Nouveautés au laboratoire : La Biologie clinique en Belgique

BIOLOGIE CLINIQUE
ACTUALITES
ET
PERSPECTIVES D’AVENIR
Ph. Biol. Jean Darimont
Pharmalouvain – mars 2011
BIOLOGIE CLINIQUE
1. Technique
2. Organisation
3. Economique
La Biologie Clinique est impliquée
dans > 70%
du diagnostic médical et du suivi médical.
BIOLOGIE CLINIQUE
1. Technique
2. Organisation
3. Economique
BIOLOGIE CLINIQUE
TECHNIQUE
BIOMARQUEURS :
proBNP
Adam12
PlGF
…
BIOLOGIE CLINIQUE
TECHNIQUE
ELISA
(Enzyme linked immunosorbent assay)
Un ELISA en sandwich. (1) La plaque est recouverte avec un
anticorps de capture;
(2) l'échantillon est ajouté, et tout antigène présent se lie à
l'anticorps de capture;
(3) l'anticorps de détection est ajouté, et se lie à l'antigène;
(4) L'anticorps secondaire lié à l'enzyme est ajouté, et se lie à
l'anticorps de détection;
(5) Le substrat est ajouté et est converti par l'enzyme en une forme
détectable (colorée ou fluorescente).
BIOLOGIE CLINIQUE
TECHNIQUE
PCR
(Polymerase chain reaction)
Amplification cyclique d’un fragment d’ADN ou ARN
Mesure de la quantité d’acide nucléique produit par fluorescence
BIOLOGIE CLINIQUE
TECHNIQUE
PCR
Neisseria gonorrheae
Chlamydia sp
Herpes virus
BIOLOGIE CLINIQUE
TECHNIQUE
Spectrométrie de masse
MALDI-TOF
Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation Time of Flight
BIOLOGIE CLINIQUE
MALDI-TOF
INFECTION BACTERIENNE
• Recherche et mise en évidence de l’agent pathogène au site
d’infection.
• Prise en charge thérapeutique par une antibiothérapie probabiliste
adaptée ultérieurement sur base des résultats microbiologiques.
BIOLOGIE CLINIQUE
MALDI-TOF
INFECTION BACTERIENNE
Traitement précoce et adapté à la sensibilité du germe en cause
=
Diminution de la morbidité et de la mortalité
BIOLOGIE CLINIQUE
MALDI-TOF
INFECTION BACTERIENNE
• Tests d’orientation : Coloration de Gram, Tests d’agglutination
• Mise en culture :
Gélose au sang, Mac Conkey…
• Incubation :
37°C, 42°C
Air ambiant, CO2, Anaérobiose
18h, 24h, 48h…. 3 semaines
BIOLOGIE CLINIQUE
MALDI-TOF
INFECTION BACTERIENNE
• Examen et Identification secondaire
• Antibiogramme adapté
BIOLOGIE CLINIQUE
MALDI-TOF
Mesure des masses moléculaires des composants bactériens
(protéines, peptides, oligonucléotides, oligosaccharides,…) ionisés
par le laser permettant l’obtention de spectres comparés à des
spectres de référence.
BIOLOGIE CLINIQUE
MALDI-TOF
• Bactéries
… MRSA
… Bacillus anthracis
• Levures, champignons
****************
• Colonies
• Hémocultures
BIOLOGIE CLINIQUE
MALDI-TOF
• Pas de purification préalable de l’échantillon
• Nature des solvants, de la matrice
• Epaisseur et séchage du dépôt
FAST AND EASY MICROORGANISM IDENTIFICATION
MALDI Biotyper Reference Library
Data Acquisition
• Benchtop instrument
• Automated system
• Unattended Operation
Sample Preparation
• Optimized quality
• Robust
• 5 min protocol
•Ready-to-use library
•Real-Time analysis
MALDI Biotyper Data Analysis
•Automated data processing
•Signal identification
•Pattern matching
MALDI Biotyper:
MALDI-TOF MS Microorganism Identification
Acquisition of MALDI-TOF
profile spectrum
?
Identification
Selection of colony
Unknown
Microrganism
Preparation onto
MALDI target plate
1 sample in < 10 minutes, 96 samples in < 1.5 hours
Data interpretation
BIOLOGIE CLINIQUE
1. Technique
2. Organisation
3. Economique
BIOLOGIE CLINIQUE
ORGANISATION
1980s………………………….2010s
BIOLOGIE CLINIQUE
ORGANISATION
Phase pré-analytique
Phase analytique
Phase post-analytique
BIOLOGIE CLINIQUE
PHASE PRE-ANALYTIQUE
• Prélèvement
• Saisie ou Encodage de la demande d’analyses
• Contrôle de qualité du prélèvement
• Etiquettage (code-barres)
• Tri et Centrifugation
• Débouchage et Aliquotage
• Distribution
BIOLOGIE CLINIQUE
PHASE ANALYTIQUE
• Numération + formule leucocytaire
• Glycémie
• Toxoplasmose IgG
• ……………………..
BIOLOGIE CLINIQUE
PHASE POSTANALYTIQUE
• Validation technique
• Validation biologique
•Transmission des résultats
• Interprétation
ORGANISATION
1980S
• Chimie clinique (Enzymologie, Microdosages,…)
• Hématologie
• Microbiologie
• + Annexes : RIA, Toxicologie, Endocrinologie…
ORGANISATION
2010S
CORE-LAB
CORE-LAB
Plateau technique commun aux différentes disciplines de la biologie
clinique où l’on consolide tous les moyens d’analyse en termes
d’automation et intègre les différentes étapes d’analyses au niveau
d’une même zone, la mieux robotisée possible.
MPA LIÉ À 3 MODULARS ET 2 STAR
( CONFIGURATION DE LA CITADELLE)
CHR Citadelle Liège Belgique
Poste pilotage Modular
MPA Modular Pre Analytics
STAR 2
STAR 1
Coagulation auto.
Tampon
ligne de transport
UCL
IPB
PSS
ACU
DSP
BCL RSF FSS
1
FSS OBM
2 sortie racks
Tampon
sortie erreurs
Tables tri
Reboucheuse
Modulars
Aliquoteuse
Etiquetteuse
PSM TSM
IML séro
toxico RIA
IMM SNI ...
Modular <EEEE>
Poste pilotage MPA
Entrée des
échantillons
Table tri
éch. non
centrifugés
centrifugeuses
déboucheuse
AQN
Hormono séro hép Torch
Tampon
table torunante
Modular <PPPE>
Chimie prot. sp. Médicaments urine
Tampon
Modular <PPE>
Chimie prot. sp. Drogues urine
Consultance-Analyse
FLUX DES ÉCHANTILONS
Flux d’échantillons Routine
Réception
Déballage
Ettiquettage
sachet
demande
Ettiquettes
BC
Ettiquettage
tubes
Centrif.
Pré-analytqiue
Ettiquettes postes
travail 68 22 ...
Assez tubes ?
NON
Aliquottage
TRI
OUI
Demande
PostAnalytique
Analytique
secretariat
Transport
Encodage prlvt
labo
Encodage /
intégration
Chargement
Chargement
CA
7000
CD
Ranger
série et N°
Chargement
ELX
1
ELX
2
Ranger
série et N°
Chargement
Chargement
BN
AU 600
Ranger
série et N°
Ranger
série et N°
Aliquotage
RIA
RIA
Auto
Ac
Aliquotage
Séro
man
BEP
Ranger
série et N°
0
100
22:00-22:30
120
21:30-22:00
140
21:00-21:30
160
20:30-21:00
1303 tubes à centrifuger ( Max 160 tubes / 30')
20:00-20:30
19:30-20:00
19:00-19:30
18:30-19:00
18:00-18:30
17:30-18:00
17:00-17:30
16:30-17:00
16:00-16:30
15:30-16:00
15:00-15:30
14:30-15:00
14:00-14:30
13:30-14:00
13:00-13:30
12:30-13:00
12:00-12:30
11:30-12:00
11:00-11:30
10:30-11:00
10:00-10:30
09:30-10:00
09:00-9:30
180
08:30-9:00
08:00-8:30
07:30-8:00
07:00-7:30
Consultance-Analyse
Vert 50
serum 43
serum 42
serum 41
serum 40
gly 30
citrate 20
80
60
40
20
Module Sample Buffer
Ions
Chimie: c 701
Chimie : c 502
core unit
Haut volume 3 -15 millions tests par an
Immuno: e 602
MODULE PREANALYTIQUE
• Tri
•Centrifugation
• Débouchage
• Aliquotage
• Transfert (vers analyseurs)
= AUTOMATIQUES
Input sorter
Output sorte
MPA LIÉ À 3 MODULARS ET 2 STAR
( CONFIGURATION DE LA CITADELLE)
CHR Citadelle Liège Belgique
Poste pilotage Modular
MPA Modular Pre Analytics
STAR 2
STAR 1
Coagulation auto.
Tampon
ligne de transport
UCL
IPB
PSS
ACU
DSP
BCL RSF FSS
1
FSS OBM
2 sortie racks
Tampon
sortie erreurs
Tables tri
Reboucheuse
Modulars
Aliquoteuse
Etiquetteuse
PSM TSM
IML séro
toxico RIA
IMM SNI ...
Modular <EEEE>
Poste pilotage MPA
Entrée des
échantillons
Table tri
éch. non
centrifugés
centrifugeuses
déboucheuse
AQN
Hormono séro hép Torch
Tampon
table torunante
Modular <PPPE>
Chimie prot. sp. Médicaments urine
Tampon
Modular <PPE>
Chimie prot. sp. Drogues urine
Automate 3
TOTAL LAB AUTOMATION
( TLA)
1 ou 2
1 ou 2
tables
MPA STANDARD
centri
de tri
Automate 2
Automate 1
TRI tubes / aliquots postes de travail
non connectés
Archivage
Automates
• Chimie
20'
• Immuno-analyses
• Hybride Chimie + I-analyses
PRESCRIPTION CONNECTEE
• Prescription informatisée au « lit du malade »
• Impression de la demande d’analyses
• Edition des étiquettes code-barres
• Prélèvement
• Transfert (télélifts, télétubes…)
CORE-LAB
• Biologie moléculaire
• Microbiologie
• Cytométrie de flux
• Immunohématologie (Banque de sang)
• Toxicologie
• Spectrométrie de masse
• RIA
BIOLOGIE CLINIQUE
1. Technique
2. Organisation
3. Economique
BIOLOGIE CLINIQUE
ECONOMIQUE
• Biomarqueurs + + +
• Techniques + +
• Organisation + + +
BIOLOGIE CLINIQUE
ECONOMIQUE
• Biomarqueurs + + +
• Techniques + +
• Organisation + + +
• Espérance de vie + +
• Progrès de la médecine + +
BIOLOGIE CLINIQUE
ECONOMIQUE
• Couverture Sécurité sociale ? ?
• Forfaitarisation (Enveloppes budgétaires)
• Agrément et Accréditation ISO15189
BIOLOGIE CLINIQUE
ECONOMIQUE
COUT + + +
How to manage this ?
BIOLOGIE CLINIQUE
ECONOMIQUE
Belgique - Nombre Laboratoires
>700 (1980s) ……………..180 (2010s)
BIOLOGIE CLINIQUE
ECONOMIQUE
3 Mégalaboratoires pour analyses non urgentes
¾Wallonie
¾Flandre
¾Bruxelles
+ Laboratoires locaux pour analyses urgentes
+ Laboratoires étrangers
MEGALABORATOIRES
• 24h/24
• Accréditation ISO15189
• Consultation des résultats (via sites sécurisés)
• Call-centers intelligents
MEGALABORATOIRES
INCONVÉNIENTS
• Erreurs préanalytiques + +
….. Transport des échantillons (timing…)
….. Bactériologie ?
• Contact Médecin prescripteur/Laboratoire
….. Prescription + +
….. Interprétation ? (autres techniques diagnostiques)
• Dérive vers DTC (Direct To Consumer Testing)
MEGALABORATOIRES
QUALITE ?
BIOLOGIE CLINIQUE
SPÉCIALITÉ MÉDICALE
• Sites performants ( Centralisation, Automation, Collaboration
externe)
• Aide à la prescription
• Aide au diagnostic clinique
NOUVEAUX ENJEUX
DE LA FONCTION DE BIOLOGISTE CLINICIEN
• Maitrise de la Technique
• Maitrise de la Qualité
• Maitrise du Management
• Maitrise des coûts
• Hyperspécialisation ?
• Collaboration avec d’autres spécialistes ?
… chimistes, physiciens, bioingénieurs…
• Consultant actif (corps médical, patient)
MERCI POUR VOTRE ATTENTION