de turbot, de daurade et d’huître creuse. Ce travail de transfert est réalisé en étroite concertation avec le Ministère de l’Agriculture, l’INRA et l’IFREMER. Après la présentation du contexte international et national, la présentation se focalisera sur les modalités techniques et financières de la mise en œuvre des schémas de sélection, sur le fonctionnement du syndicat ainsi que sur les autres services développés par le SYSAAF pour répondre aux attentes des sélectionneurs d’espèces aquacoles : ● Amélioration de la reproduction (induction de la ponte, conservation et congélation de sperme), ● Optimisation de la triploïdisation et contrôle de ploïdie, ● Développement de méthodes de mesures sur la qualité, ● Introduction d’une gestion généalogique en sélection assistée par empreintes génétiques. Journée Sélection Génétique 8 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Organisation Organisation des des professionnels professionnels français français pour pour l’amélioration l’amélioration génétique génétique des des espèces espèces aquacoles aquacoles Pierrick Pierrick HAFFRAY HAFFRAY SYSAAF, SYSAAF,Section SectionAquacole, Aquacole,Station StationSCRIBE, SCRIBE,Campus Campusde deBeaulieu, Beaulieu,35 35042 042RENNES RENNES Tel Tel::02 0223 2348 4853 5378 78;;Fax Fax::02 0223 2348 4856 5660 60;; Mel Mel::[email protected] [email protected] Syndicat Syndicat des des Sélectionneurs Sélectionneurs Avicoles Avicoles et et Aquacoles Aquacoles Français Français Journée Sélection Génétique 9 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Pourquoi le SYSAAF ? • Gros animaux • Bovins, ovins, équins, porcins (3,5 Mt viande + 34 Mt lait) • Fécondité femelle faible • Evaluation du progrès et transfert par la voie mâle • Programmes de sélection lourds ⇒ Programmes publics • Loi sur les animaux d’élevage (1966), soutien annuel (100 MF) • Petits animaux • Volailles, poissons de chair (2,3 Mt viande + 1 Mt oeufs) • Fécondité femelle importante • Programmes de sélection légers ⇒ Programmes privés • Soutien du Ministère de l’Agriculture au SYSAAF (2,3 MF) Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Un syndicat professionnel depuis 1952 • 1952 : SNAA - Syndicat National des Aviculteurs Agréés • 50-60 entreprises • 1955 : Collaboration INRA • Sélection généalogique au Magneraud (M. Cochez) • Spécialisation (croissance rapide ou lente, coquille colorée) • Atelier mécanographique de calcul informatique • 1968 : Implantation à Nouzilly • 1976 : SYSAF - Syndicat des Sélectionneurs Avicoles Français • 6 entreprises • Cession des lignées INRA chair à l’ISA et femelle Label à la SASSO Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 10 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Section aquacole, quelques dates … • 1990-1991 : Audit SYSAAF (ministère de l’agriculture) • 21 juin 1991 : Création de la section aquacole Mollusques Poissons marins Nombre d'entrepr ises 16 Salmonidés 14 12 10 M ollusques 8 Poissons marins 6 Etangs 4 Salmonidés 2 2 00 1 2000 19 9 9 1 9 98 1997 1 99 6 1995 19 9 4 1 9 93 1992 1 99 1 1 9 90 0 • 5 mai 1993 : Extension aux poissons marins • 5 juin 2001 : Extension aux mollusques Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français 16 PME innovantes…. • Ecloseurs : Poissons du Soleil (34), Elsamer (29), Grainocéan (17), Satmar (50), SODABO (44), Vendée naissain (44) • Sélectionneurs : Ecloserie Marine de Gravelines (59), Ferme Marine du Douhet (17), France Turbot (85), Furic Piscicultures (29), Font Rome Pisciculture (07), Les Aquaculteurs Bretons (29), Les Aquaculteurs Landais (40), Pisciculture de Ménaouen (29), Pisciculture des Fontaines (38), Viviers de France (40) % juvé nile s franç ais 100 70 à 100 % des juvéniles français d’écloserie 80 60 40 20 0 Truite aec Bar Daurade Turbot Fario de mer O. de fontaine Huître creuse ⇔ 600 MF de C.A. dont 80 à l’export Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 11 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Le SYSAAF en 2002 • Syndicat professionnel ; 30 PME • Sélection de 135 lignées avicoles et de 18 lignées piscicoles • Poule, dinde, pintade, canard de barbarie, oie, canard commun, faisan, pigeon, caille, perdrix rouge, perdrix grise. • Truites arc-en-ciel et fario, turbot, bar, daurade, omble de fontaine, huître creuse. • Traitement statistique des données sous BLUP modèle animal avec 3 stations de travail sous UNIX (VCE, PEST, SAS), caractères continus et discrets • 9 salariés : 7 ingénieurs, 1 vétérinaire, 1 attachée de direction • Budget section aquacole: 1,5 millions de Francs Expérimentations Ministère Agriculture Contrats R&D 35% 39% 7% 8% Fonctionnement 85% 26% Ressources Cotisations Dépenses Salaires Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Le SYSAAF, un Centre Technique • Accord cadre INRA-SYSAAF • 2 implantations administratives et techniques • INRA Nouzilly (SRA) • INRA Rennes (SCRIBE) • Directeur INRA • Appui technique spécialisé : • Reproduction et congélation de laitance • Monosexage et polyploïdisation • Gestion de la variabilité génétique et sélection • Sanitaire • Innovation • Organisme de formation professionnelle (n°24 75 01150 37) • Certification des lignées reconnue par la CNLC Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 12 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Amélioration de la reproduction Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 13 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Service « Reproduction» • Développement de dilueurs Maturfish®, Storfish®, Ovafish®, Actifish® et Cryofish® (Licence INRA-IMV-SYSAAF) 100 % motilité 80 Effet du Storfish® sur la motilité de la laitance de néomâles (n = 44) 60 40 20 0 Avant incubation Après incubation • Induction de la ponte par GnRH (Coll. Breton) • Injection, implants ou microbilles (Ovaprim®, Reproboost®, Décapeptyl®) • Etude clinique / Dossier d’AMM Reprozan® pour Intervet 100 % ovulation 80 Essai 1 (n = 45) 60 Essai 2 (n = 10) 40 Ovulation de 3 lots de truites fario traités par Reproboost® (Coll. SEMII) Essai 3 (n = 39) 20 0 0 5 6 7 9 10 11 18 19 Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Congélation de laitances • SYSAAF membre fondateur de la Cryobanque Nationale • Développement du dilueur de congélation Cryofish® (licence INRAIMV-SYSAAF ; www.imv-technologies.com ) fécondance (%) 100 Mounib (1978) Dilueurs Cryofish IMV 80 60 40 * * * 20 0 essai 1 essai 2 essai 3 essai 4 Fécondance de spermes congelés de truite (n = 7 à 30) (Maisse et al, 1998) • Formation du personnel et congélation sur site • Impression de paillettes (Domino, 3600 paillettes / h) • Remplissage et soudure automatisés (MRS1, 4000 paillettes / j) Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 14 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Transfert de la triploïdisation et du monosexage Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 15 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Triploïdiser = Féconder en conservant 100 % du matériel génétique de la mère Triploïdisation… ⇒ n + n + n = 3 n Fécondation classique…. ⇒ n + n = 2 n n n n Expulsion normale du 2ème globule polaire (50 % des chromosomes maternels) Spermatozoïde (50 % des chromosomes paternels) Inhibition de l’expulsion du 2ème globule polaire (température, pression) Ovocyte II (50 % des chromosomes maternels) X n nn Expulsion du 2ème globule polaire Expulsion du 2ème globule polaire chez la carpe (Hollebecq et Haffray, 1994) Expulsion du 2ème globule polaire chez la carpe (Hollebecq et Haffray, 1994) Huître (2n = 20) ; turbot (2n = 44) ; Bar (2n = 48) ; Daurade (2n = 48) ; Truite arc-en-ciel (2n = 60) ; Omble de fontaine (2n = 84) ; Carpe (2n = 100) Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français 90 % des végétaux cultivés sont issus de polyploïdisation ! 2n gyno ou androgenètique maïs, chou fleur, colza riz, asperge, piment, melon, courgette 4n : blé dur (semoules et pâtes), pomme des terre, orge, poireaux, griottes, arachides, café arabica, tabac, coton, ray-grass, dactyles, fétuques, luzerne, trèfle violet 6n : blé tendre (panification, aliment du bétail), ail à grosse tête, kiwi, prune 3n : betterave à sucre, pomme, banane, pamplemousse, orange, clémentine, citron vert 8n : fraise (Bel Rubby, Gariguette, Favette, Elsanta, Pajaro) Aneuploïdes canne à sucre Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 16 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Triploïdiser pour une aquaculture durable FAO Guide Technique pour une Aquaculture Responsable NASCO ICES ftp://ftp.fao.org/fi/document/tech Organisation pour la (Conseil International pour guid/fishaqu5.pdf Conservation du Saumon de l’Exploitation de la Mer) Article 9.3. : p 21 et 22 l’Atlantique Nord, Résolution Code de Bonne Pratique de d’Oslo de Juin 1994 l’Introduction et du Transfert www.nasco.uk, § 16 des Organismes Marins 1994 ( UE, USA, Canada, Norvège, www.ices.dk/pubs/itmo.pdf Islande, Russie) Conseil Supérieur de la Pêche www.peche.org/csp/csp.htm Journées d’Information Scientifiques et Techniques des 23 et 24 novembre 1994 Greenpeace Stérilisation des OGM en association avec des mesures de confinement stricts www.greenpeace.org/geneng/re ports/bio/bioO16.htm Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Contrôle de ploïdie par cytofluorimétrie (Lecommandeur et al., 1995) • Cytomètres Partec CA II et PA II N b de poissons a nalysé s • 40 000 poissons contrôlés depuis 1993 (embryon ou nageoire) 14000 12000 10000 S e rvi ce E a u Dou c e 8000 S e rvi ce E a u de M er 6000 R& D E a u Douc e R& D E a u de M er 4000 2000 0 1992 19 93 199 4 1995 1 996 199 7 1998 1 999 Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 17 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Développement de la stérilisation • Développement de prototypes de traitement hyperbare (5 l ; www.quiri.com ) et validation sur 7 sites trutticoles 100 100 80 Tr aitem e nt th erm iqu e 60 Tr aitem e nt hy p erb a re 40 % triploïdie 120 75 50 25 20 0 0 % s urvie 1 % 3n 14 27 40 53 66 79 92 Efficacité relative des traitements hyperbares (96 lots) sur les traitements thermiques (20 lots) en 1999 (n = 50 à 100 alevins / lots) • Segmentation du marché de la truite (SCEES, 1998) ⇔ 12 000 T de 3n en 2001 1991 17 % Por tion ( 17 0-3 00 g) 3% 1997 12% 50% File t ( 30 0 - 25 00 g) 38% 8 0% Fuma ge ( > 25 00 g) Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 18 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Transfert de la méthodologie de sélection Prosper pour améliorer la croissance Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 19 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Transfert de Prosper • 18 lignées sélectionnées en 2000 dont 13 selon « Prosper » truite 20 18 16 14 12 10 8 6 4 2 0 Lignées « Prosper » 2000 1999 1998 1997 1996 1995 1994 1 9 93 1 9 92 Autres lignées 1 9 91 Nom b re de ligné e s arc-en-ciel et fario, bar, turbot et daurade • Adaptation de « Prosper » à la biologie de la reproduction et à la zootechnie du turbot, du bar et daurade Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Développement de méthodes de mesure de la qualité indirectes • Prédiction du rendement à l’éviscération (Haffray et al., 1999) peau Estimation indirecte par ultrasons 7, 5 MHz e8 muscle paroi abdominale cavité abdominale r2 multiple = 0,5 • Prédiction % lipides musculaires (Collewet et al., 2001) Estimation indirecte par micro-ondes avec le Torry Fish Fat Meter r2 = 0,71 Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 20 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Quelques chiffres sur le travail du sélectionneur… • Nombre moyen de parents / lignée (truite) : 85 pères et 75 mères • Nombre de candidats / lignée (truite) : 54 000 filles et 17 000 fils • Effectifs retenu en fin de sélection : 600 filles et 350 fils • Nombre de troncatures pilotée / an / SYSAAF : 60 • Nombre de mesures / génération / lignée : 150 000 à 200 000 • Création d’une nouvelle génération : 10 équivalents hommes jours • Tri qualité : 18 hommes jours Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Coût de le sélection • Coût à l’échelle de l’entreprise • Investissement : 1 à 2 MF (40-50 bassins pour 2 souches) • Fonctionnement : 200 kF à 1 MF • Coût à l’échelle de la filière française 0,37 0,40 0,35 F / kg 0,30 0,25 0,20 0,15 0,10 0,05 Coût F / kg 0,08 0,05 0,00 Salm onidés Poissons m arins Total Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 21 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Introduction d’une gestion généalogique de la ressource génétique Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 22 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Transfert du génotypage aux sélectionneurs Tu1-125 Tu1-174 • Identification des échantillons • Extraction et conservation de l’ADN • PCR et séquençage en multiplex • Caractérisation allélique • Reconstitution informatisée des généalogies Tu3-8 Tu4-14 Tu - 152 standard de taille GIE Labogéna Tu5-111 2 1 Sélectionneur SYSAAF 3 • Application d’un schéma de sélection • Identification par transpondeur • Prélèvement d’ADN • Constitution du fichier de généalogies • Choix informatisé des reproducteurs • Proposition de plans d’accouplements • Plans d’accouplements optimisés / apparentement et EF • 5400 poissons génotypés depuis 1999 Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Génotypage d’un noyau sélectionné de truite arc-en-ciel (SYSAAF, Labogéna, INRA, CIPA, OFIMER) Novembre 1999 : Reproduction 200 parents + prélèvement ADN Avril 2001 : Prélèvement d’ADN de 400 filles (+ 100) et 300 fils sélectionnés Sélection Prosper ; p = 3% / longueur Génotypage (été 2001) 200 parents 400 filles et 300 fils • Mesures de qualité : P, L, k, gras musculaire, épaisseur musculaire Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 23 COMMUNICATION 2 : Organisation des professionnels dans l’amélioration génétique en France Composition du noyau sélectionné • Représentation des parents dans la descendance : • 89 pères sur 100 et 76 mères sur 82 • Perte de variabilité génétique • Effectif efficace Ne = (4 * Nm * Nf) / (Nm + Nf) • Ne initial = 181,8 • Ne sélectionné = 122,9 • Coefficient de consanguinité F = - 1 / 2Ne = - 0,04 % • Conservation de 99,6 % de la variabilité génétique à la génération suivante Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français 10 ans de transfert • Transfert de Prosper et sélection sur la qualité (5 espèces, 12 souches) à 70% à 100% de la production française • + 10 % de poids attendu / génération • Gestion de la ressource génétique nationale • Réseau de 16 PME et 20 techniciens et ingénieurs • Interface « recherche-professionnels » active et démultiplication d’un soutien public Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 24 Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France D. VALLOD – ISARA Journée Sélection Génétique 25 COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France RESUME Dans l’optique d’une sélection des carpes sur leur aptitude à la transformation nous avons envisagé le développement de critères indirects de rendements en filetage liés à la conformation des poissons et mis en place un protocole de testage de souche dans le cadre d’un programme «Agriculture Demain» (1996-2000). En première approche, nous avons réalisé une caractérisation préalable de la diversité génétique et de la variabilité des rendements des carpes élevées en France et d’autre part des comparaisons avec des carpes issues de quelques pays producteurs des pays de l’Est. Les premiers résultats obtenus ont montré que : ● Les ressources génétiques des carpes françaises sont peu différenciées entre les populations observées mais les populations françaises sont différentes des populations tchèques, et aussi variables à l’intérieur de chaque population que ces dernières. ● Il est très difficile d’identifier des morphotypes (souche) plus ou moins performants. En 1998, un protocole de testage de performances de 3 souches (Dombes, Forez, Brenne) a été mis en place sur des structures situées en Dombes et en Région Centre (SEPIB). Ce testage a été réalisé à partir de carpes de même âge, produites dans un environnement contrôlé par témoin interne (carpe recouverte d’écailles) De nombreuses mesures ont été réalisées sur les carpes de 2 étés issues de ce testage : pesées, taux de survie, longueur du corps et de la tête, hauteur du corps, rendement de filetage, poids des viscères et des gonades, prélèvement d’écailles pour des analyses d’ADN, prise de vues pour des analyses morphologiques, …et nous pouvons présenter les principaux résultats. Les perspectives envisagées pour les prochaines années, après concertation entre chercheurs et producteurs pourraient engager un travail de sélection au travers de : ● La mise en place d'une gestion rationnelle de la ressource génétique carpe ● La reprise éventuelle d'une comparaison de souches avec des poissons plus différenciés ● L’estimation des paramètres génétiques : peut-on améliorer un caractère (croissance, rendement, morphologie) par sélection ?. ● La mise en place d'une sélection sur le rapport H/L pour améliorer le rendement en filet. Journée Sélection Génétique 26 COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France BASES TECHNIQUES et SCIENTIFIQUES pour l’AMELIORATION GENETIQUE de la CARPE COMMUNE en FRANCE Programme Agriculture Demain 1996-2000 Dominique VALLOD ISARA – 31, place Bellecour 69288 LYON cedex 02 Tel : 04.78.92.69.83. – Fax : 04.78.92.69.75. – e-mail : [email protected] Journée Sélection Génétique 27 COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France Objectif ¬la recherche des meilleures souches de carpe par rapport à leur aptitude au filetage... pour proposer aux éleveurs : • une ou deux populations adaptées aux attentes du marché, • des méthodologies de gestion et d’amélioration des ressources génétiques Programme Agriculture Demain Partenaires • ADAPRA (Association pour le Développement de l’Aquaculture et de la Pêche en RhôneRhône-Alpes) • INRA (Laboratoire de Physiologie des Poissons de Rennes, Laboratoire de Génétique des Poissons de Jouy) • SYSAAF (Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français) • ITAVI (Cellule Technique Aquacole Nationale) • UNIVERSITE LYON I (Ecologie des Eaux Douces et des Grands Fleuves) Programme Agriculture Demain Coût: 1 300 KF HT • Ministère Recherche : 650 KF • Ministère Agriculture : 120 KF • Région Rhône-Alpes : 240 KF • Autofinancement : 560 KF Journée Sélection Génétique 28 COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France Étapes réalisées • Inventaire des populations de carpe en France et à l'étranger, • Caractérisation génétique, • Analyse de leur morphométrie, morphométrie, • Étude des rendements (éviscération et filetage), de transformation • Testage de performances de 3 souches à 2 étés. Protocole du testage ¾ Trois souches de carpe commune élevées dans des conditions contrôlées : réplicat bassin, réplicat site d’élevage, témoin interne intrabassin demi-frère à écaille, alimentation, ... ¾Testage des performances de croissance après 1 an et 2 ans d’élevage sur l’ensemble des poissons ¾Étude des rendements de transformation sur un échantillon ¾Étude des morphologies sur un échantillon par mesures de longueur, poids, … et calcul de données à partir d’images numériques des carpes à l’abattage Les souches testées Γ Brenne Γ Forez 24 Γ /souche Γ Dombes Ε Dombes Journée Sélection Génétique 29 COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France ► Présentation des étapes des travaux réalisés Pêche des géniteurs Mai 1998 Reproduction artificielle Fécondation Écloserie P. DANNANCIER Mise en bouteilles de Zoug Vésicules Résorbées Écloserie P. DANNANCIER Journée Sélection Génétique 30 COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France Carpes de 1 été Pêche des carpes de 1été •Brenne •Forez •Dombes Octobre 1998 Témoin interne Station IRRA 3 cm Pêche à 2 étés Octobre 1999 COOPEPOISSON Stockage avant transformation des carpes COOPEPOISSON Journée Sélection Génétique 31 COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France ► Mesures des poissons Longueur / Hauteur / Pesée/ ADN Analyse morphologique Échographie et prédiction du rendement Journée Sélection Génétique 32 COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France ► Présentation des résultats Résultats • validation de l’intérêt du témoin interne pour améliorer l’interprétation de la procédure de testage par standardisation des effets environnementaux •pas de différences de croissance à 5 semaines, 1 été et 2 étés entre les trois souches françaises testées. Croissance à 2 étés Po id s so u ch e te stée (g ) 2 500 2 000 Bre n n e 1 500 Dombes F o re z 1 000 y=x 500 - 500 1 000 1 500 2 000 2 500 P o id s t é m o in ( g ) Exemple de comparaison sur le facteur croissance Journée Sélection Génétique 33 COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France Résultats • survie entre souches globalement identique • peu de différence entre les trois souches françaises testées pour la plupart des caractéristiques morphologiques : longueur, coefficient de condition, épaisseur moyenne du filet, ... • pas de différence entre les trois souches françaises testées pour les caractéristiques de transformation : rendement carcasse, rendement filet, rapport gonadosomatique, poids de la tête, …) • caractères montrant une différence : • hauteurs : Forez>Dombes>Brenne • angles caractérisant la « bosse » du poisson : Forez >Dombes> Brenne • pas de relation nette entre morphologie de la souche et rendements Journée Sélection Génétique 34 COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France Différences morphologiques • différences observées pour les hauteurs maximales correspondant à un développement des viscères et/ou à un développement de la partie dorsale Ddéveloppement dorsal du à un accroissement de tissu musculaire ou de tissu adipeux (cas des carpes tchèques) Dsouche la plus haute : Forez (Dombes intermédiaire) Dpas de corrélation avec le rendement de filetage Deffet environnemental dominant • différences observées pour certaines longueurs du corps : Ddéveloppement du tronc, allongement du pédoncule caudal Dsouche à longueur de tronc la plus faible : Forez Dsouche à pédoncule caudal le plus long :Dombes Dcorrélation positive avec le rendement de filetage Deffet d’origine génétique, en faveur de l’origine Dombes • différences observées pour l’angle du profil dorsal entre la tête et la nageoire dorsale Dtraduisent des différences de hauteur Dsouche à angle le plus fort : Forez (Dombes intermédiaire) Dcorrélation positive avec le rendement de filetage Dpas d’effet d’origine génétique Journée Sélection Génétique 35 COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France La souche «idéale» hcarpe miroir hallongée hà petite tête •la rechercher parmi les souches européennes voire asiatiques •la «créer» par sélection puisque le rapport L/H est héritable chez la carpe Mais effet sur le rendement filetage hypothétique : - il y a bien un effet souche - mais pas de relation avec des caractères mesurables sur le poisson vivant Perspectives • Mettre en place une gestion rationnelle de la ressource génétique •Reprendre une comparaison de souches avec des poissons plus différenciés •Engager une sélection sur le rapport H/L pour améliorer le rendement en filet. Journée Sélection Génétique 36 COMMUNICATION 3 : Bases pour l'amélioration génétique de la CARPE COMMUNE en France Quelques compléments… • Génétique des populations de carpe – Populations françaises très peu différenciées – Populations françaises différentes des Tchèques – Ensemble européen assez homogène (certaines souches de pisciculture très consanguines) – Europe ≠ extrême Orient (Koï, Chine, fleuve Amour) • Sélection pour rapport H/L (Ankorion et al., 1992) – Bonne héritabilité (0.47 vers haut, 0.33 vers bas) – Association positive possible entre poisson allongé et bonne croissance pondérale • « PROSPER Carpe » en Rép. Tchèque – Débuté en 2001 – Objectif : sélection divergente L et H/L + lignée témoin non sélectionnée – Estimation d’héritabilité à 8 semaines – G1 disponible en 2003 ou 2004 – à tester Journée Sélection Génétique 37 Journée Sélection Génétique 38 Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier C. GILLET – INRA Journée Sélection Génétique 39 COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier RESUME L’omble chevalier (Salvelinus alpinus) est une espèce adaptée aux eaux très froides qui vit actuellement dans la plupart des cours d’eau et des lacs dans les pays qui bordent l’océan arctique. En France, cette espèce relique de l’aire glacière n’existait à l’origine que dans quelques lacs subalpins de la région Rhône Alpes. Ce poisson peut s’élever en salmoniculture à condition de disposer d’eau très froide. En région de montagne, l’élevage de l’omble chevalier présente un intérêt certain pour les salmoniculteurs désirant diversifier leur production. Depuis plusieurs années, la station d’hydrobiologie lacustre de l’INRA à Thonon entreprend des recherches sur cette espèce, initialement dans le but de développer le pacage lacustre puis pour évaluer l’aptitude de l’omble à l’élevage en salmoniculture. Le bilan des travaux réalisés dans ce domaine fait apparaître que l’omble chevalier présente une bonne aptitude à l’élevage en eau froide (température inférieure à 10 °C) au cours de la première année de grossissement. Par la suite, il se produit fréquemment une baisse sensible des performances zootechniques des poissons (en terme de taux de croissance, d’indice de transformation de l’aliment et de survie) survenant généralement au début du deuxième été lorsque les poissons les plus précoces commencent à développer leurs gonades. Ce phénomène est lié, au moins partiellement, à l’établissement d’une hiérarchie dans les bassins, entraînant une baisse des performances chez les individus dominés. Au-delà du stade poisson portion, l’omble chevalier s’élève difficilement en pisciculture car la mortalité pendant et après la reproduction est très élevée. Nous avons réussi à produire des individus stériles en soumettant l’œuf à un choc hyperbare à 650 atmosphères, 40 minutes après la fécondation ce qui induit la triploïdie par rétention du second globule polaire. Cependant, cette pratique n’améliore pas les performances zootechniques (croissance et survie) des ombles chevaliers triploïdes au cours de la troisième année d’élevage par rapport à celles des témoins diploïdes. Nous avons réalisé avec succès l’hybridation entre la truite fario femelle (Salmo trutta) et l’omble chevalier mâle (Salvelinus alpinus). L’hybride est viable à l’état diploïde aussi bien qu’à l’état triploïde. La survie au stade oeillé est de 88% chez la fario, 77% chez l’hybride diploïde et 58% chez l’hybride triploïde. Entre le stade alevin et le stade poisson portion, l’hybride grossit plus vite que les deux espèces parentales dans les piscicultures où la température de l’eau dépasse 8°C, tandis qu’il grossit moins vite que l’omble chevalier dans un élevage où la température de l’eau reste inférieure à 7°C toute l’année. L’hybride est stérile, ce qui lui permet d’atteindre une taille important sans subir les mortalités qui affectent les espèces parentales pendant la période de reproduction. Dans l’avenir, des recherches devront être entreprises pour identifier parmi les nombreuses populations naturelles d’omble chevalier, les souches les plus aptes à l’élevage. Journée Sélection Génétique 40 COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier ► Amélioration des méthodes d’élevage de l’omble chevalier ► Etude de l’intérêt aquacole de l’hybride entre la truite fario femelle et l’omble chevalier mâle Christian Gillet, INRA Station de Thonon, Avenue de Corzent 74200 Thonon-les-Bains Tél : 04.50.26.78.28. – Fax : 04.50.26.07.60. - E-mail : [email protected] Contexte et historique des travaux de recherche sur l’omble chevalier L’omble chevalier (Salvelinus alpinus) est une espèce adaptée aux eaux très froides qui vit actuellement dans la plupart des cours d’eau et des lacs dans les pays qui bordent l’océan arctique. En France, cette espèce relique de l’aire glacière n’existait à l’origine que dans quelques lacs subalpins de la région Rhône Alpes. Ce poisson peut s’élever en salmoniculture à condition de disposer d’eau très froide. En région de montagne, l’élevage de l’omble chevalier présente un intérêt certain pour les salmoniculteurs désirant diversifier leur production. Photo d’un mâle de quatre ans en période de reproduction à la pisciculture de l’INRA Depuis plusieurs années, la station d’hydrobiologie lacustre de l’INRA à Thonon entreprend des recherches sur cette espèce, initialement dans le but de développer le pacage lacustre puis pour évaluer l’aptitude de l’omble à l’élevage en salmoniculture. Dans tous les lacs subalpins affectés par l’eutrophisation, les captures d’ombles chevaliers ont fortement décliné au cours du vingtième siècle. C’est le cas en particulier pour le Léman et le Bourget. La dégradation du sédiment des zones profondes ne permet plus à l’omble de se reproduire d’une manière satisfaisante car la plupart des œufs avortent avant l’éclosion. Dans ce contexte, le repeuplement réalisé avec des estivaux d’omble chevalier s’est traduit par une nette amélioration des captures. C’est le cas dans le Léman où un programme de pacage lacustre à été initié au cours des années 80. Les recherches ont d’abord porté sur l’amélioration des méthodes de production d’estivaux en condition d’élevage intensif. Puis la capacité de production de la pisciculture de la DDAF à Rives a été améliorée pour permettre d’y produire plus de 1.000.000 d’estivaux. Journée Sélection Génétique 41 COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier En conséquence, les captures d’omble chevalier dans le Léman ont été multipliées par 10 entre 1980 et 1995. Il existe une corrélation très forte (r>0.9) entre la quantité d’estivaux déversés dans le Léman et les captures réalisées 3 ans plus tard par l’ensemble des pêcheurs (professionnels + amateurs). Pour développer l’élevage de l’omble en pisciculture de grossissement jusqu’à des stades destinés directement à la consommation, il s’est avéré nécessaire, dans un premier temps de maîtriser toutes les étapes du cycle reproducteur en condition d’élevage. L’ovulation spontanée des femelles ne peut se produire que lorsque l’eau des bassins est à une température inférieure à 10°C. Les ovulations sont bien groupées lorsque la température de l’eau est inférieure à 6°C. Au-dessus de cette température, les processus de surmaturation des ovules s’accélèrent et le rythme des ovulations ralentit fortement. Journée Sélection Génétique 42 COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier Le bilan des travaux sur le grossissement des ombles chevaliers fait apparaître que ce poisson présente une bonne aptitude à l’élevage en eau froide (température inférieure à 10 °C) au cours de la première année de grossissement. Par la suite, il se produit fréquemment une baisse sensible des performances zootechniques des poissons (en terme de taux de croissance, d’indice de transformation de l’aliment et de survie) survenant généralement pour un poids voisin de 100 g., lorsque les poissons les plus précoces commencent à développer leurs gonades. Ce phénomène est lié, au moins partiellement, à l’établissement d’une hiérarchie dans les bassins, entraînant une baisse des performances chez les individus dominés. Le calibrage qui permet d’augmenter l’homogénéité des lots améliore les performances zootechniques en diminuant les phénomènes de dominance dans les bassins d’élevage. Au-delà du stade poisson portion, l’omble chevalier s’élève difficilement en pisciculture car la mortalité pendant et après la reproduction est très élevée. Nous avons donc cherché à produire des ombles chevaliers stériles. Journée Sélection Génétique 43 COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier Journée Sélection Génétique 44 COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier Recherches sur l’induction de la triploïdie chez l’omble chevalier. L’œuf de l’omble chevalier ne supportant pas les températures élevées, même brièvement, il n’a pas été possible de produire des individus triploïdes par la méthode des chocs thermiques. Nous avons réussi à produire des individus stériles en soumettant l’œuf à un choc hyperbare à 650 atmosphères, 40 minutes après la fécondation ce qui induit la triploïdie par rétention du second globule polaire. Au cours des 600 premiers jours d’élevage, la croissance des ombles triploïdes ne diffère pas de celle des témoins diploïdes. Journée Sélection Génétique 45 COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier Cependant au cours de la troisième année d’élevage, la triploïdie n’améliore pas les performances zootechniques (croissance et survie) des ombles chevaliers par rapport à celles des témoins diploïdes. Journée Sélection Génétique 46 COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier La triploïdie améliore l’indice de carcasse des femelles car la plupart d’entre elles ne développent pas de grappe ovarienne contrairement aux mâles qui développent des testicules bien qu’ils ne produisent pas de laitance. Journée Sélection Génétique 47 COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier Recherches sur l’hybridation entre la truite fario et l’omble chevalier. D’après les données disponibles dans la littérature scientifique, les poissons du genre salvelinus peuvent s’hybrider avec ceux du genre salmo et produire ainsi des individus stériles. Nous avons réalisé avec succès l’hybridation entre la truite fario femelle (Salmo trutta) et l’omble chevalier mâle (Salvelinus alpinus). L’hybride est viable à l’état diploïde aussi bien qu’à l’état triploïde, la triploïdie étant induite par un choc thermique selon la méthode définie pour la truite fario. La survie au stade oeillé est de 88% chez la fario, 77% chez l’hybride diploïde et 58% chez l’hybride triploïde. Hybride entre la truite fario femelle et l’omble chevalier mâle Entre le stade alevin et le stade poisson portion, l’hybride grossit plus vite que les deux espèces parentales dans les piscicultures où la température de l’eau dépasse 8°C, tandis qu’il grossit moins vite que l’omble chevalier dans un élevage où la température de l’eau reste inférieure à 7°C toute l’année. Journée Sélection Génétique 48 COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier L’hybride est stérile, ce qui lui permet d’atteindre une taille importante sans subir les mortalités qui affectent les espèces parentales pendant la période de reproduction. Son indice de carcasse est toujours supérieur à 90%. Comme chez les ombles triploïdes, la quasi-totalité des femelles ne développe pas de grappe ovarienne, les rares individus qui en développent le font tardivement et leurs ovules ne sont pas viables. La plupart des mâles développent des testicules mais ils ne produisent pas de laitance. Journée Sélection Génétique 49 COMMUNICATION 4 : Amélioration des méthodes d'élevage de l'OMBLE CHEVALIER et mise au point d'un HYBRIDE truite fario et omble chevalier Perspectives Dans l’avenir, des recherches devront être entreprises pour identifier parmi les nombreuses populations naturelles d’omble chevalier, les souches les plus aptes à l’élevage. Il existe aussi dans les pays scandinaves et en Ecosse des souches sélectionnées pour leur croissance en élevage qui devront être comparées aux souches françaises. La mise au point de méthode d’élevage permettant de minimiser les effets négatifs engendrés par les phénomènes de dominance devrait permettre d’améliorer les performances des ombles chevaliers en élevage. L’utilisation d’anti-stress constitue l’une des pistes explorées actuellement pour lutter contre le stress chronique qui affecte les individus dominés. Il serait intéressant de réaliser des néomâles pour produire des populations monosexes femelles car seules les femelles présentent une stérilité gonadique permettant d’améliorer l’indice de carcasse des individus triploïdes ainsi que celui des hybrides issus de croisement avec le genre salmo. Les femelles étant généralement matures un an plus tard que les mâles, l’utilisation de populations monosexes femelles devrait permettre d’améliorer le bilan zootechnique jusqu’au stade portion chez les individus diploïdes. Des essais d’hybridations entre l’omble chevalier et le saumon atlantique ont été réalisés avec succès à l’étranger, il sera intéressant de tester les performances de cet hybride dans les conditions d’élevage en région alpine. Journée Sélection Génétique 50 LISTE DES SIGLES Journée Sélection Génétique 51 LISTE DES SIGLES ADAPRA Association pour le Développement de l’Aquaculture et de la Pêche en Rhône-Alpes ADN Acide désoxyribonucléique CIPA Comité Interprofessionnel des Produits de l’Aquaculture CNLC Commission Nationale des Labels et des Certifications DDAF Direction Départementale de l'Agriculture et de la Forêt DRAF Direction Régionale de l'Agriculture et de la Forêt FAO Food and Agriculture Organization FLAC Filière Lorraine d'Aquaculture Continentale IFREMER Institut Français pour la Recherche et l'Exploitation de la Mer INRA Institut National de la Recherche Agronomique ISARA Institut Supérieur d'Agriculture Rhône-Alpes ITAVI Institut Technique de l'Aviculture et de l'élevage des petits animaux LDA Laboratoire Départemental d'Analyses OFIMER Office national Interprofessionnel des produits de la Mer et de l’aquaculture OGM Organisme Génétiquement Modifié PEP Pôle d’Expérimentation et de Progrès PME Petites et Moyennes Entreprises PROSPER Procédure de Sélection individuelle optimisée par Epreuves Répétées SCEES Service Central des Enquêtes et Etudes Statistiques SEPIB Station Expérimentale Piscicole Interrégional du Blanc SEMII Station Mixte INRA-IFREMER SPSE Syndicat des Pisciculteurs du Sud-Est SREA Service Régional d'Economie Agricole SYSAAF Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français Journée Sélection Génétique 52 LISTE DES PARTICIPANTS Journée Sélection Génétique 53 LISTE DES PARTICIPANTS NOM PRÉNOM SOCIÉTÉ 1 AUBRY Etienne Pisciculture de la grande La Paquelière source 73170 St Jean-de-Chevelu 2 BEAL Mickaël Pisciculture Font-Rome BP 25 07200 St Pierre-sousAubenas 3 CADIEU Gilles Filière Aquacole Comtoise - 92 rue Turenne 90300 Valdoie 4 CESAR David SCEA PETIT Pisciculture Pont Royal 73390 Chamousse 5 CORMORECHE JeanChristophe Syndicat des Pisciculteurs du Sud-Est 25, rue Frédéric Chopin 26000 Valence 6 CURTET Marc pisciculteur-exploitant Le Bataillard 01240 St Paul de Varax 7 DALLOZ Jacky SARL Pisciculture du Moulin de Pierre 39300 Mont-sur-Monnet 8 DANNANCIER Pascal Dombes étangs Le Moulin neuf 01310 St Rémy 9 DECERIER Bernard Pisciculture du moulin 855, route des étangs 38140 Reaumont 10 DELEURME Stéphanie Maison de l'élevage Chambre d'Agriculture B.P. 59 76232 Bois-Guillaume 11 DESHAYES Cyrille CIPA 16, rue de la Grange Batelière 75009 Paris 12 DESMARTIN Maurice pisciculteur-exploitant 14, allée des Fauvettes 69740 Genas 13 FLEURET Jean-Loup Région Rhône-Alpes 78, route de Paris - 69751 B.P. 19 Charbonnières-lesBains 14 GADENNE Timothée ADAPRA 5, rue Hermann Frenkel 69364 Lyon cedex 07 15 GILLET Christian INRA Av. de Corzent 74200 Thonon les Bains 16 GOUNON Véronique Pisciculture Font-Rome BP 25 07200 St Pierre-sousAubenas 17 GRAVILLON Lionel Fédération Pêche de l'Allier Le Mouil Piat 03250 Serrieres/Sichon 18 GRIOT Pierre Ecole d' agriculture de Poisy-Chavanod 74650 Chavanod 19 GUERRAZ André TROUW 38490 Fitilieu 20 HAFFRAY Pierrick SYSAAF Station SCRIBE / Campus de INRA Beaulieu 35042 Rennes Cedex 21 JACQUEMOND François Ecole d' agriculture de Poisy-Chavanod 74200 Chavanod 22 JOUAN Yannick FLAC 57260 Lindre Basse Journée Sélection Génétique ADRESSE 1010, route de Vernay Domaine de Lindre 54 LISTE DES PARTICIPANTS NOM PRÉNOM SOCIÉTÉ 23 LANGLOIS Ingrid Pisciculture des sources de l'Archiane 24 LAURENT Emmanuel technicien aquacole 25 LAVIROTTE Gilles Ass. Pisciculteurs de Dombes 26 LIMANDAS Gilbert Chambre d'Agriculture 27 MARGERIT Paul 28 MOISSONNIER 29 ADRESSE 26410 Treschenu 69140 Vancia 01320 Chalamont 4, avenue du Champ de Foire 01000 Bourg en Bresse Pisciculture de la Fabrique 40, chemin de Robinson 26000 Valence Guy Ass. Promotion poisson de Dombes Les Roussières 01240 Saint-Paul de Varax MORAND Marc LDA JURA Bd Théodore Vernier B.P. 376 39016 Lons le Saunier Cedex 30 MOULLET Gérard Pisciculture Font-Rome 26400 Beaufort/Gervanne 31 MURGAT Laurent S.A MURGAT Beaufort 38270 Beaurepaire 32 NIVOT Patrick Chambre d'Agriculture 4 rue Carnot 01330 Villars les Dombes 33 NOUVEL Philippe DRAF Rhône-Alpes SREA Cité Administrative 69401 BP 3202 34 PAYET-PIGEON Jean Luc Syndicat Exploitants des Fieutet Etangs de Dombes 35 POLI Jean-Michel SEPIB 36 QUIBLIER Laurent Chambre d'Agriculture 37 ROMEZIN Fannie Pisciculture des sources de l'Archiane 38 ROURE JeanFrançois Pisciculture Font-Rome 39 TEPPE Jérôme GAEC Pisciculture TEPPE 731, chemin de Jouffroy 40 TROIN Bernard Syndicat des 19, rue des Manoirs 62690 Salmoniculteurs du Nord Savy-berlette 41 VALLOD Dominique ISARA 31, Place Bellecour 69002 Lyon 42 VANDEPUTTE Marc INRA Laboratoire Génétique des Poissons Domaine de Vilvert 78352 Jouy en Josas Journée Sélection Génétique 22 place des Hirondelles Lyon cedex 3 01320 St Nizier le Désert Les Ages 36300 Le Blanc 4, rue Carnot 01330 Villars les Dombes 26410 Treschenu 07200 St Pierre-sousAubenas 01310 Polliat BP 25 55 ACTIPOLE AGRICULTURE – 5, rue Hermann Frenkel 69 364 Lyon Cedex 07 Téléphone : 04 72 72 49 66 – Fax : 04 72 72 49 26